More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0863 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 565 aa  1113    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  48.17 
 
 		 585 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  38.42 
 
 		 576 aa  372  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  36.67 
 
 		 581 aa  334  2e-90  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.58 
 
 		 579 aa  332  8e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  39.57 
 
 		 581 aa  330  6e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  36.42 
 
 		 581 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  35.69 
 
 		 583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  33.86 
 
 		 579 aa  318  2e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.39 
 
 		 607 aa  315  9.999999999999999e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.52 
 
 		 581 aa  313  4.999999999999999e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.34 
 
 		 584 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.19 
 
 		 1228 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.51 
 
 		 577 aa  302  8.000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.75 
 
 		 588 aa  302  9e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  40.28 
 
 		 606 aa  302  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.87 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.69 
 
 		 574 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.22 
 
 		 581 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.62 
 
 		 596 aa  301  2e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.87 
 
 		 577 aa  301  2e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  38.78 
 
 		 593 aa  301  3e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.17 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.56 
 
 		 618 aa  298  2e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  38.09 
 
 		 598 aa  298  2e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.46 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.46 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  40.08 
 
 		 593 aa  296  6e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.21 
 
 		 611 aa  296  6e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.95 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.92 
 
 		 585 aa  296  7e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.1 
 
 		 580 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.68 
 
 		 585 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 		 574 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.9 
 
 		 611 aa  293  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.94 
 
 		 589 aa  293  8e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.64 
 
 		 602 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.84 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.46 
 
 		 573 aa  290  3e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.74 
 
 		 587 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.36 
 
 		 593 aa  290  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.17 
 
 		 604 aa  289  8e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.78 
 
 		 578 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.76 
 
 		 595 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.32 
 
 		 619 aa  287  4e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.08 
 
 		 577 aa  287  4e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  36.56 
 
 		 588 aa  286  5.999999999999999e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  37.28 
 
 		 611 aa  286  8e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  38.59 
 
 		 582 aa  286  9e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.71 
 
 		 618 aa  286  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  37.04 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.18 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.5 
 
 		 600 aa  283  6.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.93 
 
 		 568 aa  282  1e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.6 
 
 		 597 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.35 
 
 		 576 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  33.21 
 
 		 576 aa  281  3e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.74 
 
 		 603 aa  280  4e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.63 
 
 		 579 aa  280  7e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.45 
 
 		 581 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.84 
 
 		 593 aa  279  9e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  31.77 
 
 		 596 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.31 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 599 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.4 
 
 		 592 aa  277  4e-73  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.92 
 
 		 574 aa  276  8e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.94 
 
 		 590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  36.78 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.77 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.92 
 
 		 583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.43 
 
 		 575 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  35.48 
 
 		 640 aa  273  6e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.66 
 
 		 572 aa  273  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  34.49 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  39.07 
 
 		 582 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  34.24 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  31.85 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.96 
 
 		 1194 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.57 
 
 		 1091 aa  269  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.4 
 
 		 588 aa  269  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  38.72 
 
 		 619 aa  269  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.27 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  36.79 
 
 		 600 aa  269  1e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.15 
 
 		 591 aa  268  2e-70  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  35.34 
 
 		 677 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.42 
 
 		 595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.02 
 
 		 577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.66 
 
 		 581 aa  267  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0757  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.77 
 
 		 594 aa  266  5.999999999999999e-70  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00726386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.04 
 
 		 579 aa  266  7e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.03 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.03 
 
 		 578 aa  265  1e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.31 
 
 		 603 aa  265  1e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  30.17 
 
 		 601 aa  265  1e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  33 
 
 		 612 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  33.05 
 
 		 585 aa  265  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.66 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  31.59 
 
 		 596 aa  265  2e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.53 
 
 		 606 aa  265  2e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>