More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2100 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  60.38 
 
 
608 aa  657    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  100 
 
 
600 aa  1213    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  55.75 
 
 
600 aa  620  1e-176  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
590 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  59.11 
 
 
597 aa  514  1e-144  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  37.34 
 
 
592 aa  360  4e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  38.98 
 
 
611 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.66 
 
 
604 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.54 
 
 
573 aa  345  1e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  39.07 
 
 
593 aa  339  9e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.31 
 
 
618 aa  337  5e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.95 
 
 
597 aa  334  4e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.86 
 
 
584 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.55 
 
 
1091 aa  326  9e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
627 aa  324  3e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.86 
 
 
587 aa  320  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.86 
 
 
587 aa  320  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.92 
 
 
576 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.7 
 
 
598 aa  318  3e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.43 
 
 
611 aa  317  5e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 
597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  37.24 
 
 
677 aa  315  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.62 
 
 
618 aa  313  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  37.71 
 
 
1228 aa  312  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.69 
 
 
602 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.8 
 
 
606 aa  308  1.0000000000000001e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.85 
 
 
619 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.06 
 
 
599 aa  306  6e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  37.05 
 
 
595 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.05 
 
 
609 aa  304  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.18 
 
 
578 aa  299  8e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.21 
 
 
589 aa  299  8e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.44 
 
 
596 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.07 
 
 
580 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  30.36 
 
 
579 aa  298  2e-79  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.57 
 
 
593 aa  297  3e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30.11 
 
 
579 aa  298  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  36.26 
 
 
603 aa  293  6e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.12 
 
 
581 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 
583 aa  290  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.78 
 
 
593 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.47 
 
 
576 aa  288  1e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 
590 aa  289  1e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.5 
 
 
596 aa  288  2e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.1 
 
 
577 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.83 
 
 
590 aa  286  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  31.47 
 
 
581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.74 
 
 
580 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.64 
 
 
583 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.67 
 
 
609 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  36.06 
 
 
603 aa  280  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.64 
 
 
596 aa  279  8e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.84 
 
 
577 aa  279  9e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
600 aa  279  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.13 
 
 
588 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.22 
 
 
581 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  29.67 
 
 
577 aa  277  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.79 
 
 
592 aa  277  4e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  29.67 
 
 
577 aa  277  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.73 
 
 
1194 aa  276  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  33.86 
 
 
624 aa  276  9e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.92 
 
 
578 aa  276  9e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  29.77 
 
 
573 aa  276  9e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  36.62 
 
 
596 aa  275  1.0000000000000001e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  30.18 
 
 
573 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.1 
 
 
579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.8 
 
 
579 aa  274  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.48 
 
 
577 aa  274  4.0000000000000004e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  38.16 
 
 
598 aa  273  8.000000000000001e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.7 
 
 
581 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.78 
 
 
587 aa  273  9e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.83 
 
 
588 aa  272  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.18 
 
 
597 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.33 
 
 
859 aa  270  7e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  30.91 
 
 
605 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  35.26 
 
 
596 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.71 
 
 
605 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  35.66 
 
 
611 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
619 aa  267  4e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
606 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  32.07 
 
 
608 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  30.25 
 
 
597 aa  266  5.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.05 
 
 
579 aa  266  7e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.6 
 
 
599 aa  266  7e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.75 
 
 
595 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.06 
 
 
585 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.98 
 
 
612 aa  266  1e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.82 
 
 
571 aa  265  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  35.82 
 
 
611 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  33.97 
 
 
574 aa  264  4e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  35.31 
 
 
591 aa  263  4.999999999999999e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.59 
 
 
577 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.76 
 
 
585 aa  262  1e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  35.52 
 
 
595 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  32.94 
 
 
644 aa  261  3e-68  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  36.19 
 
 
1138 aa  260  5.0000000000000005e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  34.91 
 
 
593 aa  260  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  33 
 
 
611 aa  259  9e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.63 
 
 
611 aa  259  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>