More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_03660 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  61.63 
 
 
587 aa  748    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  68.46 
 
 
577 aa  815    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
577 aa  1184    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  49.31 
 
 
588 aa  592  1e-168  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  46.53 
 
 
579 aa  532  1e-150  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  44.54 
 
 
577 aa  516  1.0000000000000001e-145  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  44.12 
 
 
588 aa  509  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.15 
 
 
579 aa  505  1e-141  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.1 
 
 
574 aa  447  1.0000000000000001e-124  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  39.24 
 
 
578 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  39.24 
 
 
578 aa  440  9.999999999999999e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  37.12 
 
 
577 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  37.12 
 
 
577 aa  437  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  41.13 
 
 
581 aa  436  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  39.46 
 
 
605 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  37.22 
 
 
581 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.6 
 
 
585 aa  379  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  34.76 
 
 
574 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.37 
 
 
581 aa  369  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.46 
 
 
582 aa  365  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.62 
 
 
579 aa  361  2e-98  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  40.25 
 
 
581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  40.32 
 
 
596 aa  348  1e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
579 aa  348  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.41 
 
 
578 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.03 
 
 
581 aa  332  1e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.13 
 
 
577 aa  327  4.0000000000000003e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.73 
 
 
597 aa  323  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.22 
 
 
593 aa  322  9.000000000000001e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.35 
 
 
596 aa  321  3e-86  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.59 
 
 
576 aa  319  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  37.5 
 
 
608 aa  318  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.24 
 
 
574 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.46 
 
 
593 aa  314  1.9999999999999998e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.51 
 
 
573 aa  313  4.999999999999999e-84  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.93 
 
 
589 aa  311  1e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.82 
 
 
1228 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 
597 aa  309  8e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.5 
 
 
579 aa  307  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.44 
 
 
581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.02 
 
 
590 aa  306  5.0000000000000004e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
581 aa  306  6e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.99 
 
 
592 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.48 
 
 
581 aa  305  2.0000000000000002e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.45 
 
 
584 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.19 
 
 
593 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  37.17 
 
 
577 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.27 
 
 
573 aa  301  3e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  37.6 
 
 
595 aa  300  4e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  36.02 
 
 
580 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.27 
 
 
573 aa  300  7e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  35.83 
 
 
607 aa  299  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.89 
 
 
580 aa  297  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31 
 
 
583 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.68 
 
 
618 aa  297  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.77 
 
 
581 aa  297  4e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  38.51 
 
 
619 aa  296  7e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.78 
 
 
580 aa  296  7e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  34.51 
 
 
565 aa  296  9e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.82 
 
 
599 aa  296  1e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.42 
 
 
593 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  30.4 
 
 
568 aa  294  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.88 
 
 
596 aa  294  3e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.6 
 
 
598 aa  294  3e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.58 
 
 
574 aa  293  6e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.73 
 
 
611 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.27 
 
 
581 aa  292  9e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.77 
 
 
576 aa  292  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.64 
 
 
587 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.64 
 
 
587 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.44 
 
 
609 aa  289  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  34.35 
 
 
581 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  36.96 
 
 
582 aa  288  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  32.4 
 
 
592 aa  287  4e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  35.2 
 
 
579 aa  286  5e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.11 
 
 
603 aa  282  1e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  29.17 
 
 
573 aa  282  1e-74  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.98 
 
 
602 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  36.12 
 
 
582 aa  280  6e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.49 
 
 
585 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  34.16 
 
 
600 aa  279  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.05 
 
 
582 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.96 
 
 
1091 aa  278  2e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.28 
 
 
585 aa  278  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  32.42 
 
 
1138 aa  278  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  32.55 
 
 
577 aa  277  4e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  36.84 
 
 
588 aa  277  4e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  32.95 
 
 
618 aa  276  5e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
572 aa  276  6e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.62 
 
 
575 aa  276  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  31.84 
 
 
598 aa  276  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
571 aa  274  3e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.44 
 
 
604 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  31.84 
 
 
600 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34 
 
 
609 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  32.34 
 
 
608 aa  273  6e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.15 
 
 
606 aa  273  9e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  37.97 
 
 
595 aa  271  2.9999999999999997e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.84 
 
 
599 aa  271  4e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>