More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_54970 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_54970  ABC transporter  100 
 
 		 585 aa  1171    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479716  unclonable  4.5900199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  48.17 
 
 		 565 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  39.68 
 
 		 576 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  38.72 
 
 		 607 aa  349  1e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  38.49 
 
 		 592 aa  334  2e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.63 
 
 		 581 aa  324  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  40.64 
 
 		 596 aa  323  4e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 581 aa  320  3e-86  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  34.38 
 
 		 588 aa  316  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.38 
 
 		 579 aa  306  7e-82  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 579 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.74 
 
 		 595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.61 
 
 		 611 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  33.03 
 
 		 583 aa  303  6.000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.98 
 
 		 574 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  36.33 
 
 		 581 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  39.05 
 
 		 581 aa  301  3e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  31.48 
 
 		 592 aa  300  4e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.09 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.09 
 
 		 587 aa  300  6e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.11 
 
 		 587 aa  300  7e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.36 
 
 		 593 aa  299  9e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.67 
 
 		 574 aa  298  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  35.36 
 
 		 584 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.95 
 
 		 1228 aa  298  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  38.98 
 
 		 606 aa  297  4e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.18 
 
 		 1091 aa  296  6e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.9 
 
 		 581 aa  296  7e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.59 
 
 		 604 aa  296  7e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.51 
 
 		 597 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  37.85 
 
 		 598 aa  293  5e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  31.14 
 
 		 577 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  31.14 
 
 		 577 aa  293  7e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  36.76 
 
 		 611 aa  293  9e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.62 
 
 		 593 aa  292  1e-77  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 		 581 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 588 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  36.03 
 
 		 618 aa  289  1e-76  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  37.65 
 
 		 575 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.23 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.82 
 
 		 588 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.23 
 
 		 585 aa  287  5e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  36.05 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.12 
 
 		 602 aa  285  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.99 
 
 		 578 aa  286  1.0000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  32.82 
 
 		 579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  39.21 
 
 		 600 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.4 
 
 		 597 aa  283  6.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.96 
 
 		 577 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.34 
 
 		 598 aa  282  1e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  33.88 
 
 		 619 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.78 
 
 		 593 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.12 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.57 
 
 		 580 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.62 
 
 		 589 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.09 
 
 		 578 aa  278  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.8 
 
 		 582 aa  277  4e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.3 
 
 		 568 aa  276  6e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.9 
 
 		 611 aa  276  7e-73  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.57 
 
 		 606 aa  276  9e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  34.03 
 
 		 600 aa  276  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.94 
 
 		 596 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  35.79 
 
 		 600 aa  274  4.0000000000000004e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.51 
 
 		 603 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.16 
 
 		 618 aa  273  7e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  38.69 
 
 		 571 aa  273  8.000000000000001e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.69 
 
 		 581 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  33.81 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  35.28 
 
 		 1138 aa  271  2e-71  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  29.37 
 
 		 599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.26 
 
 		 583 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  33.91 
 
 		 605 aa  270  4e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  33.66 
 
 		 660 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  32.96 
 
 		 644 aa  270  5.9999999999999995e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  31.63 
 
 		 591 aa  270  8e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  30.81 
 
 		 596 aa  268  1e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  34.08 
 
 		 597 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33 
 
 		 577 aa  268  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.56 
 
 		 627 aa  266  5.999999999999999e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0882  ABC transporter, transmembrane region  31.72 
 
 		 592 aa  266  7e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  31.99 
 
 		 581 aa  266  8e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.2 
 
 		 609 aa  266  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 		 574 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.45 
 
 		 577 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.48 
 
 		 581 aa  265  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  32.77 
 
 		 677 aa  265  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  37.68 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  34.95 
 
 		 597 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.02 
 
 		 580 aa  263  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  29.83 
 
 		 574 aa  263  6.999999999999999e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  34.74 
 
 		 598 aa  263  8e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4444  ABC transporter related  35.19 
 
 		 577 aa  263  8.999999999999999e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.699286 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.69 
 
 		 593 aa  262  1e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  34.03 
 
 		 596 aa  262  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.74 
 
 		 1194 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 620 aa  262  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  32.28 
 
 		 590 aa  261  2e-68  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.72 
 
 		 576 aa  261  2e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 606 aa  261  2e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.56 
 
 		 577 aa  261  2e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>