More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2109 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  62.78 
 
 		 596 aa  735    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  67.18 
 
 		 601 aa  802    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  66.27 
 
 		 601 aa  798    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0649  ATPase  58.35 
 
 		 596 aa  698    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.110083  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  67.18 
 
 		 602 aa  795    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  56.03 
 
 		 625 aa  664    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  64.9 
 
 		 619 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1643  ATPase  64.43 
 
 		 601 aa  745    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  56.7 
 
 		 590 aa  693    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  100 
 
 		 591 aa  1192    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0828  ABC transporter related  61.2 
 
 		 596 aa  749    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.61579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10871  multidrug ABC transporter  60.93 
 
 		 596 aa  724    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.405422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  70.94 
 
 		 603 aa  846    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0306  ABC transporter related protein  57.91 
 
 		 620 aa  643    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.233124 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  57.31 
 
 		 595 aa  660    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  66.27 
 
 		 601 aa  799    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12051  multidrug ABC transporter  57.22 
 
 		 590 aa  708    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  57.9 
 
 		 590 aa  719    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14811  multidrug ABC transporter  58.52 
 
 		 596 aa  700    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.25024  normal  0.341749 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12061  multidrug ABC transporter  57.04 
 
 		 590 aa  699    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1520  hypothetical protein  49.83 
 
 		 595 aa  570  1e-161  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  43.87 
 
 		 644 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1375  ABC transporter related  43.2 
 
 		 651 aa  481  1e-134  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.250681  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  42.9 
 
 		 660 aa  481  1e-134  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  41.46 
 
 		 650 aa  477  1e-133  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  41.95 
 
 		 629 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0078  ABC transporter related  41.38 
 
 		 648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.213516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  40.7 
 
 		 638 aa  447  1.0000000000000001e-124  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  43.64 
 
 		 658 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4137  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 718 aa  439  9.999999999999999e-123  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3174  ABC transporter related  40.96 
 
 		 750 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3017  ABC transporter related protein  38.49 
 
 		 639 aa  415  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3603  ABC transporter related  40.75 
 
 		 962 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0813652  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  37.48 
 
 		 585 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1550  ABC transporter related  38.85 
 
 		 589 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.759268  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.49 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.08 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.08 
 
 		 571 aa  392  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  36.08 
 
 		 571 aa  392  1e-107  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.25 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0913  ABC transporter related  37.42 
 
 		 678 aa  391  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00146704 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.91 
 
 		 571 aa  390  1e-107  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.08 
 
 		 571 aa  392  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.91 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.91 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.91 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  35.74 
 
 		 571 aa  388  1e-106  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.95 
 
 		 556 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0402  ABC transporter related  36.94 
 
 		 645 aa  376  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.176731  normal  0.164805 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  37.52 
 
 		 582 aa  375  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 572 aa  372  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.28 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  37.17 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  35.73 
 
 		 584 aa  370  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.7 
 
 		 610 aa  372  1e-101  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  35.28 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  38.91 
 
 		 598 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  35.99 
 
 		 582 aa  369  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  35.1 
 
 		 580 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.86 
 
 		 588 aa  362  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  34.48 
 
 		 576 aa  360  4e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.68 
 
 		 582 aa  356  8.999999999999999e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  34.48 
 
 		 572 aa  355  1e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  34.08 
 
 		 568 aa  353  4e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  34.63 
 
 		 572 aa  352  1e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.9 
 
 		 579 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.33 
 
 		 597 aa  350  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 572 aa  350  5e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  33.39 
 
 		 597 aa  349  8e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  35.9 
 
 		 586 aa  348  1e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  37.2 
 
 		 581 aa  348  1e-94  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  38.06 
 
 		 614 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  39.09 
 
 		 575 aa  348  2e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  32.89 
 
 		 671 aa  346  8e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  34.81 
 
 		 640 aa  345  1e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  35.88 
 
 		 565 aa  345  1e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  36.04 
 
 		 566 aa  345  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.4 
 
 		 567 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  35.17 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  34.15 
 
 		 580 aa  342  8e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.4 
 
 		 567 aa  342  9e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4923  ABC transporter related  33.16 
 
 		 593 aa  342  1e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0406307 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.67 
 
 		 768 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.69 
 
 		 579 aa  342  2e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  33.5 
 
 		 600 aa  341  2e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0672  ABC transporter related  35.95 
 
 		 777 aa  341  2e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.264122  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  33.45 
 
 		 594 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  31.8 
 
 		 613 aa  341  2.9999999999999998e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  33.05 
 
 		 631 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 		 566 aa  340  4e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.96 
 
 		 764 aa  340  5e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  36.12 
 
 		 607 aa  340  5.9999999999999996e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  34.08 
 
 		 587 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  39.28 
 
 		 579 aa  338  9.999999999999999e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.94 
 
 		 572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  36.67 
 
 		 764 aa  338  1.9999999999999998e-91  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  34.41 
 
 		 669 aa  338  1.9999999999999998e-91  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  36.5 
 
 		 606 aa  337  2.9999999999999997e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.89 
 
 		 598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1417  ABC transporter related  36.66 
 
 		 782 aa  337  2.9999999999999997e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.111222 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>