More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0818 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
573 aa  1170    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  51.66 
 
 
573 aa  619  1e-176  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  50.79 
 
 
573 aa  609  1e-173  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  48.35 
 
 
573 aa  555  1e-157  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.3 
 
 
568 aa  435  1e-120  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  37.79 
 
 
574 aa  403  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.81 
 
 
580 aa  387  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.1 
 
 
579 aa  377  1e-103  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  38.5 
 
 
578 aa  375  1e-102  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 
603 aa  366  1e-100  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  35.24 
 
 
581 aa  363  4e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
579 aa  360  5e-98  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  32.81 
 
 
1228 aa  340  2.9999999999999998e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  33.22 
 
 
581 aa  330  6e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  37.25 
 
 
579 aa  322  9.999999999999999e-87  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  32.18 
 
 
588 aa  308  3e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  34.06 
 
 
597 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  34.77 
 
 
577 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  34.77 
 
 
577 aa  296  5e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  32.89 
 
 
604 aa  296  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.69 
 
 
577 aa  292  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
581 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.81 
 
 
588 aa  286  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.8 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
599 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  35.1 
 
 
578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  35.1 
 
 
578 aa  284  3.0000000000000004e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  32.49 
 
 
593 aa  283  8.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  31.94 
 
 
593 aa  282  9e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.27 
 
 
593 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  29.56 
 
 
607 aa  280  6e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.16 
 
 
593 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  35 
 
 
592 aa  273  5.000000000000001e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  32.54 
 
 
581 aa  272  9e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.14 
 
 
572 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.24 
 
 
627 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.61 
 
 
582 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  29.45 
 
 
581 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  34.5 
 
 
596 aa  272  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  32.1 
 
 
611 aa  271  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.08 
 
 
1091 aa  270  5e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 
579 aa  270  8e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  30.48 
 
 
587 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.39 
 
 
575 aa  268  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.28 
 
 
595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 
597 aa  266  8e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  32.02 
 
 
593 aa  264  3e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.51 
 
 
577 aa  264  3e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.38 
 
 
581 aa  263  4.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  30.78 
 
 
581 aa  263  6e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  30.59 
 
 
576 aa  263  8.999999999999999e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  31.15 
 
 
581 aa  262  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  29.96 
 
 
574 aa  261  3e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.64 
 
 
576 aa  261  3e-68  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  34.28 
 
 
581 aa  260  4e-68  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  29.11 
 
 
579 aa  261  4e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.55 
 
 
599 aa  259  9e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  31.52 
 
 
577 aa  259  1e-67  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.44 
 
 
583 aa  259  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.63 
 
 
587 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.63 
 
 
587 aa  259  1e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.09 
 
 
556 aa  257  5e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  34.29 
 
 
595 aa  256  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  31.85 
 
 
584 aa  257  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  32.88 
 
 
597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  30.89 
 
 
605 aa  255  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  30.31 
 
 
582 aa  256  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  32.88 
 
 
597 aa  255  1.0000000000000001e-66  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  34.09 
 
 
586 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  33.27 
 
 
594 aa  254  2.0000000000000002e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  31.31 
 
 
1194 aa  254  3e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  35.07 
 
 
579 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  31.17 
 
 
598 aa  253  5.000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.23 
 
 
580 aa  252  1e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  33.47 
 
 
595 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  30.7 
 
 
585 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 
585 aa  252  1e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.79 
 
 
583 aa  251  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.62 
 
 
574 aa  252  2e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  30.25 
 
 
619 aa  252  2e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  31.04 
 
 
609 aa  251  2e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.63 
 
 
571 aa  251  3e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.73 
 
 
581 aa  251  3e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.98 
 
 
589 aa  251  3e-65  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.29 
 
 
588 aa  250  6e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.43 
 
 
574 aa  248  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.64 
 
 
596 aa  248  2e-64  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.08 
 
 
622 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  30.07 
 
 
606 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.24 
 
 
578 aa  248  3e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000242  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease component  30.93 
 
 
586 aa  248  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.02 
 
 
589 aa  248  3e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  31.67 
 
 
600 aa  247  4e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  33.9 
 
 
601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  31.8 
 
 
614 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  33.47 
 
 
596 aa  247  4.9999999999999997e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  32.23 
 
 
617 aa  246  6e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  33.4 
 
 
618 aa  246  6e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  32.16 
 
 
573 aa  246  9e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  33.4 
 
 
618 aa  246  9e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>