More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2626 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
581 aa  1194    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  57.49 
 
 
589 aa  682    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  50.43 
 
 
580 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  49.14 
 
 
608 aa  572  1.0000000000000001e-162  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  50.17 
 
 
609 aa  561  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  47.41 
 
 
599 aa  531  1e-149  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  45.7 
 
 
597 aa  527  1e-148  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  47.62 
 
 
596 aa  513  1e-144  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  45.21 
 
 
573 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  45.21 
 
 
573 aa  496  1e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  43.17 
 
 
593 aa  483  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  40.79 
 
 
619 aa  452  1.0000000000000001e-126  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.7 
 
 
580 aa  446  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  40.1 
 
 
595 aa  446  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  39.08 
 
 
587 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  39.08 
 
 
587 aa  438  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.69 
 
 
583 aa  426  1e-118  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.27 
 
 
576 aa  385  1e-105  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.18 
 
 
611 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.07 
 
 
1091 aa  372  1e-102  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  39.92 
 
 
618 aa  362  1e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.88 
 
 
583 aa  360  3e-98  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.18 
 
 
604 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.16 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  36.22 
 
 
597 aa  353  5.9999999999999994e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.09 
 
 
584 aa  345  1e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.52 
 
 
611 aa  343  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.86 
 
 
598 aa  333  5e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.65 
 
 
590 aa  333  5e-90  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
579 aa  330  4e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.73 
 
 
593 aa  324  2e-87  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  35.4 
 
 
609 aa  324  2e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.78 
 
 
618 aa  323  4e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  37.07 
 
 
581 aa  323  7e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.31 
 
 
593 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.47 
 
 
606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.33 
 
 
588 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.42 
 
 
602 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.07 
 
 
573 aa  318  2e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.05 
 
 
576 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.23 
 
 
627 aa  313  7.999999999999999e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.34 
 
 
581 aa  310  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  36.83 
 
 
596 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.68 
 
 
1194 aa  305  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 
572 aa  303  5.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  37.68 
 
 
1228 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.09 
 
 
595 aa  299  9e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.95 
 
 
600 aa  299  9e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.09 
 
 
581 aa  298  3e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.63 
 
 
581 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.77 
 
 
577 aa  297  4e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  30.7 
 
 
590 aa  295  1e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.87 
 
 
577 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.7 
 
 
590 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  31.08 
 
 
606 aa  294  4e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.03 
 
 
597 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.27 
 
 
579 aa  291  3e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
599 aa  291  3e-77  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.63 
 
 
578 aa  291  3e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.02 
 
 
574 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.48 
 
 
596 aa  290  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.53 
 
 
578 aa  289  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  30.09 
 
 
596 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.15 
 
 
588 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.88 
 
 
588 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.4 
 
 
612 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.59 
 
 
607 aa  286  5.999999999999999e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.27 
 
 
592 aa  286  8e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.12 
 
 
600 aa  286  9e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  31.76 
 
 
1138 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.88 
 
 
579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
619 aa  285  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.21 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  33.51 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.22 
 
 
577 aa  283  8.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  33.92 
 
 
677 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.52 
 
 
587 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.62 
 
 
568 aa  281  3e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  31.56 
 
 
611 aa  280  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  32.75 
 
 
624 aa  279  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.4 
 
 
577 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.4 
 
 
577 aa  279  1e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  31.71 
 
 
581 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  31.55 
 
 
596 aa  278  3e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  32.26 
 
 
582 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  32.42 
 
 
608 aa  276  8e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 
593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  32.43 
 
 
603 aa  274  3e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.48 
 
 
575 aa  273  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.12 
 
 
581 aa  273  7e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  30.07 
 
 
598 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.45 
 
 
577 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  31.99 
 
 
598 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.57 
 
 
579 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  32.2 
 
 
579 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54980  poossible ABC-type transporter protein  32.99 
 
 
584 aa  269  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000875214  unclonable  5.28069e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  32.28 
 
 
589 aa  269  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.31 
 
 
582 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  30.96 
 
 
583 aa  268  2e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.99 
 
 
578 aa  268  2e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>