More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0189 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  100 
 
 		 593 aa  1182    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  46.65 
 
 		 618 aa  437  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  39.58 
 
 		 597 aa  409  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  38.38 
 
 		 602 aa  398  1e-109  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.89 
 
 		 611 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  37.76 
 
 		 604 aa  378  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.79 
 
 		 593 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  37.13 
 
 		 592 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  36.52 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  36.52 
 
 		 587 aa  366  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.52 
 
 		 597 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  40.04 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.03 
 
 		 590 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  41.05 
 
 		 603 aa  358  9.999999999999999e-98  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  35.69 
 
 		 590 aa  358  1.9999999999999998e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.16 
 
 		 593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  36.15 
 
 		 1194 aa  351  2e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  40.04 
 
 		 598 aa  348  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  39.93 
 
 		 606 aa  347  5e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 599 aa  346  8.999999999999999e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.28 
 
 		 580 aa  343  7e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  37.86 
 
 		 584 aa  343  8e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  39.15 
 
 		 600 aa  341  2.9999999999999998e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  37.48 
 
 		 609 aa  340  5e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.77 
 
 		 576 aa  338  1.9999999999999998e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  39.07 
 
 		 600 aa  336  7e-91  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.16 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.16 
 
 		 577 aa  335  1e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 579 aa  333  5e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  37.25 
 
 		 599 aa  330  4e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  37.11 
 
 		 677 aa  330  5.0000000000000004e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.63 
 
 		 589 aa  329  8e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.62 
 
 		 618 aa  328  2.0000000000000001e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.82 
 
 		 595 aa  328  2.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  37.73 
 
 		 611 aa  327  3e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.12 
 
 		 579 aa  327  4.0000000000000003e-88  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35.34 
 
 		 576 aa  327  5e-88  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.84 
 
 		 619 aa  325  1e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.31 
 
 		 581 aa  323  8e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  36.22 
 
 		 611 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  38.46 
 
 		 608 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.1 
 
 		 588 aa  320  6e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  37.86 
 
 		 580 aa  319  9e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.64 
 
 		 596 aa  317  3e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.75 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.75 
 
 		 578 aa  317  3e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.1 
 
 		 1091 aa  316  7e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  37.03 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.97 
 
 		 573 aa  313  3.9999999999999997e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.73 
 
 		 596 aa  313  4.999999999999999e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 583 aa  313  5.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.52 
 
 		 627 aa  313  5.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.66 
 
 		 577 aa  313  6.999999999999999e-84  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.14 
 
 		 595 aa  312  1e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  39.78 
 
 		 597 aa  312  1e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.25 
 
 		 574 aa  311  2.9999999999999997e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.86 
 
 		 1228 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  39.13 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.94 
 
 		 572 aa  308  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.89 
 
 		 608 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.07 
 
 		 574 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  38.88 
 
 		 579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.67 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.19 
 
 		 577 aa  302  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.57 
 
 		 588 aa  300  7e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.89 
 
 		 583 aa  299  8e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  36.68 
 
 		 609 aa  299  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.33 
 
 		 573 aa  299  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  38.58 
 
 		 578 aa  299  1e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  41.12 
 
 		 592 aa  298  1e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.05 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.82 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  35.32 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.67 
 
 		 593 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.94 
 
 		 575 aa  296  9e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  35.52 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.04 
 
 		 574 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.78 
 
 		 565 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.35 
 
 		 581 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.53 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.32 
 
 		 583 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.92 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.77 
 
 		 568 aa  287  2.9999999999999996e-76  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.52 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.44 
 
 		 603 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.29 
 
 		 579 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  35.85 
 
 		 591 aa  285  1.0000000000000001e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  36.01 
 
 		 1138 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.25 
 
 		 580 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.51 
 
 		 574 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  36.04 
 
 		 649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.35 
 
 		 607 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 		 581 aa  283  9e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  35.24 
 
 		 589 aa  282  1e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.14 
 
 		 577 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.71 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  35.26 
 
 		 586 aa  280  4e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.09 
 
 		 618 aa  280  6e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  35.16 
 
 		 597 aa  279  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>