More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4419 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 		 581 aa  1147    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  58.55 
 
 		 601 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  44.18 
 
 		 596 aa  405  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  42.34 
 
 		 582 aa  405  1e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  41.03 
 
 		 579 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  44.53 
 
 		 581 aa  378  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  39.79 
 
 		 582 aa  374  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  41.58 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  41.11 
 
 		 575 aa  350  4e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  39.54 
 
 		 571 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  38.48 
 
 		 577 aa  330  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  37.75 
 
 		 584 aa  315  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  35.7 
 
 		 579 aa  303  7.000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.16 
 
 		 588 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.32 
 
 		 611 aa  295  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.83 
 
 		 576 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.75 
 
 		 578 aa  290  6e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.28 
 
 		 581 aa  287  2.9999999999999996e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.73 
 
 		 607 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.08 
 
 		 600 aa  283  5.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  36 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.28 
 
 		 600 aa  282  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.39 
 
 		 584 aa  282  2e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.42 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  33.62 
 
 		 587 aa  280  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.6 
 
 		 581 aa  280  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 		 579 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  39.37 
 
 		 595 aa  276  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.76 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.7 
 
 		 579 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.83 
 
 		 581 aa  274  3e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.61 
 
 		 592 aa  273  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.83 
 
 		 574 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.81 
 
 		 577 aa  272  1e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.82 
 
 		 577 aa  272  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.9 
 
 		 579 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.15 
 
 		 573 aa  270  4e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.21 
 
 		 612 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  33.66 
 
 		 604 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.79 
 
 		 589 aa  267  4e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.57 
 
 		 618 aa  266  7e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.68 
 
 		 581 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.14 
 
 		 568 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  28.05 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  34.42 
 
 		 624 aa  265  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.93 
 
 		 611 aa  265  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  28.05 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  36.68 
 
 		 606 aa  264  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  42.31 
 
 		 1228 aa  264  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  38.1 
 
 		 577 aa  263  6e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  36.7 
 
 		 601 aa  263  6.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33 
 
 		 577 aa  263  8.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.96 
 
 		 578 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  32.42 
 
 		 584 aa  263  8.999999999999999e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.96 
 
 		 578 aa  263  8.999999999999999e-69  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.64 
 
 		 579 aa  261  3e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.78 
 
 		 577 aa  261  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.74 
 
 		 590 aa  261  3e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.42 
 
 		 578 aa  260  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.22 
 
 		 579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.73 
 
 		 608 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  34.2 
 
 		 571 aa  260  6e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.7 
 
 		 582 aa  259  8e-68  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  35.81 
 
 		 578 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.27 
 
 		 619 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.6 
 
 		 584 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.25 
 
 		 592 aa  258  2e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.67 
 
 		 593 aa  258  2e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.16 
 
 		 582 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.02 
 
 		 595 aa  258  3e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.76 
 
 		 596 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  31.05 
 
 		 585 aa  257  4e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.85 
 
 		 585 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  35.19 
 
 		 598 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  31.71 
 
 		 581 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.53 
 
 		 572 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  33.45 
 
 		 582 aa  254  3e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  35.28 
 
 		 598 aa  254  3e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  31.72 
 
 		 579 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  37.35 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  37.35 
 
 		 588 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  33.74 
 
 		 592 aa  254  5.000000000000001e-66  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  33.99 
 
 		 575 aa  253  6e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.55 
 
 		 578 aa  253  6e-66  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  38.88 
 
 		 581 aa  253  7e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 588 aa  253  7e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.98 
 
 		 585 aa  253  9.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  36.46 
 
 		 593 aa  253  9.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  35.82 
 
 		 658 aa  252  1e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.85 
 
 		 608 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  35.4 
 
 		 606 aa  252  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.24 
 
 		 578 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 575 aa  251  2e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.24 
 
 		 578 aa  251  2e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.77 
 
 		 580 aa  251  3e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  32.52 
 
 		 572 aa  251  4e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  30.71 
 
 		 573 aa  250  6e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5293  ABC transporter related  41.16 
 
 		 587 aa  249  7e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.159321 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  28.28 
 
 		 573 aa  249  7e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  36.86 
 
 		 635 aa  249  8e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>