More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2596 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  100 
 
 		 597 aa  1188    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  63.67 
 
 		 605 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  47.84 
 
 		 619 aa  435  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  43.23 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  42.81 
 
 		 603 aa  403  1e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  41.48 
 
 		 588 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.02 
 
 		 612 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  48.49 
 
 		 596 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  40.71 
 
 		 606 aa  389  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  39.18 
 
 		 598 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  38.09 
 
 		 597 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  39.26 
 
 		 578 aa  362  9e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  39.25 
 
 		 624 aa  349  6e-95  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  38.38 
 
 		 859 aa  347  4e-94  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  38.77 
 
 		 606 aa  318  2e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  34.65 
 
 		 619 aa  310  6.999999999999999e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.56 
 
 		 600 aa  308  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  31.01 
 
 		 590 aa  307  3e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.87 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.87 
 
 		 587 aa  305  1.0000000000000001e-81  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  36.38 
 
 		 579 aa  300  7e-80  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.16 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.82 
 
 		 581 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.94 
 
 		 611 aa  294  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.04 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.54 
 
 		 593 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.71 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.86 
 
 		 597 aa  287  2.9999999999999996e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.51 
 
 		 589 aa  287  5e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.22 
 
 		 592 aa  286  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  35.55 
 
 		 594 aa  284  4.0000000000000003e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.19 
 
 		 595 aa  283  8.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35.56 
 
 		 600 aa  282  1e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.73 
 
 		 596 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  37.98 
 
 		 591 aa  278  1e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.08 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.06 
 
 		 593 aa  277  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  30.9 
 
 		 584 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.82 
 
 		 575 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  33.56 
 
 		 608 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  29.67 
 
 		 597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  31.44 
 
 		 580 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  30.49 
 
 		 593 aa  274  3e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.23 
 
 		 576 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.37 
 
 		 592 aa  273  7e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  34.59 
 
 		 578 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.1 
 
 		 596 aa  272  1e-71  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  31.48 
 
 		 602 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.54 
 
 		 581 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.51 
 
 		 627 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.68 
 
 		 583 aa  270  5e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.77 
 
 		 607 aa  270  5.9999999999999995e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0186  ABC transporter related protein  36 
 
 		 623 aa  270  7e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.437337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  37.15 
 
 		 603 aa  270  7e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.74 
 
 		 574 aa  269  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.27 
 
 		 596 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.85 
 
 		 618 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.28 
 
 		 581 aa  269  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.68 
 
 		 1138 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.97 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6412  ABC transporter related  34.03 
 
 		 649 aa  268  2e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 		 588 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  37.8 
 
 		 677 aa  267  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.6 
 
 		 583 aa  267  4e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  35.5 
 
 		 581 aa  267  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.17 
 
 		 1194 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.2 
 
 		 618 aa  267  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  30.26 
 
 		 599 aa  267  5e-70  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  31.85 
 
 		 593 aa  267  5e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.44 
 
 		 582 aa  266  5.999999999999999e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.01 
 
 		 660 aa  266  1e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  34.74 
 
 		 601 aa  266  1e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.11 
 
 		 599 aa  263  6e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.2 
 
 		 568 aa  262  1e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  35.81 
 
 		 592 aa  262  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  31.84 
 
 		 608 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.01 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.01 
 
 		 577 aa  261  3e-68  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  32.72 
 
 		 581 aa  261  3e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.82 
 
 		 565 aa  261  3e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.52 
 
 		 556 aa  260  4e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.16 
 
 		 577 aa  260  5.0000000000000005e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.46 
 
 		 609 aa  260  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  33.79 
 
 		 589 aa  259  7e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.18 
 
 		 573 aa  259  9e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  38.11 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0391  ABC transporter-related protein  49.48 
 
 		 630 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00324467 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5732  transport protein MsbA  36.23 
 
 		 603 aa  258  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.4 
 
 		 587 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.52 
 
 		 601 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33.47 
 
 		 601 aa  257  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33.47 
 
 		 601 aa  257  5e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  34.03 
 
 		 579 aa  257  5e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0316  ABC transporter related  33.07 
 
 		 607 aa  257  5e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.291924 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.79 
 
 		 571 aa  256  6e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  34.35 
 
 		 576 aa  256  6e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  32.41 
 
 		 649 aa  256  8e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.89 
 
 		 577 aa  256  8e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  30.86 
 
 		 573 aa  256  8e-67  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>