More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_3269 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  100 
 
 		 588 aa  1162    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  48.78 
 
 		 578 aa  486  1e-136  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3091  ABC transporter related  46.38 
 
 		 624 aa  479  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  44.31 
 
 		 611 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  44.33 
 
 		 603 aa  395  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  42.96 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  45.21 
 
 		 619 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2596  ABC transporter, permease/ATP-binding protein, putative  41.48 
 
 		 597 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.588652  normal  0.0388843 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.09 
 
 		 592 aa  372  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  43.66 
 
 		 859 aa  370  1e-101  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  40.72 
 
 		 606 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  39.19 
 
 		 612 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4420  ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.97 
 
 		 605 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.640152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  45.03 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  38.14 
 
 		 597 aa  362  9e-99  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  37.35 
 
 		 611 aa  355  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  37.07 
 
 		 590 aa  351  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  35.54 
 
 		 604 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  35.38 
 
 		 580 aa  347  5e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.46 
 
 		 595 aa  345  1e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  36.64 
 
 		 573 aa  339  9.999999999999999e-92  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.87 
 
 		 587 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.87 
 
 		 587 aa  329  9e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.99 
 
 		 597 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  34.36 
 
 		 619 aa  327  3e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  35.4 
 
 		 593 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  34.97 
 
 		 609 aa  326  6e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  35.97 
 
 		 596 aa  325  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.57 
 
 		 618 aa  324  2e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  36.22 
 
 		 600 aa  322  9.999999999999999e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.19 
 
 		 584 aa  320  5e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  37.41 
 
 		 593 aa  320  6e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.33 
 
 		 581 aa  318  1e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 627 aa  317  3e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  36.35 
 
 		 609 aa  316  9e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.36 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.85 
 
 		 589 aa  313  4.999999999999999e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  35.9 
 
 		 600 aa  313  4.999999999999999e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  39.65 
 
 		 598 aa  312  1e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.12 
 
 		 602 aa  310  4e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  38.03 
 
 		 576 aa  309  8e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  35.2 
 
 		 608 aa  306  7e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 581 aa  306  8.000000000000001e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  39.36 
 
 		 606 aa  305  2.0000000000000002e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.57 
 
 		 576 aa  305  2.0000000000000002e-81  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  37.9 
 
 		 1228 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.68 
 
 		 596 aa  302  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  33.11 
 
 		 581 aa  300  4e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.06 
 
 		 573 aa  298  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  30.02 
 
 		 599 aa  298  2e-79  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.55 
 
 		 618 aa  297  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.12 
 
 		 595 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  32.51 
 
 		 573 aa  296  7e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  35.93 
 
 		 608 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.87 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.02 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.47 
 
 		 599 aa  294  2e-78  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.01 
 
 		 574 aa  289  9e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  30.53 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  32.99 
 
 		 579 aa  286  5.999999999999999e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.9 
 
 		 1091 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.74 
 
 		 577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.8 
 
 		 592 aa  285  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.27 
 
 		 1194 aa  284  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  36.05 
 
 		 677 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.33 
 
 		 577 aa  281  2e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  37.28 
 
 		 607 aa  281  2e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  34.39 
 
 		 581 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.11 
 
 		 583 aa  279  1e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.19 
 
 		 577 aa  279  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.03 
 
 		 588 aa  278  2e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  38.41 
 
 		 581 aa  278  3e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.46 
 
 		 581 aa  277  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.84 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.81 
 
 		 581 aa  277  5e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  36.56 
 
 		 565 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.01 
 
 		 587 aa  276  1.0000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  29.35 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  29.35 
 
 		 577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  34.66 
 
 		 598 aa  274  4.0000000000000004e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.1 
 
 		 596 aa  273  9e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 578 aa  272  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.53 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  36.72 
 
 		 577 aa  271  2.9999999999999997e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.48 
 
 		 597 aa  270  4e-71  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.48 
 
 		 597 aa  270  5e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.44 
 
 		 568 aa  269  1e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.62 
 
 		 581 aa  268  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  33.87 
 
 		 585 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.87 
 
 		 585 aa  268  2e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.64 
 
 		 578 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1825  ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  39.05 
 
 		 576 aa  268  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  34.2 
 
 		 1138 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.26 
 
 		 580 aa  266  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  34.54 
 
 		 623 aa  265  2e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.34 
 
 		 582 aa  265  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  38.76 
 
 		 579 aa  263  4.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.37 
 
 		 581 aa  263  6e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  32.2 
 
 		 596 aa  263  8e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1353  ABC transporter related  33.4 
 
 		 612 aa  263  8e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.592078  normal  0.01379 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>