More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_2604 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 593 aa  1184    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  39.52 
 
 		 611 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.16 
 
 		 604 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  40.36 
 
 		 593 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.63 
 
 		 597 aa  387  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  39.12 
 
 		 584 aa  387  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  38.38 
 
 		 611 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.15 
 
 		 592 aa  372  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  41.39 
 
 		 618 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  43.66 
 
 		 598 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.59 
 
 		 590 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  41.7 
 
 		 606 aa  369  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  38.6 
 
 		 619 aa  368  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.65 
 
 		 580 aa  362  1e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  37.52 
 
 		 590 aa  359  7e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.36 
 
 		 602 aa  359  9e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.59 
 
 		 593 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 597 aa  354  2e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.17 
 
 		 589 aa  353  4e-96  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.68 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  37.33 
 
 		 595 aa  345  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 		 580 aa  342  9e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  39.97 
 
 		 600 aa  342  1e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  36.08 
 
 		 609 aa  340  4e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.35 
 
 		 618 aa  337  3.9999999999999995e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.93 
 
 		 573 aa  336  5.999999999999999e-91  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.07 
 
 		 596 aa  336  5.999999999999999e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.53 
 
 		 576 aa  334  2e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 		 1091 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  38.3 
 
 		 677 aa  329  7e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  39 
 
 		 611 aa  329  1.0000000000000001e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.5 
 
 		 609 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 599 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 590 aa  322  9.000000000000001e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.37 
 
 		 576 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.23 
 
 		 1194 aa  321  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.28 
 
 		 587 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.28 
 
 		 587 aa  317  3e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.47 
 
 		 627 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.41 
 
 		 608 aa  316  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.8 
 
 		 573 aa  313  5.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  32.74 
 
 		 573 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 588 aa  312  9e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.55 
 
 		 599 aa  311  2e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.11 
 
 		 1228 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.21 
 
 		 607 aa  309  9e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 		 572 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.29 
 
 		 587 aa  307  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.04 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.25 
 
 		 612 aa  305  1.0000000000000001e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  31.91 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  38.1 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  32.77 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.75 
 
 		 579 aa  304  4.0000000000000003e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.74 
 
 		 579 aa  304  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  36.25 
 
 		 598 aa  303  8.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.19 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.34 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.65 
 
 		 588 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  36.66 
 
 		 603 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  38.73 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  32.01 
 
 		 573 aa  296  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.31 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.31 
 
 		 577 aa  295  1e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  36.75 
 
 		 606 aa  295  2e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.14 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  34.8 
 
 		 597 aa  293  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  31.44 
 
 		 573 aa  292  1e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  35.37 
 
 		 578 aa  291  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  33.45 
 
 		 584 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.39 
 
 		 578 aa  289  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.86 
 
 		 573 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  29.59 
 
 		 584 aa  289  1e-76  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  38.31 
 
 		 593 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 		 581 aa  288  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  34.09 
 
 		 583 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.99 
 
 		 581 aa  287  4e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.46 
 
 		 565 aa  287  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.23 
 
 		 581 aa  287  5e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.28 
 
 		 581 aa  286  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.63 
 
 		 568 aa  286  1.0000000000000001e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.48 
 
 		 580 aa  286  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.4 
 
 		 581 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.66 
 
 		 588 aa  285  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.59 
 
 		 578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  36.24 
 
 		 624 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.35 
 
 		 575 aa  284  3.0000000000000004e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  40.16 
 
 		 581 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.52 
 
 		 603 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 571 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  32.91 
 
 		 596 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.39 
 
 		 583 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  37.14 
 
 		 603 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.17 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.63 
 
 		 574 aa  280  6e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  31.58 
 
 		 577 aa  279  9e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.53 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.9 
 
 		 585 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>