More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1602 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1602  ATPase  100 
 
 
584 aa  1199    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  39.73 
 
 
611 aa  423  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  39.93 
 
 
597 aa  408  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  38.3 
 
 
592 aa  400  9.999999999999999e-111  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.37 
 
 
604 aa  397  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  40.79 
 
 
598 aa  384  1e-105  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  37.5 
 
 
602 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38 
 
 
590 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  37.93 
 
 
590 aa  379  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.05 
 
 
1091 aa  379  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.27 
 
 
589 aa  375  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  40.36 
 
 
606 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.12 
 
 
593 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.85 
 
 
597 aa  368  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  35.34 
 
 
587 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  35.34 
 
 
587 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  37.84 
 
 
596 aa  364  2e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  36.23 
 
 
619 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
599 aa  361  2e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  37.28 
 
 
590 aa  358  9.999999999999999e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 
618 aa  358  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.52 
 
 
576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.11 
 
 
595 aa  356  5e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.48 
 
 
593 aa  355  1e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  38.73 
 
 
593 aa  353  2.9999999999999997e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.09 
 
 
581 aa  351  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  37.25 
 
 
609 aa  350  3e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.18 
 
 
573 aa  347  2e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  38.73 
 
 
609 aa  346  5e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 
580 aa  346  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.79 
 
 
1228 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  37.39 
 
 
580 aa  339  7e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.33 
 
 
579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
578 aa  336  7e-91  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.15 
 
 
1194 aa  335  1e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  38.99 
 
 
611 aa  335  2e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.97 
 
 
596 aa  332  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.26 
 
 
595 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.38 
 
 
600 aa  332  1e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.05 
 
 
600 aa  331  2e-89  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  35.14 
 
 
677 aa  330  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  35.1 
 
 
611 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.52 
 
 
583 aa  329  7e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.74 
 
 
618 aa  329  7e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.09 
 
 
576 aa  327  3e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.69 
 
 
579 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  38.62 
 
 
581 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  35.37 
 
 
599 aa  324  3e-87  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.99 
 
 
583 aa  322  9.999999999999999e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
588 aa  322  9.999999999999999e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  38.45 
 
 
608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  36.01 
 
 
608 aa  321  3e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  37.5 
 
 
581 aa  319  1e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.14 
 
 
596 aa  319  1e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.99 
 
 
577 aa  316  7e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 
577 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  34.78 
 
 
579 aa  313  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.56 
 
 
581 aa  314  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.99 
 
 
585 aa  312  9e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.93 
 
 
627 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.22 
 
 
568 aa  311  2.9999999999999997e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.43 
 
 
577 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.03 
 
 
573 aa  310  5e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  32.03 
 
 
573 aa  310  5.9999999999999995e-83  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 
585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  36.73 
 
 
603 aa  308  1.0000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  36.08 
 
 
579 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.15 
 
 
587 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.98 
 
 
577 aa  306  9.000000000000001e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 
581 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  34.07 
 
 
603 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.03 
 
 
575 aa  303  6.000000000000001e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  35.22 
 
 
565 aa  303  8.000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.56 
 
 
579 aa  301  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.77 
 
 
606 aa  302  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  38.4 
 
 
582 aa  302  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.16 
 
 
588 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.31 
 
 
607 aa  302  1e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.72 
 
 
577 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.64 
 
 
612 aa  295  1e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.33 
 
 
593 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 
581 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  37.43 
 
 
619 aa  295  2e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  30.29 
 
 
578 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  30.29 
 
 
578 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  33.66 
 
 
598 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.75 
 
 
592 aa  293  5e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.59 
 
 
572 aa  293  7e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.58 
 
 
574 aa  292  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.56 
 
 
574 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.09 
 
 
581 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 
603 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.79 
 
 
611 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.1 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.1 
 
 
577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.4 
 
 
586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  34.83 
 
 
650 aa  287  4e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
600 aa  287  4e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.35 
 
 
578 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>