More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2613 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  100 
 
 
566 aa  1167    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  56.44 
 
 
567 aa  674    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  37.57 
 
 
548 aa  345  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  37.64 
 
 
546 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  34.36 
 
 
558 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  35.11 
 
 
550 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.05 
 
 
554 aa  333  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  34.01 
 
 
552 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  34.3 
 
 
550 aa  323  4e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  34.29 
 
 
549 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  37.12 
 
 
581 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  34.27 
 
 
551 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  36.59 
 
 
607 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  36.59 
 
 
607 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  36.94 
 
 
581 aa  318  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  36.59 
 
 
607 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  36.17 
 
 
581 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.77 
 
 
581 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  37.84 
 
 
560 aa  316  7e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  34.13 
 
 
562 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  33.76 
 
 
564 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  33.51 
 
 
552 aa  311  2e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  36.2 
 
 
588 aa  308  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 
564 aa  308  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.2 
 
 
562 aa  307  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  34.18 
 
 
571 aa  307  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  33.93 
 
 
563 aa  305  1.0000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  36.41 
 
 
562 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  34.35 
 
 
555 aa  304  4.0000000000000003e-81  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  35.47 
 
 
554 aa  303  8.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  35.94 
 
 
562 aa  298  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  35.94 
 
 
562 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  32.43 
 
 
552 aa  295  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  35.95 
 
 
558 aa  294  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  34.77 
 
 
597 aa  289  1e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  33.27 
 
 
553 aa  288  2.9999999999999996e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  34.35 
 
 
581 aa  286  8e-76  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.7 
 
 
564 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.6 
 
 
557 aa  280  5e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  33.2 
 
 
551 aa  274  4.0000000000000004e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  33.87 
 
 
1032 aa  273  7e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  34.49 
 
 
556 aa  273  7e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  34.38 
 
 
556 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  30.68 
 
 
1055 aa  270  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.61 
 
 
550 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  31.13 
 
 
579 aa  265  2e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  31.71 
 
 
576 aa  264  3e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  33.21 
 
 
650 aa  261  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.98 
 
 
548 aa  259  7e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.95 
 
 
548 aa  259  8e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.39 
 
 
547 aa  257  4e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  30.36 
 
 
557 aa  257  5e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  35.17 
 
 
558 aa  256  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.46 
 
 
543 aa  254  3e-66  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.46 
 
 
543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.65 
 
 
543 aa  254  4.0000000000000004e-66  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  33.4 
 
 
557 aa  253  5.000000000000001e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.45 
 
 
547 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.45 
 
 
547 aa  253  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.45 
 
 
547 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.64 
 
 
547 aa  251  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.06 
 
 
547 aa  251  3e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.6 
 
 
547 aa  251  3e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.69 
 
 
547 aa  250  6e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.69 
 
 
547 aa  250  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.88 
 
 
547 aa  249  7e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.69 
 
 
547 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  31.69 
 
 
547 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  31.69 
 
 
547 aa  249  1e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  31.69 
 
 
547 aa  249  1e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.69 
 
 
547 aa  249  1e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  30.77 
 
 
554 aa  246  6.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  31.15 
 
 
553 aa  246  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  30.57 
 
 
544 aa  242  1e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.58 
 
 
546 aa  241  2e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  33.84 
 
 
551 aa  241  2.9999999999999997e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  28.73 
 
 
542 aa  237  4e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  31.86 
 
 
555 aa  232  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  28.24 
 
 
541 aa  229  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.28 
 
 
557 aa  220  7e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  29.94 
 
 
544 aa  204  4e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  27.62 
 
 
514 aa  179  8e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  26.45 
 
 
549 aa  177  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.29 
 
 
582 aa  125  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.86 
 
 
597 aa  123  9e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  24.51 
 
 
587 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  26.67 
 
 
605 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2077  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25 
 
 
597 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0851764  normal  0.0377374 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  25.39 
 
 
582 aa  117  5e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  23.72 
 
 
582 aa  117  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  24.67 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.67 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.67 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.67 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  24.67 
 
 
582 aa  116  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>