More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_26120 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
580 aa  1181    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  55.42 
 
 
579 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  48.78 
 
 
574 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  46.82 
 
 
568 aa  506  9.999999999999999e-143  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.43 
 
 
603 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  42.24 
 
 
581 aa  456  1e-127  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  43.85 
 
 
1228 aa  434  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  38.54 
 
 
579 aa  419  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  40.28 
 
 
578 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  40.5 
 
 
573 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.81 
 
 
573 aa  392  1e-108  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  39.64 
 
 
573 aa  395  1e-108  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  43.71 
 
 
581 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  37.03 
 
 
573 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  40.04 
 
 
576 aa  331  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  35.73 
 
 
583 aa  329  7e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.58 
 
 
588 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.5 
 
 
597 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.74 
 
 
588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.94 
 
 
604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.55 
 
 
577 aa  307  3e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.58 
 
 
593 aa  307  4.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  36.4 
 
 
579 aa  306  5.0000000000000004e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.42 
 
 
581 aa  301  2e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.78 
 
 
577 aa  300  3e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  40.59 
 
 
598 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.62 
 
 
579 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.88 
 
 
593 aa  297  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  33.51 
 
 
587 aa  293  8e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  34.08 
 
 
579 aa  292  9e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.29 
 
 
589 aa  292  1e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.63 
 
 
565 aa  291  2e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  38.25 
 
 
593 aa  291  3e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.67 
 
 
607 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.61 
 
 
611 aa  290  7e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  35.83 
 
 
596 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.66 
 
 
577 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.66 
 
 
577 aa  287  5e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.72 
 
 
578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.72 
 
 
578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.41 
 
 
582 aa  284  3.0000000000000004e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  38.43 
 
 
581 aa  282  9e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.29 
 
 
595 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.46 
 
 
592 aa  280  5e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  35.17 
 
 
600 aa  279  8e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.85 
 
 
608 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.58 
 
 
587 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.49 
 
 
581 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.58 
 
 
587 aa  278  2e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.35 
 
 
593 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.7 
 
 
611 aa  276  5e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 
595 aa  275  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  36.2 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  34.64 
 
 
584 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.23 
 
 
585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.4 
 
 
1091 aa  274  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.15 
 
 
618 aa  273  6e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  34.11 
 
 
590 aa  273  7e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  37.97 
 
 
578 aa  273  9e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.29 
 
 
599 aa  272  1e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.76 
 
 
596 aa  271  2e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.98 
 
 
577 aa  272  2e-71  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.53 
 
 
577 aa  272  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  31.86 
 
 
585 aa  271  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.69 
 
 
590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.48 
 
 
592 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.75 
 
 
605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.46 
 
 
575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.62 
 
 
611 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.45 
 
 
611 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
611 aa  270  5e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.09 
 
 
577 aa  270  5e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.47 
 
 
574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.05 
 
 
574 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 
593 aa  270  7e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 
581 aa  269  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.41 
 
 
571 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.73 
 
 
581 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  33.74 
 
 
574 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  35.79 
 
 
598 aa  268  2e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.89 
 
 
619 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.5 
 
 
581 aa  267  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.69 
 
 
596 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  39.35 
 
 
582 aa  266  1e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.55 
 
 
606 aa  264  3e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
579 aa  263  4.999999999999999e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1608  ABC transporter related  35.41 
 
 
600 aa  263  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1596  ABC transporter related  35.85 
 
 
600 aa  263  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0640452  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  33.87 
 
 
600 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.59 
 
 
582 aa  261  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  35.7 
 
 
595 aa  262  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.07 
 
 
572 aa  261  2e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.47 
 
 
618 aa  261  3e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  32.29 
 
 
588 aa  261  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  32.3 
 
 
591 aa  260  4e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.27 
 
 
1194 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.12 
 
 
571 aa  259  7e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
590 aa  259  8e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.08 
 
 
599 aa  259  9e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.9 
 
 
581 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>