More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4444 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  100 
 
 		 577 aa  1140    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  49.74 
 
 		 596 aa  469  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  45.93 
 
 		 581 aa  419  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  45.86 
 
 		 582 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  42.1 
 
 		 575 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  40.66 
 
 		 579 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 571 aa  375  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  42.83 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  39.89 
 
 		 577 aa  364  3e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 		 600 aa  337  2.9999999999999997e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  41.62 
 
 		 578 aa  333  3e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.26 
 
 		 581 aa  323  6e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  39.08 
 
 		 607 aa  317  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.37 
 
 		 584 aa  317  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.82 
 
 		 576 aa  306  9.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.12 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.05 
 
 		 601 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.35 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  39.68 
 
 		 579 aa  296  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  34.97 
 
 		 591 aa  290  5.0000000000000004e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.35 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.25 
 
 		 588 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.5 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.5 
 
 		 579 aa  281  2e-74  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  30.56 
 
 		 588 aa  280  5e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.36 
 
 		 568 aa  280  6e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.67 
 
 		 578 aa  279  9e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.46 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.13 
 
 		 574 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.26 
 
 		 611 aa  276  9e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.84 
 
 		 579 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  28.89 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  28.89 
 
 		 577 aa  273  7e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.22 
 
 		 593 aa  272  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.01 
 
 		 577 aa  270  4e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.15 
 
 		 579 aa  269  8.999999999999999e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.61 
 
 		 590 aa  269  1e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.16 
 
 		 577 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  35.14 
 
 		 579 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  31.09 
 
 		 592 aa  267  4e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.85 
 
 		 592 aa  267  4e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.55 
 
 		 593 aa  267  5e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.38 
 
 		 595 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  36.86 
 
 		 634 aa  266  8.999999999999999e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.69 
 
 		 587 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.57 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.57 
 
 		 587 aa  261  3e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.16 
 
 		 580 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.62 
 
 		 589 aa  259  1e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.33 
 
 		 577 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.15 
 
 		 1091 aa  258  2e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 		 618 aa  256  9e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.39 
 
 		 583 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.16 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.16 
 
 		 578 aa  256  1.0000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  31.15 
 
 		 574 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 		 603 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.41 
 
 		 581 aa  254  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  31.16 
 
 		 612 aa  253  6e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  34.51 
 
 		 598 aa  253  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.35 
 
 		 581 aa  253  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.58 
 
 		 1138 aa  252  1e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.18 
 
 		 1228 aa  252  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35 
 
 		 600 aa  251  2e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 612 aa  251  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.03 
 
 		 581 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  29.06 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.06 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.39 
 
 		 605 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.87 
 
 		 584 aa  248  3e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.11 
 
 		 565 aa  248  3e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  31.95 
 
 		 608 aa  247  4e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.91 
 
 		 598 aa  247  4e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  53.25 
 
 		 582 aa  247  4.9999999999999997e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  34.45 
 
 		 605 aa  246  6e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.34 
 
 		 576 aa  246  6.999999999999999e-64  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  31.44 
 
 		 604 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  35.77 
 
 		 581 aa  244  3e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.73 
 
 		 578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.46 
 
 		 618 aa  243  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  28.94 
 
 		 593 aa  243  5e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.9 
 
 		 600 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.36 
 
 		 627 aa  243  7.999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.53 
 
 		 573 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.22 
 
 		 597 aa  242  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  30.4 
 
 		 602 aa  241  2e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.56 
 
 		 597 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  31.13 
 
 		 727 aa  241  2.9999999999999997e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.67 
 
 		 581 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.68 
 
 		 1194 aa  241  4e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  39.39 
 
 		 585 aa  240  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.92 
 
 		 585 aa  240  5.999999999999999e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  34.04 
 
 		 608 aa  240  5.999999999999999e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.13 
 
 		 593 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.01 
 
 		 606 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  31.14 
 
 		 583 aa  239  1e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.99 
 
 		 574 aa  238  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.23 
 
 		 581 aa  238  3e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>