More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0189 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  100 
 
 
576 aa  1159    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  53.7 
 
 
579 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  37.98 
 
 
594 aa  367  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  38.87 
 
 
585 aa  353  5e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  39.22 
 
 
592 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  38.23 
 
 
1179 aa  349  9e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  38.72 
 
 
1179 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  38.72 
 
 
1179 aa  347  3e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.35 
 
 
1179 aa  346  7e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  37.7 
 
 
1201 aa  340  4e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.11 
 
 
575 aa  336  7.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.65 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.52 
 
 
602 aa  303  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  35.96 
 
 
609 aa  303  6.000000000000001e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.24 
 
 
586 aa  301  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  35.51 
 
 
596 aa  300  5e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.21 
 
 
573 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.79 
 
 
555 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.86 
 
 
573 aa  296  5e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.59 
 
 
596 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.95 
 
 
593 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.69 
 
 
556 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  35.25 
 
 
613 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33.86 
 
 
591 aa  283  8.000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6942  ABC transporter ATP-binding protein  34.99 
 
 
619 aa  283  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.676963 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.93 
 
 
611 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
623 aa  282  1e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  36.2 
 
 
597 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.13 
 
 
598 aa  281  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.65 
 
 
579 aa  280  3e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.15 
 
 
584 aa  280  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  32.06 
 
 
579 aa  277  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.1 
 
 
580 aa  277  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.72 
 
 
572 aa  278  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  33.21 
 
 
595 aa  278  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  31.28 
 
 
566 aa  277  5e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  34.97 
 
 
600 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.76 
 
 
578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.76 
 
 
578 aa  275  1.0000000000000001e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.21 
 
 
578 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  31.28 
 
 
566 aa  274  3e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.58 
 
 
576 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.07 
 
 
598 aa  273  6e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.59 
 
 
593 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.91 
 
 
582 aa  272  1e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.67 
 
 
592 aa  272  1e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.17 
 
 
571 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  31.67 
 
 
625 aa  271  2e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.54 
 
 
571 aa  271  2e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2746  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
627 aa  271  2.9999999999999997e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0546982 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  34.2 
 
 
578 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  34.08 
 
 
600 aa  270  4e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  32.89 
 
 
597 aa  270  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.33 
 
 
574 aa  270  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.72 
 
 
571 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  34.03 
 
 
580 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.15 
 
 
565 aa  269  8e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.93 
 
 
572 aa  269  8e-71  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.64 
 
 
582 aa  269  8.999999999999999e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.95 
 
 
584 aa  269  1e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  32.41 
 
 
610 aa  269  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.19 
 
 
641 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  33.88 
 
 
1205 aa  268  1e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  30.43 
 
 
608 aa  269  1e-70  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.01 
 
 
552 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  34.87 
 
 
572 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.28 
 
 
586 aa  268  2e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  33.99 
 
 
598 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  30.77 
 
 
596 aa  268  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 
586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.27 
 
 
562 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.18 
 
 
571 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.18 
 
 
571 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.09 
 
 
589 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
562 aa  266  5.999999999999999e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
571 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.18 
 
 
571 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
571 aa  266  7e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
571 aa  266  1e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2153  ABC transporter ATP-binding protein  33.87 
 
 
586 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  34.17 
 
 
726 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.18 
 
 
571 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0853  ABC transporter-related protein  38.89 
 
 
591 aa  265  2e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0413616  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1715  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.1 
 
 
599 aa  265  2e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.6745  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  34.31 
 
 
764 aa  265  2e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.58 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  31.84 
 
 
604 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  32.5 
 
 
638 aa  264  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.78 
 
 
573 aa  264  3e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.77 
 
 
574 aa  264  3e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  33.55 
 
 
593 aa  263  4e-69  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  30.89 
 
 
575 aa  264  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  34.67 
 
 
618 aa  263  4e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1657  ABC transporter, ATP binding/permease protein  35.1 
 
 
681 aa  264  4e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  32.89 
 
 
594 aa  263  4.999999999999999e-69  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  33.9 
 
 
582 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  33.94 
 
 
587 aa  263  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.98 
 
 
600 aa  263  6.999999999999999e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.94 
 
 
597 aa  263  6.999999999999999e-69  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.48 
 
 
618 aa  263  6.999999999999999e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>