More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0707 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  61.64 
 
 
584 aa  743    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  100 
 
 
584 aa  1172    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  90.75 
 
 
584 aa  1079    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  53.54 
 
 
578 aa  634  1e-180  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  37.93 
 
 
596 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.17 
 
 
573 aa  377  1e-103  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.6 
 
 
618 aa  363  6e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  36.38 
 
 
599 aa  346  5e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.54 
 
 
592 aa  340  4e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.56 
 
 
611 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  31.38 
 
 
609 aa  337  2.9999999999999997e-91  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.73 
 
 
604 aa  334  3e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.28 
 
 
627 aa  333  7.000000000000001e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  33.28 
 
 
597 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.28 
 
 
576 aa  295  1e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.89 
 
 
590 aa  295  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 
595 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  29.24 
 
 
602 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  30.47 
 
 
590 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.47 
 
 
590 aa  280  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.82 
 
 
619 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  38.01 
 
 
578 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  38.01 
 
 
578 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.92 
 
 
1091 aa  277  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.3 
 
 
1228 aa  273  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  30.41 
 
 
587 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  30.41 
 
 
587 aa  265  2e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  36.9 
 
 
577 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  36.9 
 
 
577 aa  264  3e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.54 
 
 
589 aa  263  4.999999999999999e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  30.55 
 
 
593 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  30.8 
 
 
611 aa  263  8.999999999999999e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.36 
 
 
580 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  31.08 
 
 
606 aa  261  2e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  31.3 
 
 
593 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.14 
 
 
579 aa  260  5.0000000000000005e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  28.11 
 
 
588 aa  258  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  29.96 
 
 
579 aa  256  9e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.35 
 
 
597 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.1 
 
 
583 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.69 
 
 
578 aa  255  1.0000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.5 
 
 
588 aa  255  2.0000000000000002e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  31.21 
 
 
598 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 
574 aa  251  3e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  29.02 
 
 
588 aa  251  4e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  29.43 
 
 
574 aa  250  6e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.8 
 
 
593 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  27.78 
 
 
677 aa  248  1e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  28.64 
 
 
584 aa  249  1e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  29.72 
 
 
600 aa  249  1e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  27.44 
 
 
595 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  31.52 
 
 
573 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  31.52 
 
 
573 aa  246  6.999999999999999e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  29.48 
 
 
608 aa  246  9.999999999999999e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.23 
 
 
575 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.7 
 
 
581 aa  245  1.9999999999999999e-63  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  31.35 
 
 
581 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.02 
 
 
577 aa  244  5e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  31.18 
 
 
624 aa  243  6e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  48.78 
 
 
581 aa  241  2e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.02 
 
 
572 aa  241  2.9999999999999997e-62  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  32.48 
 
 
605 aa  239  8e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.99 
 
 
582 aa  239  1e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.02 
 
 
600 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.54 
 
 
593 aa  238  3e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  30.2 
 
 
599 aa  238  3e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28 
 
 
577 aa  237  4e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.37 
 
 
581 aa  237  5.0000000000000005e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.58 
 
 
577 aa  236  1.0000000000000001e-60  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  26.78 
 
 
607 aa  235  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  30.02 
 
 
580 aa  233  6e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  32.21 
 
 
586 aa  233  7.000000000000001e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  29.73 
 
 
571 aa  232  2e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.14 
 
 
585 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.51 
 
 
603 aa  231  3e-59  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  28.42 
 
 
1138 aa  231  3e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.27 
 
 
581 aa  231  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  27.32 
 
 
1194 aa  231  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  27.64 
 
 
576 aa  230  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.73 
 
 
585 aa  230  5e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  28.55 
 
 
579 aa  230  5e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  28.19 
 
 
596 aa  230  6e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 
571 aa  229  7e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  27.95 
 
 
577 aa  229  7e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.05 
 
 
571 aa  229  8e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.05 
 
 
571 aa  229  9e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  29.05 
 
 
571 aa  229  9e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.05 
 
 
571 aa  229  9e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  29.05 
 
 
571 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.05 
 
 
571 aa  229  1e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  29.43 
 
 
606 aa  229  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.15 
 
 
587 aa  229  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.82 
 
 
596 aa  228  2e-58  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  29.98 
 
 
597 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  31.72 
 
 
573 aa  228  3e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.89 
 
 
571 aa  227  4e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  27.88 
 
 
578 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.46 
 
 
612 aa  226  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.69 
 
 
579 aa  226  9e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  29.07 
 
 
608 aa  226  1e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>