More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4445 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  100 
 
 		 598 aa  1184    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  48.45 
 
 		 611 aa  520  1e-146  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  45.44 
 
 		 578 aa  457  1e-127  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  46.47 
 
 		 603 aa  450  1e-125  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  45.5 
 
 		 606 aa  444  1e-123  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.57 
 
 		 612 aa  439  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  49.6 
 
 		 596 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  43.18 
 
 		 588 aa  432  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  47.06 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.54 
 
 		 605 aa  388  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  39.08 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  38.96 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  40.92 
 
 		 624 aa  380  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  40.23 
 
 		 859 aa  368  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 590 aa  365  1e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  36.99 
 
 		 604 aa  362  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.11 
 
 		 597 aa  356  7.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.5 
 
 		 611 aa  352  8e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.45 
 
 		 592 aa  350  4e-95  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.58 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.63 
 
 		 587 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.63 
 
 		 587 aa  350  5e-95  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  36.35 
 
 		 602 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  35.04 
 
 		 619 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.83 
 
 		 573 aa  343  5e-93  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  41.52 
 
 		 606 aa  342  2e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.94 
 
 		 618 aa  340  4e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.08 
 
 		 597 aa  337  3.9999999999999995e-91  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.71 
 
 		 600 aa  334  3e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.42 
 
 		 596 aa  333  7.000000000000001e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  39.81 
 
 		 609 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  33.81 
 
 		 590 aa  320  7e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  36.25 
 
 		 595 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.63 
 
 		 590 aa  318  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.1 
 
 		 593 aa  316  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.98 
 
 		 581 aa  316  9.999999999999999e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.59 
 
 		 618 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.09 
 
 		 580 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  40.37 
 
 		 598 aa  310  6.999999999999999e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.57 
 
 		 589 aa  309  9e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.21 
 
 		 584 aa  309  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.73 
 
 		 576 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.07 
 
 		 593 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.15 
 
 		 609 aa  306  5.0000000000000004e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  36.72 
 
 		 596 aa  305  1.0000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.43 
 
 		 607 aa  303  6.000000000000001e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  36.61 
 
 		 593 aa  302  1e-80  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  36.51 
 
 		 608 aa  301  2e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  36.04 
 
 		 608 aa  301  3e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.48 
 
 		 677 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.59 
 
 		 627 aa  295  1e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  33.39 
 
 		 581 aa  293  6e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.68 
 
 		 583 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.75 
 
 		 580 aa  292  1e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.33 
 
 		 595 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.54 
 
 		 583 aa  289  8e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.78 
 
 		 578 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  37.71 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  33.15 
 
 		 599 aa  287  2.9999999999999996e-76  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  34.57 
 
 		 1194 aa  288  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.96 
 
 		 1228 aa  286  7e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  29.11 
 
 		 573 aa  283  4.0000000000000003e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 596 aa  283  9e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  29.11 
 
 		 573 aa  283  9e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.14 
 
 		 592 aa  281  2e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  37.14 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.94 
 
 		 576 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  31.03 
 
 		 584 aa  278  2e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.93 
 
 		 577 aa  278  2e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  32.79 
 
 		 581 aa  274  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12850  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.87 
 
 		 608 aa  271  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.813218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.36 
 
 		 593 aa  270  4e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.36 
 
 		 577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  33.46 
 
 		 577 aa  268  2.9999999999999995e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.74 
 
 		 581 aa  268  2.9999999999999995e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  32.65 
 
 		 587 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  33.74 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  38.86 
 
 		 597 aa  267  4e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  31.23 
 
 		 584 aa  267  5e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  35.36 
 
 		 1138 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32 
 
 		 1091 aa  266  8.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.28 
 
 		 575 aa  266  8.999999999999999e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.05 
 
 		 577 aa  265  2e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.99 
 
 		 584 aa  264  3e-69  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  31.88 
 
 		 587 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.06 
 
 		 577 aa  263  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.06 
 
 		 577 aa  263  8.999999999999999e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.69 
 
 		 568 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.47 
 
 		 588 aa  261  2e-68  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.6 
 
 		 579 aa  261  2e-68  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33 
 
 		 598 aa  261  3e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  30.79 
 
 		 579 aa  259  9e-68  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.16 
 
 		 588 aa  259  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  34.84 
 
 		 579 aa  259  1e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  34.5 
 
 		 605 aa  258  2e-67  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 		 582 aa  258  3e-67  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.35 
 
 		 565 aa  258  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  36.17 
 
 		 581 aa  257  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.21 
 
 		 581 aa  257  5e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  36.25 
 
 		 585 aa  257  5e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>