More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23130 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  58.23 
 
 		 579 aa  711    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  54.33 
 
 		 588 aa  636    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 577 aa  1185    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  49.22 
 
 		 587 aa  570  1e-161  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  47.14 
 
 		 579 aa  535  1e-151  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.54 
 
 		 577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.84 
 
 		 588 aa  514  1e-144  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  44.89 
 
 		 577 aa  514  1e-144  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  42.21 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  42.21 
 
 		 578 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.17 
 
 		 574 aa  439  9.999999999999999e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  40.6 
 
 		 581 aa  422  1e-117  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  35.17 
 
 		 577 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  40.61 
 
 		 605 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  35.17 
 
 		 577 aa  411  1e-113  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  38.49 
 
 		 581 aa  410  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  37.46 
 
 		 574 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.18 
 
 		 581 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.69 
 
 		 582 aa  399  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.72 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.56 
 
 		 593 aa  367  1e-100  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.58 
 
 		 579 aa  361  3e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 579 aa  353  7e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.96 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.1 
 
 		 576 aa  342  2e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  36.95 
 
 		 578 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.64 
 
 		 581 aa  323  4e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.56 
 
 		 604 aa  321  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.12 
 
 		 597 aa  319  7e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  37.37 
 
 		 577 aa  319  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.17 
 
 		 581 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  36.49 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.45 
 
 		 580 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.64 
 
 		 596 aa  311  2e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.64 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.02 
 
 		 611 aa  310  4e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.19 
 
 		 584 aa  307  3e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  37.13 
 
 		 600 aa  307  3e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.14 
 
 		 593 aa  306  6e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.89 
 
 		 603 aa  305  1.0000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.48 
 
 		 607 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.05 
 
 		 568 aa  305  2.0000000000000002e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.89 
 
 		 618 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.2 
 
 		 592 aa  304  3.0000000000000004e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.93 
 
 		 589 aa  303  5.000000000000001e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.27 
 
 		 598 aa  302  9e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.27 
 
 		 583 aa  302  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.55 
 
 		 580 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  36.38 
 
 		 577 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  32.91 
 
 		 598 aa  300  5e-80  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.06 
 
 		 581 aa  299  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.42 
 
 		 1228 aa  299  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.82 
 
 		 593 aa  298  2e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  38.12 
 
 		 596 aa  298  2e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  35.56 
 
 		 582 aa  297  4e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.03 
 
 		 572 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.87 
 
 		 581 aa  294  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.64 
 
 		 597 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.29 
 
 		 592 aa  294  3e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.86 
 
 		 618 aa  294  4e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.82 
 
 		 581 aa  293  5e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.49 
 
 		 574 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.19 
 
 		 595 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.49 
 
 		 587 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.49 
 
 		 587 aa  290  6e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  34.4 
 
 		 579 aa  290  6e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 		 593 aa  289  9e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.79 
 
 		 609 aa  289  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.65 
 
 		 619 aa  289  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  36.29 
 
 		 581 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.73 
 
 		 608 aa  287  4e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  32.12 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.52 
 
 		 1091 aa  286  8e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  31.14 
 
 		 585 aa  286  9e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.72 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.46 
 
 		 576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  32.52 
 
 		 582 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 573 aa  285  1.0000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.8 
 
 		 573 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.14 
 
 		 585 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.76 
 
 		 1138 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.2 
 
 		 595 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  32.59 
 
 		 573 aa  283  7.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  35.32 
 
 		 571 aa  283  8.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.46 
 
 		 593 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.65 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  39.21 
 
 		 578 aa  281  2e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 588 aa  281  2e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.1 
 
 		 600 aa  280  5e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  33.84 
 
 		 582 aa  280  7e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  32.7 
 
 		 584 aa  280  7e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.95 
 
 		 596 aa  278  1e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.39 
 
 		 608 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.67 
 
 		 581 aa  276  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.86 
 
 		 599 aa  275  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  35.83 
 
 		 677 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.06 
 
 		 606 aa  275  2.0000000000000002e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  33.54 
 
 		 575 aa  273  6e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0391  ABC transporter related  32.22 
 
 		 606 aa  271  2e-71  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.905375 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>