More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3017 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  60.88 
 
 		 608 aa  647    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  100 
 
 		 600 aa  1197    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  55.75 
 
 		 600 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2441  ABC transporter related  63.41 
 
 		 597 aa  550  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00999176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  48.73 
 
 		 590 aa  546  1e-154  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  41.28 
 
 		 611 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  39.03 
 
 		 604 aa  384  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  37.22 
 
 		 592 aa  368  1e-100  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.1 
 
 		 597 aa  367  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  40.68 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  44.99 
 
 		 606 aa  364  3e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  42.12 
 
 		 598 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.68 
 
 		 597 aa  353  4e-96  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  43.11 
 
 		 618 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  39.42 
 
 		 593 aa  350  4e-95  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.95 
 
 		 573 aa  347  3e-94  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  39.02 
 
 		 593 aa  347  3e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  40.32 
 
 		 619 aa  347  4e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  38.68 
 
 		 576 aa  347  5e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  32.49 
 
 		 599 aa  345  1e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.8 
 
 		 589 aa  345  1e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  31.06 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  31.06 
 
 		 587 aa  344  2.9999999999999997e-93  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  38.72 
 
 		 596 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.08 
 
 		 1091 aa  338  9.999999999999999e-92  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  42.97 
 
 		 596 aa  338  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  40.16 
 
 		 595 aa  335  2e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.11 
 
 		 618 aa  334  3e-90  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  37.38 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  36.22 
 
 		 588 aa  332  1e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  37.76 
 
 		 602 aa  331  3e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  40.3 
 
 		 1228 aa  326  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.86 
 
 		 593 aa  326  7e-88  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 606 aa  326  8.000000000000001e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  37.96 
 
 		 578 aa  322  9.999999999999999e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  35.11 
 
 		 590 aa  322  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.81 
 
 		 590 aa  321  1.9999999999999998e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.72 
 
 		 612 aa  321  3e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  38.7 
 
 		 598 aa  318  1e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  37.2 
 
 		 580 aa  318  1e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  36.82 
 
 		 609 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  36.83 
 
 		 609 aa  318  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.13 
 
 		 577 aa  316  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.26 
 
 		 583 aa  315  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.23 
 
 		 583 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.05 
 
 		 576 aa  314  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  37.67 
 
 		 624 aa  310  5e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.88 
 
 		 580 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  40.14 
 
 		 619 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  40.08 
 
 		 603 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.95 
 
 		 581 aa  307  4.0000000000000004e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  30.7 
 
 		 581 aa  306  6e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37.94 
 
 		 571 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.62 
 
 		 581 aa  306  1.0000000000000001e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.8 
 
 		 605 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  36.86 
 
 		 588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.63 
 
 		 579 aa  303  6.000000000000001e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.78 
 
 		 592 aa  300  6e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.74 
 
 		 596 aa  299  8e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 581 aa  298  2e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.24 
 
 		 577 aa  298  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.24 
 
 		 577 aa  298  3e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.25 
 
 		 587 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.5 
 
 		 627 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.57 
 
 		 588 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.76 
 
 		 579 aa  296  1e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  39.1 
 
 		 597 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.13 
 
 		 579 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.48 
 
 		 577 aa  294  3e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34 
 
 		 579 aa  294  4e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.08 
 
 		 596 aa  293  9e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  41.38 
 
 		 581 aa  292  1e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  36.35 
 
 		 605 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.09 
 
 		 608 aa  290  5.0000000000000004e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  37.18 
 
 		 677 aa  290  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  35.35 
 
 		 599 aa  290  6e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.57 
 
 		 574 aa  290  7e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.91 
 
 		 595 aa  288  2e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.68 
 
 		 596 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.47 
 
 		 573 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.67 
 
 		 573 aa  286  8e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.16 
 
 		 577 aa  286  8e-76  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  40.83 
 
 		 859 aa  286  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  37.11 
 
 		 593 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  36.38 
 
 		 607 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.99 
 
 		 568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.45 
 
 		 577 aa  284  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  36.07 
 
 		 600 aa  283  7.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.03 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.57 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.42 
 
 		 581 aa  279  1e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  32.5 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  32.5 
 
 		 578 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  37.53 
 
 		 571 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  37.21 
 
 		 565 aa  278  2e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  35.77 
 
 		 597 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.53 
 
 		 582 aa  277  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  33.39 
 
 		 598 aa  276  6e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.85 
 
 		 598 aa  276  6e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.14 
 
 		 582 aa  276  7e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>