More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3971 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  100 
 
 		 596 aa  1227    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  50.25 
 
 		 609 aa  561  1e-158  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  46.37 
 
 		 618 aa  551  1e-156  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  47.31 
 
 		 604 aa  538  1e-151  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  43.79 
 
 		 599 aa  494  9.999999999999999e-139  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  43.91 
 
 		 597 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.96 
 
 		 627 aa  488  1e-136  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  44.17 
 
 		 573 aa  481  1e-134  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  41.36 
 
 		 611 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  40.1 
 
 		 1228 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.56 
 
 		 592 aa  411  1e-113  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.94 
 
 		 578 aa  405  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  37.93 
 
 		 584 aa  394  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.1 
 
 		 584 aa  386  1e-106  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  35.52 
 
 		 584 aa  371  1e-101  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.73 
 
 		 584 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  37.94 
 
 		 590 aa  352  1e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.79 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.79 
 
 		 587 aa  348  2e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.03 
 
 		 602 aa  346  6e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.91 
 
 		 576 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  36.13 
 
 		 611 aa  344  2.9999999999999997e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.14 
 
 		 589 aa  335  1e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.47 
 
 		 595 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.43 
 
 		 1091 aa  333  8e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.72 
 
 		 600 aa  330  6e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.45 
 
 		 590 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  34.45 
 
 		 590 aa  326  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.61 
 
 		 598 aa  326  7e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.25 
 
 		 606 aa  326  8.000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.51 
 
 		 596 aa  326  9e-88  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.16 
 
 		 595 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 578 aa  319  1e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  36.05 
 
 		 599 aa  317  3e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.38 
 
 		 608 aa  316  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.07 
 
 		 593 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  32.42 
 
 		 593 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.69 
 
 		 576 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.51 
 
 		 677 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.87 
 
 		 593 aa  310  4e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  34.69 
 
 		 619 aa  309  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.6 
 
 		 607 aa  303  5.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.7 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.12 
 
 		 577 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.96 
 
 		 597 aa  294  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.88 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.64 
 
 		 588 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.98 
 
 		 580 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 		 581 aa  290  5.0000000000000004e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.88 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.88 
 
 		 577 aa  290  5.0000000000000004e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.96 
 
 		 583 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.47 
 
 		 618 aa  288  2e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  35.08 
 
 		 603 aa  287  4e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.27 
 
 		 587 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.49 
 
 		 600 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  36.9 
 
 		 624 aa  286  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.95 
 
 		 581 aa  285  2.0000000000000002e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  33.68 
 
 		 597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 579 aa  283  7.000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.93 
 
 		 588 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.52 
 
 		 581 aa  282  1e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.33 
 
 		 1194 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  34.95 
 
 		 581 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.18 
 
 		 608 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.98 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.4 
 
 		 612 aa  280  4e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.04 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  31.82 
 
 		 587 aa  278  2e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.85 
 
 		 579 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.99 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  34.01 
 
 		 605 aa  276  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  32.21 
 
 		 577 aa  275  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  31.48 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.78 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  33.91 
 
 		 1138 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  31.77 
 
 		 565 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.19 
 
 		 859 aa  273  7e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.06 
 
 		 577 aa  273  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.5 
 
 		 581 aa  273  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.39 
 
 		 593 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.53 
 
 		 579 aa  271  2e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  36.79 
 
 		 582 aa  270  4e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  33.33 
 
 		 596 aa  270  4e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  31.93 
 
 		 587 aa  270  5e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  31.38 
 
 		 611 aa  270  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 587 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  31.59 
 
 		 587 aa  270  7e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.59 
 
 		 587 aa  270  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  31.59 
 
 		 587 aa  270  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.59 
 
 		 587 aa  270  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.59 
 
 		 587 aa  268  1e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  32.6 
 
 		 587 aa  269  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  32.45 
 
 		 578 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  269  1e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 		 600 aa  267  2.9999999999999995e-70  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  35.82 
 
 		 597 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  34.08 
 
 		 582 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>