More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3501 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2392  ABC transporter related  76.95 
 
 		 580 aa  882    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  100 
 
 		 575 aa  1169    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4572  ABC transporter, transmembrane region  65.56 
 
 		 546 aa  692    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2444  ABC transporter related  76.77 
 
 		 580 aa  877    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.385044 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  63.75 
 
 		 578 aa  742    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  59.34 
 
 		 582 aa  698    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  62.04 
 
 		 550 aa  716    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  60.87 
 
 		 578 aa  667    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09021  ABC transporter  43.12 
 
 		 548 aa  474  1e-132  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13891  ABC transporter  44.02 
 
 		 592 aa  468  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.571762 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0832  ATPase  43.54 
 
 		 552 aa  458  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.423533  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1823  ATPase  43.35 
 
 		 581 aa  452  1.0000000000000001e-126  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0973  multidrug ABC transporter  41.31 
 
 		 568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_10431  ABC transporter  41.98 
 
 		 548 aa  454  1.0000000000000001e-126  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  43.35 
 
 		 556 aa  452  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_10431  ABC transporter  41.98 
 
 		 547 aa  451  1e-125  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.503648  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10661  ABC transporter  41.96 
 
 		 578 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.480699  normal  0.0347251 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0384  multidrug ABC transporter  40.98 
 
 		 578 aa  439  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09401  ABC transporter  38.53 
 
 		 580 aa  440  9.999999999999999e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000107359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  42.61 
 
 		 601 aa  433  1e-120  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 598 aa  427  1e-118  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  43.59 
 
 		 608 aa  423  1e-117  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  41.99 
 
 		 598 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  42.1 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  43.58 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.14 
 
 		 577 aa  412  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  41.41 
 
 		 572 aa  397  1e-109  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  40.98 
 
 		 598 aa  399  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  43.75 
 
 		 594 aa  395  1e-108  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  40.61 
 
 		 597 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  40.71 
 
 		 585 aa  389  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  42.44 
 
 		 597 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  38.38 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.11 
 
 		 580 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  40.21 
 
 		 587 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.9 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  36.9 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.9 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  38.85 
 
 		 571 aa  376  1e-103  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.9 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  37.65 
 
 		 601 aa  375  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.9 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.04 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.9 
 
 		 571 aa  378  1e-103  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.28 
 
 		 580 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  40.12 
 
 		 571 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.72 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  37.43 
 
 		 617 aa  373  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.53 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  38.31 
 
 		 576 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.01 
 
 		 575 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.56 
 
 		 585 aa  374  1e-102  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  38.87 
 
 		 606 aa  369  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.98 
 
 		 579 aa  370  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  37.73 
 
 		 613 aa  370  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  39.17 
 
 		 572 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  39.17 
 
 		 572 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  43.22 
 
 		 641 aa  368  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.05 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  39.3 
 
 		 584 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 578 aa  365  1e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 594 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  39.79 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  39.26 
 
 		 567 aa  364  3e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 572 aa  364  3e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.92 
 
 		 600 aa  364  3e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.81 
 
 		 611 aa  363  6e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.96 
 
 		 572 aa  361  2e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0507  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.24 
 
 		 618 aa  360  3e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0495  uncharacterized ABC transporter, ATPase component  35.24 
 
 		 618 aa  360  4e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  35.45 
 
 		 580 aa  360  6e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  39.5 
 
 		 572 aa  359  6e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  37.48 
 
 		 612 aa  359  8e-98  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.12 
 
 		 589 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  40.58 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.26 
 
 		 567 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  37.94 
 
 		 625 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1180  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 637 aa  356  5e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_964  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.76 
 
 		 637 aa  356  5e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.600764  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  39.59 
 
 		 580 aa  356  5e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.95 
 
 		 611 aa  356  5.999999999999999e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.27 
 
 		 597 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  35.42 
 
 		 644 aa  356  5.999999999999999e-97  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  38.52 
 
 		 597 aa  356  6.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.27 
 
 		 597 aa  356  6.999999999999999e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  38.87 
 
 		 588 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  34.04 
 
 		 582 aa  356  7.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.74 
 
 		 602 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  38.98 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0985  ABC transporter, transmembrane region  33.73 
 
 		 636 aa  355  1e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  40 
 
 		 588 aa  355  1e-96  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38.58 
 
 		 611 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.7 
 
 		 596 aa  353  2.9999999999999997e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1192  ABC transporter related  34.09 
 
 		 625 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.92 
 
 		 593 aa  354  2.9999999999999997e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38.78 
 
 		 611 aa  353  5e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  38.7 
 
 		 582 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1690  ABC transporter related  34.17 
 
 		 607 aa  352  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  38.76 
 
 		 589 aa  352  1e-95  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  36.21 
 
 		 568 aa  352  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>