More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2511 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 555 aa  1114    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  36.76 
 
 		 585 aa  352  7e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  36.3 
 
 		 592 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  32.36 
 
 		 579 aa  319  9e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  35.63 
 
 		 576 aa  299  9e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.33 
 
 		 608 aa  288  1e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.85 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.44 
 
 		 588 aa  287  2.9999999999999996e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.34 
 
 		 575 aa  286  8e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  32.26 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.29 
 
 		 578 aa  283  6.000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.16 
 
 		 579 aa  283  6.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 552 aa  281  2e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  31.17 
 
 		 1179 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.17 
 
 		 1179 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  31.14 
 
 		 1179 aa  276  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  34.69 
 
 		 578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  34.69 
 
 		 578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.5 
 
 		 598 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  30.78 
 
 		 619 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.4 
 
 		 562 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.21 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  35.78 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  31.73 
 
 		 566 aa  273  8.000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.53 
 
 		 556 aa  273  8.000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.4 
 
 		 562 aa  272  1e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.33 
 
 		 579 aa  272  1e-71  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.63 
 
 		 1179 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.91 
 
 		 639 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.16 
 
 		 600 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  30.76 
 
 		 596 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.75 
 
 		 641 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  37.64 
 
 		 566 aa  268  2e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5540  ABC transporter related protein  30.84 
 
 		 601 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.27279 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  33.6 
 
 		 611 aa  268  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  32.28 
 
 		 611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.47 
 
 		 596 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0989  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.19 
 
 		 634 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.62 
 
 		 597 aa  266  5e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.65 
 
 		 588 aa  266  5.999999999999999e-70  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  32.53 
 
 		 1205 aa  266  5.999999999999999e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.56 
 
 		 1201 aa  266  7e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  29.96 
 
 		 993 aa  266  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  33.2 
 
 		 611 aa  265  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.25 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  33.45 
 
 		 609 aa  265  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.46 
 
 		 573 aa  264  2e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  31.59 
 
 		 600 aa  264  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.18 
 
 		 577 aa  264  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  34.92 
 
 		 580 aa  263  6e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  33.73 
 
 		 614 aa  263  6.999999999999999e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0797  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.55 
 
 		 632 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.732522 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.2 
 
 		 611 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.73 
 
 		 582 aa  261  2e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.67 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.15 
 
 		 584 aa  261  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 		 627 aa  261  3e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.16 
 
 		 609 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  30.16 
 
 		 595 aa  260  5.0000000000000005e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.08 
 
 		 611 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  32.83 
 
 		 608 aa  260  6e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  38.71 
 
 		 468 aa  260  6e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.16 
 
 		 591 aa  259  7e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 		 552 aa  259  9e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  33.41 
 
 		 550 aa  259  1e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  29.93 
 
 		 552 aa  259  1e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.71 
 
 		 580 aa  259  1e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.87 
 
 		 582 aa  258  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.44 
 
 		 586 aa  258  2e-67  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  31.76 
 
 		 580 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.37 
 
 		 618 aa  257  3e-67  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  34.39 
 
 		 599 aa  257  4e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.65 
 
 		 574 aa  257  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  32.28 
 
 		 611 aa  257  4e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  32.6 
 
 		 614 aa  257  5e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 582 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  32.05 
 
 		 575 aa  256  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 582 aa  256  7e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 582 aa  256  7e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  29.25 
 
 		 591 aa  256  8e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2662  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.83 
 
 		 597 aa  256  8e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  32.45 
 
 		 589 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  32.98 
 
 		 600 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  30.2 
 
 		 582 aa  255  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  34.39 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  46.04 
 
 		 578 aa  254  3e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  30.89 
 
 		 636 aa  254  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.96 
 
 		 580 aa  254  4.0000000000000004e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  29.75 
 
 		 582 aa  254  4.0000000000000004e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  31.15 
 
 		 596 aa  253  5.000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2245  ABC transporter, transmembrane region  32.68 
 
 		 619 aa  253  6e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.20584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  33.73 
 
 		 601 aa  253  8.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  30.35 
 
 		 625 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.89 
 
 		 571 aa  253  9.000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  30.89 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  32.16 
 
 		 575 aa  252  1e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.38 
 
 		 616 aa  252  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2069  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  30.89 
 
 		 597 aa  252  1e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.89 
 
 		 571 aa  252  1e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>