More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1941 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  100 
 
 
581 aa  1193    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  53.28 
 
 
579 aa  639    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  49.91 
 
 
578 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  46.8 
 
 
1228 aa  558  1e-157  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  45.77 
 
 
579 aa  518  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.15 
 
 
603 aa  475  1e-132  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  43.13 
 
 
574 aa  463  1e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  43.81 
 
 
581 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.24 
 
 
580 aa  447  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  40.18 
 
 
568 aa  436  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  43.28 
 
 
579 aa  421  1e-116  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  42.31 
 
 
576 aa  392  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.2 
 
 
581 aa  380  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  38.42 
 
 
593 aa  379  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  36.7 
 
 
573 aa  369  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  36.52 
 
 
573 aa  370  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.24 
 
 
573 aa  363  4e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.25 
 
 
577 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.93 
 
 
588 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.79 
 
 
587 aa  349  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.53 
 
 
585 aa  342  8e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.53 
 
 
585 aa  342  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  36.54 
 
 
597 aa  341  2e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.49 
 
 
592 aa  339  8e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  35.47 
 
 
583 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  32.98 
 
 
573 aa  337  2.9999999999999997e-91  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  37.78 
 
 
593 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.92 
 
 
588 aa  336  5.999999999999999e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.63 
 
 
595 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  35.51 
 
 
579 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.54 
 
 
611 aa  327  5e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.21 
 
 
607 aa  325  1e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.03 
 
 
577 aa  323  5e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.45 
 
 
597 aa  321  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
600 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.76 
 
 
577 aa  320  3.9999999999999996e-86  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.38 
 
 
581 aa  320  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.96 
 
 
619 aa  319  7e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.19 
 
 
587 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.19 
 
 
587 aa  319  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.17 
 
 
577 aa  318  1e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.37 
 
 
596 aa  318  2e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  38.62 
 
 
584 aa  317  3e-85  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.31 
 
 
604 aa  318  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.16 
 
 
589 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 
579 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  33.93 
 
 
577 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  33.93 
 
 
577 aa  313  5.999999999999999e-84  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  34.48 
 
 
578 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  34.48 
 
 
578 aa  313  6.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.09 
 
 
595 aa  311  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  36.25 
 
 
565 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
578 aa  310  2.9999999999999997e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.7 
 
 
573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.56 
 
 
581 aa  310  5.9999999999999995e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.89 
 
 
574 aa  310  5.9999999999999995e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 
1091 aa  309  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.68 
 
 
606 aa  309  8e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.25 
 
 
580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  35.99 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.98 
 
 
590 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  35.86 
 
 
606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.84 
 
 
576 aa  304  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.07 
 
 
598 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  33.86 
 
 
575 aa  304  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.44 
 
 
574 aa  303  8.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.2 
 
 
577 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.07 
 
 
592 aa  302  1e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.84 
 
 
605 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
591 aa  301  3e-80  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  35.11 
 
 
581 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
588 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.7 
 
 
596 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.25 
 
 
581 aa  300  6e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.2 
 
 
618 aa  298  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.83 
 
 
582 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.13 
 
 
618 aa  298  3e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.88 
 
 
596 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
599 aa  297  3e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.63 
 
 
581 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.93 
 
 
602 aa  296  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  36.29 
 
 
571 aa  296  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.78 
 
 
593 aa  296  8e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.5 
 
 
590 aa  296  9e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.26 
 
 
580 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  30.7 
 
 
600 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 
572 aa  293  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  35.41 
 
 
577 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.27 
 
 
608 aa  293  8e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.01 
 
 
583 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
581 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  32.32 
 
 
590 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  31.99 
 
 
582 aa  290  7e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.16 
 
 
609 aa  289  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  36.68 
 
 
608 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.92 
 
 
593 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1783  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.67 
 
 
588 aa  286  7e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.33 
 
 
595 aa  286  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  34.16 
 
 
611 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.26 
 
 
599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>