More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_5068 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_5068  cyclic peptide transporter  100 
 
 
546 aa  1105    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0505  cyclic peptide transporter  48.55 
 
 
548 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26810  pyoverdine synthetase E, pdvE  41.92 
 
 
553 aa  432  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1823  cyclic peptide transporter  40.98 
 
 
555 aa  426  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774131  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1307  cyclic peptide transporter  43.33 
 
 
560 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1614  cyclic peptide transporter  42.31 
 
 
607 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.170963  normal  0.0520134 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1557  cyclic peptide transporter  41.79 
 
 
581 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.931443  normal  0.535209 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4785  ABC cyclic peptide/siderophore export pump, fused ATPase and inner membrane subunits  41.61 
 
 
581 aa  413  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257895  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1159  cyclic peptide transporter  42.31 
 
 
607 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.216015  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1639  cyclic peptide transporter  42.31 
 
 
607 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0715869  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4071  cyclic peptide transporter  41.8 
 
 
588 aa  409  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.324358 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2419  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.44 
 
 
562 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.232259  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1536  cyclic peptide transporter  41.76 
 
 
581 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0345189  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1599  cyclic peptide transporter  40.59 
 
 
581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.181378  hitchhiker  0.00126952 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0524  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  41.11 
 
 
562 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1183  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.141269  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2085  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1940  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0387498  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0872  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0361195  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1626  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.667512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0289  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.243685  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1926  cyclic peptide ABC transporter, ATP-binding protein MbaE  42.22 
 
 
562 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0312938  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2788  cyclic peptide transporter  42.03 
 
 
581 aa  400  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.441384  normal  0.126304 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2327  cyclic peptide transporter  40.62 
 
 
579 aa  398  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0354402  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4216  cyclic peptide transporter  38.12 
 
 
552 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2153  pyoverdine ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.38 
 
 
554 aa  369  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.105223  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3540  cyclic peptide transporter  37.71 
 
 
551 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.495743  normal  0.985666 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2862  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  38.69 
 
 
550 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.519418  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1850  cyclic peptide transporter  37.8 
 
 
552 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4040  cyclic peptide transporter  40.93 
 
 
597 aa  361  2e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1963  cyclic peptide transporter  35.75 
 
 
558 aa  360  3e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.787784  normal  0.816592 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3724  cyclic peptide transporter  37.08 
 
 
564 aa  359  9e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.411426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33690  pyoverdine biosynthesis protein PvdE  38.69 
 
 
549 aa  354  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00697095  hitchhiker  0.00612682 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6469  cyclic peptide transporter  36.48 
 
 
567 aa  352  7e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1091  pyoverdine ABC transporter permease/ATP-binding protein  39.22 
 
 
564 aa  352  1e-95  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.737034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1681  cyclic peptide transporter  36.18 
 
 
562 aa  346  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1928  ABC cyclic peptide efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.81 
 
 
564 aa  344  2e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00990563  normal  0.428537 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2613  cyclic peptide transporter  37.64 
 
 
566 aa  342  1e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.104435  normal  0.36301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4089  cyclic peptide transporter  36.06 
 
 
550 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0319097  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1501  cyclic peptide transporter  36.72 
 
 
557 aa  339  7e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3736  cyclic peptide transporter  36.43 
 
 
563 aa  339  9e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1039  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.79 
 
 
557 aa  336  5.999999999999999e-91  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1007  cyclic peptide transporter  35.62 
 
 
551 aa  333  5e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1531  cyclic peptide transporter  39.23 
 
 
554 aa  332  1e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.229527  normal  0.420973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4746  cyclic peptide transporter  38.16 
 
 
571 aa  330  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.235902 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1783  cyclic peptide transporter  35.95 
 
 
1055 aa  324  3e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0903267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2925  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.36 
 
 
553 aa  322  9.000000000000001e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1675  cyclic peptide transporter  35.55 
 
 
551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2503  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.42 
 
 
547 aa  320  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.45068  hitchhiker  0.000119936 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2791  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.24 
 
 
547 aa  319  7e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.46753  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2399  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.21 
 
 
547 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2489  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.21 
 
 
547 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2606  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.21 
 
 
547 aa  318  2e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.421304  normal  0.757942 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2447  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.21 
 
 
547 aa  317  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.392835 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2872  cyclic peptide transporter  38.34 
 
 
558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.27305 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1497  cyclic peptide transporter  38.18 
 
 
557 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.353256  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1439  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.73 
 
 
547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.216906 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0729  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.61 
 
 
547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.723573  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2510  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.73 
 
 
547 aa  313  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.121773  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2571  cyclic peptide transporter  33.58 
 
 
552 aa  313  4.999999999999999e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0512743  normal  0.0935023 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02138  fused predicted multidrug transport subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.54 
 
 
547 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1447  cyclic peptide transporter  35.54 
 
 
547 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.638888  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2350  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.54 
 
 
547 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02097  hypothetical protein  35.54 
 
 
547 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3852  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.65 
 
 
550 aa  312  1e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.604854  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2360  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.36 
 
 
547 aa  311  2.9999999999999997e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3349  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  35.36 
 
 
547 aa  310  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.271374  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3315  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  36.54 
 
 
548 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0995  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  37.58 
 
 
548 aa  306  6e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.64415  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2333  cyclic peptide transporter  34.85 
 
 
650 aa  306  6e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2389  cyclic peptide transporter  35 
 
 
1032 aa  304  3.0000000000000004e-81  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1956  cyclic peptide transporter  33.09 
 
 
544 aa  300  6e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.154959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3313  cyclic peptide transporter  37.8 
 
 
558 aa  293  7e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.473343  normal  0.840311 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3060  cyclic peptide transporter  33.67 
 
 
576 aa  293  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.640427  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3437  cyclic peptide transporter  37.55 
 
 
556 aa  290  6e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3118  cyclic peptide transporter  36.48 
 
 
556 aa  288  2e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.150881  normal  0.779975 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1758  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.4 
 
 
543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1938  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.2 
 
 
543 aa  275  1.0000000000000001e-72  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1575  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  33.4 
 
 
543 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1655  ABC transporter ATP-binding protein YojI  31.3 
 
 
544 aa  262  1e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1530  ABC transporter ATP-binding protein YojI  32.34 
 
 
546 aa  262  1e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1528  multidrug transporter membrane component/ATP-binding component  32.01 
 
 
542 aa  258  2e-67  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3420  cyclic peptide transporter  28.05 
 
 
554 aa  254  3e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00388229  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3708  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.84 
 
 
557 aa  254  3e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.835875  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03729  ABC transporter ATP-binding protein  32.39 
 
 
555 aa  251  3e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.525568  normal  0.456711 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2101  cyclic peptide transporter  29.26 
 
 
541 aa  226  8e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1757  ABC transporter ATP-binding protein YojI  30.74 
 
 
514 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5194  ABC transporter related  25.23 
 
 
549 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.202589  normal  0.0685542 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2142  ABC transporter related  35.92 
 
 
305 aa  108  2e-22  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.59 
 
 
1091 aa  108  3e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5528  ABC transporter related protein  25.62 
 
 
614 aa  106  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.3 
 
 
555 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2782  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  24.84 
 
 
596 aa  105  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0170515  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  24.16 
 
 
579 aa  105  2e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  26.51 
 
 
582 aa  105  3e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.51 
 
 
589 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6494  type I secretion system ATPase  28.46 
 
 
721 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  23.17 
 
 
576 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1566  toxin secretion ABC transporter ATP-binding protein  30.12 
 
 
720 aa  104  4e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.206767  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  31.88 
 
 
228 aa  104  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>