More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0880 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1179    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  45.14 
 
 
581 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  41.6 
 
 
579 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  41.35 
 
 
581 aa  437  1e-121  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  45.26 
 
 
578 aa  428  1e-118  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  39.41 
 
 
593 aa  409  1e-113  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  37.35 
 
 
588 aa  385  1e-105  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  37.3 
 
 
587 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  39.35 
 
 
578 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  39.35 
 
 
578 aa  382  1e-104  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.81 
 
 
579 aa  377  1e-103  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.27 
 
 
577 aa  370  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  35.2 
 
 
581 aa  366  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.85 
 
 
576 aa  367  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  38.49 
 
 
577 aa  366  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.45 
 
 
577 aa  365  2e-99  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.65 
 
 
579 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  36.36 
 
 
1228 aa  359  9e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  35.92 
 
 
577 aa  357  2.9999999999999997e-97  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.8 
 
 
581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  33.73 
 
 
611 aa  354  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  37.27 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  37.27 
 
 
577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  35.11 
 
 
583 aa  353  4e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  37.07 
 
 
574 aa  353  5e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.42 
 
 
574 aa  350  4e-95  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.3 
 
 
568 aa  350  6e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  35.58 
 
 
597 aa  348  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35.79 
 
 
592 aa  348  1e-94  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  38.73 
 
 
579 aa  348  1e-94  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  34.38 
 
 
574 aa  347  2e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  36.61 
 
 
581 aa  347  4e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.39 
 
 
588 aa  346  6e-94  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.61 
 
 
584 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  31.65 
 
 
607 aa  340  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.88 
 
 
581 aa  339  8e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 
603 aa  339  9e-92  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  35.71 
 
 
595 aa  333  4e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.31 
 
 
597 aa  333  6e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.31 
 
 
576 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.48 
 
 
573 aa  330  3e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  34.69 
 
 
565 aa  330  3e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.21 
 
 
593 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  36.68 
 
 
598 aa  329  8e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  32.48 
 
 
585 aa  327  3e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.17 
 
 
582 aa  326  6e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.31 
 
 
585 aa  326  8.000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.27 
 
 
581 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.07 
 
 
593 aa  325  1e-87  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.67 
 
 
581 aa  324  2e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  34.94 
 
 
577 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  35.63 
 
 
606 aa  321  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  31.92 
 
 
596 aa  320  3.9999999999999996e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.26 
 
 
581 aa  318  2e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.87 
 
 
599 aa  317  4e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  34.29 
 
 
592 aa  317  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 
572 aa  316  6e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.1 
 
 
580 aa  317  6e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.08 
 
 
595 aa  316  7e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3043  ABC transporter related  33.08 
 
 
598 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.910106 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.54 
 
 
602 aa  314  3.9999999999999997e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  34.27 
 
 
581 aa  313  6.999999999999999e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.58 
 
 
590 aa  310  4e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.08 
 
 
587 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.08 
 
 
587 aa  310  5e-83  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.53 
 
 
580 aa  308  1.0000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  34.58 
 
 
590 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
578 aa  308  1.0000000000000001e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.51 
 
 
604 aa  308  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.95 
 
 
574 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.25 
 
 
585 aa  306  9.000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  29.93 
 
 
600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.99 
 
 
593 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.73 
 
 
589 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  31.47 
 
 
573 aa  301  2e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.8 
 
 
1091 aa  300  7e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2824  ABC transporter related protein  33 
 
 
571 aa  298  1e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.866997  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.85 
 
 
627 aa  298  1e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  31.15 
 
 
590 aa  299  1e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.84 
 
 
581 aa  297  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  35.74 
 
 
605 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.92 
 
 
596 aa  297  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  31.63 
 
 
600 aa  297  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  33.6 
 
 
608 aa  296  8e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  34.13 
 
 
618 aa  296  8e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
575 aa  295  2e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  32.96 
 
 
573 aa  295  2e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  31.65 
 
 
619 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4512  ABC transporter component  31.93 
 
 
575 aa  293  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.5335  normal  0.299966 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  32.06 
 
 
1194 aa  293  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4045  ABC transporter related  29.65 
 
 
582 aa  292  9e-78  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2373  ABC transporter related protein  33.85 
 
 
578 aa  292  1e-77  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.267302  normal  0.0804864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.06 
 
 
573 aa  291  2e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  32.14 
 
 
609 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  32.31 
 
 
608 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  34.06 
 
 
573 aa  290  3e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3018  ABC transporter related  36.49 
 
 
595 aa  291  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1572  ABC transporter related protein  33.82 
 
 
591 aa  290  4e-77  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.722294  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  33.6 
 
 
588 aa  290  4e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.56 
 
 
593 aa  288  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>