More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3268 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  100 
 
 		 581 aa  1132    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  47.65 
 
 		 577 aa  505  1e-141  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  47.68 
 
 		 596 aa  463  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  45.93 
 
 		 577 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1036  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 579 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0188433  normal  0.0545959 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  45.47 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  45.83 
 
 		 578 aa  396  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  43.29 
 
 		 581 aa  385  1e-106  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  44.42 
 
 		 575 aa  387  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2339  ABC transporter component  43.4 
 
 		 582 aa  385  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.667532  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  44.05 
 
 		 571 aa  372  1e-102  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  37.28 
 
 		 600 aa  360  5e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1491  ABC transporter related  37.19 
 
 		 584 aa  344  2e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  41.68 
 
 		 576 aa  333  5e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  42.14 
 
 		 607 aa  332  1e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  36.63 
 
 		 588 aa  330  3e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.63 
 
 		 606 aa  329  7e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.1 
 
 		 592 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2595  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  36.68 
 
 		 601 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.398767  normal  0.0147502 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  36.88 
 
 		 577 aa  318  2e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.4 
 
 		 579 aa  315  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.46 
 
 		 581 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.72 
 
 		 593 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  37.28 
 
 		 588 aa  307  4.0000000000000004e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.65 
 
 		 577 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  38.73 
 
 		 595 aa  305  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.14 
 
 		 587 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  40.68 
 
 		 577 aa  303  8.000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.1 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.39 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.33 
 
 		 595 aa  300  6e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  40.08 
 
 		 598 aa  299  8e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 		 577 aa  299  1e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.23 
 
 		 579 aa  298  2e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  33.91 
 
 		 591 aa  298  2e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.76 
 
 		 611 aa  297  4e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.65 
 
 		 583 aa  297  4e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.08 
 
 		 1091 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11379  drug ABC transporter ATP-binding protein  36.31 
 
 		 579 aa  293  6e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.73648 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.38 
 
 		 593 aa  293  7e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.01 
 
 		 618 aa  293  9e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.7 
 
 		 604 aa  292  1e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  38.1 
 
 		 600 aa  292  1e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 581 aa  290  6e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  32.97 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  38.24 
 
 		 611 aa  288  2e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  27.95 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  27.95 
 
 		 577 aa  288  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.42 
 
 		 597 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.71 
 
 		 590 aa  287  4e-76  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.34 
 
 		 589 aa  286  7e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.8 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  41.2 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  32.16 
 
 		 579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  36.03 
 
 		 592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.88 
 
 		 581 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.82 
 
 		 576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  37.68 
 
 		 579 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.64 
 
 		 584 aa  284  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  37.65 
 
 		 618 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  29.51 
 
 		 587 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  29.51 
 
 		 587 aa  283  4.0000000000000003e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  37.32 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  33.4 
 
 		 596 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  35.15 
 
 		 609 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  38.37 
 
 		 585 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  36.75 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.43 
 
 		 612 aa  281  2e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.24 
 
 		 581 aa  277  3e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.36 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.36 
 
 		 578 aa  278  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35.83 
 
 		 600 aa  276  7e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.19 
 
 		 593 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  38.13 
 
 		 603 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.59 
 
 		 609 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.21 
 
 		 593 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  37.17 
 
 		 606 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.49 
 
 		 580 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30 
 
 		 573 aa  273  8.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.05 
 
 		 580 aa  273  8.000000000000001e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  36.02 
 
 		 592 aa  273  8.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  38.29 
 
 		 565 aa  272  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.36 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.12 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  34.3 
 
 		 578 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.14 
 
 		 574 aa  271  2e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.08 
 
 		 602 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.66 
 
 		 619 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.94 
 
 		 585 aa  270  5e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.34 
 
 		 627 aa  270  5.9999999999999995e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.17 
 
 		 1228 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.11 
 
 		 597 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.77 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 606 aa  268  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  35.08 
 
 		 608 aa  268  2e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  35.99 
 
 		 611 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.57 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  35.82 
 
 		 611 aa  267  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.92 
 
 		 593 aa  267  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>