More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0188 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 576 aa  1155    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  45.28 
 
 		 581 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  42.31 
 
 		 581 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.24 
 
 		 581 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 579 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.42 
 
 		 565 aa  362  1e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.65 
 
 		 579 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  37.99 
 
 		 593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.98 
 
 		 596 aa  357  3.9999999999999996e-97  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.53 
 
 		 588 aa  354  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.01 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  38.03 
 
 		 611 aa  350  5e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.54 
 
 		 581 aa  346  5e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.32 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.32 
 
 		 577 aa  345  1e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.18 
 
 		 587 aa  345  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.68 
 
 		 589 aa  343  4e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.48 
 
 		 1228 aa  343  7e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  38.41 
 
 		 588 aa  342  1e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.1 
 
 		 577 aa  342  2e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.58 
 
 		 593 aa  340  5.9999999999999996e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.92 
 
 		 578 aa  339  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  38.77 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  35.41 
 
 		 585 aa  335  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  43 
 
 		 593 aa  334  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.68 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  41.68 
 
 		 581 aa  333  4e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  40.7 
 
 		 579 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.23 
 
 		 585 aa  333  5e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.28 
 
 		 592 aa  333  6e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.99 
 
 		 618 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.51 
 
 		 604 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  38.23 
 
 		 574 aa  329  7e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.89 
 
 		 597 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  35.35 
 
 		 609 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  39.17 
 
 		 579 aa  326  7e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.53 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.53 
 
 		 587 aa  325  1e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.91 
 
 		 603 aa  324  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.04 
 
 		 580 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.87 
 
 		 579 aa  323  4e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  35.73 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  35.73 
 
 		 578 aa  323  5e-87  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.01 
 
 		 593 aa  323  6e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.09 
 
 		 584 aa  323  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  39.68 
 
 		 585 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 		 597 aa  320  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.78 
 
 		 595 aa  320  6e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.31 
 
 		 583 aa  319  9e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.93 
 
 		 619 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.66 
 
 		 602 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.59 
 
 		 577 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.05 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.74 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.71 
 
 		 592 aa  318  2e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  36.54 
 
 		 581 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  33.81 
 
 		 598 aa  317  5e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.68 
 
 		 575 aa  314  1.9999999999999998e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.51 
 
 		 577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  34.15 
 
 		 574 aa  313  3.9999999999999997e-84  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.9 
 
 		 606 aa  313  5.999999999999999e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  40.85 
 
 		 577 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.86 
 
 		 611 aa  313  7.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 		 595 aa  312  9e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.63 
 
 		 574 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  36.69 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.14 
 
 		 618 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  38.98 
 
 		 578 aa  311  2e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  40.04 
 
 		 605 aa  311  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 588 aa  309  8e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.76 
 
 		 599 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  35.66 
 
 		 581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  40.58 
 
 		 1138 aa  306  5.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  34.21 
 
 		 600 aa  306  5.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35 
 
 		 572 aa  306  6e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.53 
 
 		 568 aa  306  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.23 
 
 		 573 aa  306  9.000000000000001e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  37.58 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1330  ABC transporter related  37.76 
 
 		 571 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.987639  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.57 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.92 
 
 		 582 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  35.5 
 
 		 608 aa  303  6.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.24 
 
 		 581 aa  303  8.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.37 
 
 		 593 aa  302  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.45 
 
 		 580 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  38.66 
 
 		 598 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  36.29 
 
 		 582 aa  300  5e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 571 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.95 
 
 		 583 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.43 
 
 		 578 aa  296  8e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.68 
 
 		 599 aa  296  9e-79  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  38.99 
 
 		 595 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  36.66 
 
 		 603 aa  294  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.22 
 
 		 1091 aa  293  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  37.82 
 
 		 577 aa  290  6e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  37.71 
 
 		 582 aa  289  8e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  39.01 
 
 		 579 aa  289  9e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.85 
 
 		 576 aa  287  4e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.22 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 590 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>