More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2595 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 601 aa  1190    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  58.55 
 
 		 581 aa  629  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  41.1 
 
 		 582 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  41.3 
 
 		 596 aa  359  8e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  40.34 
 
 		 579 aa  350  6e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  39.62 
 
 		 582 aa  349  9e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  40.65 
 
 		 577 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  38.6 
 
 		 575 aa  325  2e-87  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  34.94 
 
 		 577 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 571 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  34.45 
 
 		 584 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 578 aa  295  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.96 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.21 
 
 		 592 aa  266  5e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.17 
 
 		 576 aa  266  5.999999999999999e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.98 
 
 		 573 aa  265  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.39 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.42 
 
 		 607 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  31.44 
 
 		 604 aa  257  5e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  32.77 
 
 		 600 aa  256  1.0000000000000001e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.03 
 
 		 587 aa  256  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  34.68 
 
 		 579 aa  254  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  29.29 
 
 		 579 aa  249  9e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32.73 
 
 		 579 aa  246  6.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.54 
 
 		 568 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.23 
 
 		 577 aa  244  3.9999999999999997e-63  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.51 
 
 		 611 aa  243  7e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  34.33 
 
 		 598 aa  242  1e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  30.34 
 
 		 597 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  29.84 
 
 		 577 aa  242  2e-62  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02150  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.27 
 
 		 608 aa  241  2e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  25.89 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  25.89 
 
 		 577 aa  241  2.9999999999999997e-62  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.22 
 
 		 581 aa  240  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 		 612 aa  240  5.999999999999999e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.59 
 
 		 576 aa  240  5.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.66 
 
 		 572 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.56 
 
 		 579 aa  239  8e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.47 
 
 		 593 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  29.45 
 
 		 581 aa  239  8e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.65 
 
 		 596 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.36 
 
 		 571 aa  239  1e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.43 
 
 		 581 aa  239  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  34.48 
 
 		 598 aa  239  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.54 
 
 		 600 aa  239  1e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  31.57 
 
 		 572 aa  239  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.4 
 
 		 593 aa  238  2e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.3 
 
 		 574 aa  237  6e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  30.29 
 
 		 579 aa  236  7e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  30.52 
 
 		 671 aa  236  7e-61  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.08 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  29.93 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.5 
 
 		 592 aa  236  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.65 
 
 		 579 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.79 
 
 		 1228 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  32.66 
 
 		 609 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  33.47 
 
 		 595 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.03 
 
 		 581 aa  233  5e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  26.7 
 
 		 587 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  26.7 
 
 		 587 aa  233  5e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  31.77 
 
 		 599 aa  233  6e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.94 
 
 		 618 aa  233  6e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  27.26 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  27.26 
 
 		 578 aa  233  7.000000000000001e-60  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  35.41 
 
 		 624 aa  233  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.74 
 
 		 603 aa  233  9e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.69 
 
 		 597 aa  232  1e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.81 
 
 		 585 aa  232  1e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  30.02 
 
 		 636 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  26.77 
 
 		 574 aa  232  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  34.3 
 
 		 585 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  28.67 
 
 		 602 aa  232  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  35.27 
 
 		 577 aa  231  2e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0157  ABC transporter related  35.71 
 
 		 616 aa  232  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.542583  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.83 
 
 		 588 aa  232  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.68 
 
 		 637 aa  231  3e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.47 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.01 
 
 		 583 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3373  ABC transporter related  36.14 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.195497  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4994  ABC transporter related  36.14 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00642068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 594 aa  231  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.66 
 
 		 590 aa  231  4e-59  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.84 
 
 		 627 aa  230  5e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  31.02 
 
 		 572 aa  230  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.99 
 
 		 589 aa  230  5e-59  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  31.26 
 
 		 640 aa  230  6e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.08 
 
 		 637 aa  230  6e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  33.93 
 
 		 627 aa  229  8e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  31.81 
 
 		 571 aa  229  9e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  33.88 
 
 		 606 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0676  ABC efflux pump, fused inner membrane and ATPase subunits  35.23 
 
 		 594 aa  229  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.194816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2311  ABC transporter related  31.02 
 
 		 695 aa  228  2e-58  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.28541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21670  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.01 
 
 		 670 aa  228  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.45 
 
 		 575 aa  228  2e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.56 
 
 		 582 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.28 
 
 		 619 aa  228  3e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  34.54 
 
 		 598 aa  227  4e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1805  ABC transporter related protein  31.09 
 
 		 596 aa  226  6e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.759471  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1685  ABC transporter related  33.87 
 
 		 606 aa  227  6e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.801202  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>