More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1425 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  100 
 
 		 1138 aa  2272    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.26 
 
 		 1228 aa  514  1e-144  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.59 
 
 		 1194 aa  445  1e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.97 
 
 		 593 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.52 
 
 		 604 aa  347  8.999999999999999e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  30.88 
 
 		 1201 aa  346  1e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  30.82 
 
 		 1179 aa  340  8e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.38 
 
 		 592 aa  334  7.000000000000001e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.16 
 
 		 587 aa  332  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.1 
 
 		 580 aa  332  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.16 
 
 		 587 aa  332  2e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  35.71 
 
 		 611 aa  330  7e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  33 
 
 		 1179 aa  326  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.63 
 
 		 611 aa  322  1.9999999999999998e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.12 
 
 		 619 aa  320  7e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.21 
 
 		 593 aa  320  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.69 
 
 		 597 aa  318  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.16 
 
 		 609 aa  318  5e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.7 
 
 		 606 aa  317  8e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.47 
 
 		 595 aa  317  9.999999999999999e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 		 581 aa  315  2.9999999999999996e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.47 
 
 		 599 aa  314  4.999999999999999e-84  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.19 
 
 		 597 aa  310  1.0000000000000001e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  40.58 
 
 		 576 aa  307  1.0000000000000001e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.2 
 
 		 607 aa  306  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.81 
 
 		 602 aa  305  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.51 
 
 		 589 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4692  ABC transporter related protein  29.83 
 
 		 1218 aa  301  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.66 
 
 		 576 aa  300  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.6 
 
 		 1091 aa  300  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  25.3 
 
 		 1343 aa  298  3e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.45 
 
 		 584 aa  298  6e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.77 
 
 		 596 aa  296  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.45 
 
 		 573 aa  295  3e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  34.7 
 
 		 611 aa  294  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.38 
 
 		 588 aa  294  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.68 
 
 		 583 aa  293  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.88 
 
 		 578 aa  292  2e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.3 
 
 		 590 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.3 
 
 		 590 aa  291  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.31 
 
 		 596 aa  291  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  34.93 
 
 		 597 aa  290  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.05 
 
 		 598 aa  289  2e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  38.54 
 
 		 596 aa  288  5e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0881  ABC transporter component  35.06 
 
 		 589 aa  288  5e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.91 
 
 		 596 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.69 
 
 		 608 aa  285  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.47 
 
 		 590 aa  285  4.0000000000000003e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.76 
 
 		 577 aa  284  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.29 
 
 		 581 aa  282  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  33.56 
 
 		 677 aa  281  4e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  35.86 
 
 		 618 aa  280  1e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.03 
 
 		 588 aa  280  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  31.94 
 
 		 573 aa  280  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.33 
 
 		 599 aa  278  3e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.87 
 
 		 580 aa  278  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.42 
 
 		 577 aa  278  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.49 
 
 		 583 aa  276  1.0000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  31.76 
 
 		 573 aa  277  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.4 
 
 		 577 aa  277  1.0000000000000001e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.23 
 
 		 579 aa  275  3e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.91 
 
 		 581 aa  273  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  35.21 
 
 		 603 aa  273  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.07 
 
 		 600 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 579 aa  271  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.46 
 
 		 627 aa  270  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 		 593 aa  270  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  36.72 
 
 		 603 aa  270  1e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.78 
 
 		 579 aa  269  2e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.73 
 
 		 597 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  35.43 
 
 		 598 aa  268  5.999999999999999e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.43 
 
 		 608 aa  267  7e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.55 
 
 		 618 aa  267  8e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.78 
 
 		 579 aa  267  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  34.13 
 
 		 579 aa  267  8e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.81 
 
 		 605 aa  267  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.54 
 
 		 587 aa  266  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.12 
 
 		 583 aa  266  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.91 
 
 		 593 aa  265  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.4 
 
 		 993 aa  265  4e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.14 
 
 		 612 aa  264  6.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.9 
 
 		 606 aa  264  6.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  39.6 
 
 		 581 aa  264  8.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.48 
 
 		 1377 aa  263  1e-68  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  35.75 
 
 		 575 aa  263  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.25 
 
 		 577 aa  261  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.25 
 
 		 577 aa  261  7e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.83 
 
 		 574 aa  260  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.27 
 
 		 600 aa  260  9e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.62 
 
 		 568 aa  260  1e-67  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.26 
 
 		 588 aa  259  2e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.1 
 
 		 581 aa  258  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  35.33 
 
 		 600 aa  258  6e-67  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.27 
 
 		 572 aa  256  1.0000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.17 
 
 		 595 aa  255  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  29.27 
 
 		 1218 aa  255  3e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  29.23 
 
 		 1218 aa  254  7e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.99 
 
 		 578 aa  254  8.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.83 
 
 		 581 aa  254  9.000000000000001e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.77 
 
 		 577 aa  253  1e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>