More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_25700 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 581 aa  1184    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  50.09 
 
 		 593 aa  571  1e-161  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.9 
 
 		 588 aa  404  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  36.44 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.18 
 
 		 577 aa  399  9.999999999999999e-111  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  36.67 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  36.67 
 
 		 578 aa  398  1e-109  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  37.65 
 
 		 579 aa  395  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.91 
 
 		 574 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  35.58 
 
 		 587 aa  390  1e-107  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  40.34 
 
 		 581 aa  383  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.84 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.15 
 
 		 582 aa  370  1e-101  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.37 
 
 		 577 aa  369  1e-101  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  38.03 
 
 		 605 aa  365  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.01 
 
 		 577 aa  355  1e-96  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.75 
 
 		 574 aa  348  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.07 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.07 
 
 		 577 aa  347  3e-94  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  34.86 
 
 		 581 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.39 
 
 		 581 aa  335  1e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.72 
 
 		 581 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.23 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.33 
 
 		 579 aa  321  3e-86  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  35.49 
 
 		 592 aa  320  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  33.74 
 
 		 576 aa  318  2e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  33.33 
 
 		 592 aa  315  9.999999999999999e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.24 
 
 		 593 aa  310  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.54 
 
 		 577 aa  310  2.9999999999999997e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  34.5 
 
 		 580 aa  310  5e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.34 
 
 		 581 aa  310  6.999999999999999e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  35.46 
 
 		 579 aa  308  1.0000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 		 597 aa  308  2.0000000000000002e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.28 
 
 		 602 aa  308  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  32.35 
 
 		 578 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  31.46 
 
 		 597 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2008  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.82 
 
 		 585 aa  302  1e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  34 
 
 		 619 aa  302  1e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.36 
 
 		 604 aa  302  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.39 
 
 		 589 aa  301  2e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  32.16 
 
 		 611 aa  301  3e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.06 
 
 		 618 aa  301  3e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.78 
 
 		 568 aa  300  4e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.03 
 
 		 581 aa  300  5e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.25 
 
 		 581 aa  300  6e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  38.5 
 
 		 1228 aa  297  3e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  32.91 
 
 		 583 aa  297  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 590 aa  296  5e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  35.95 
 
 		 598 aa  295  2e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  33.69 
 
 		 575 aa  294  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.53 
 
 		 582 aa  293  5e-78  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  33.22 
 
 		 565 aa  293  8e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 		 1091 aa  291  2e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  34.01 
 
 		 606 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  32.05 
 
 		 587 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  32.05 
 
 		 587 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 		 581 aa  290  4e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.77 
 
 		 585 aa  290  6e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.72 
 
 		 627 aa  289  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.94 
 
 		 580 aa  289  1e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  32.82 
 
 		 593 aa  288  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  35.65 
 
 		 609 aa  288  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  35.57 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  34.88 
 
 		 611 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  36.55 
 
 		 574 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.94 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.94 
 
 		 578 aa  285  2.0000000000000002e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  32.99 
 
 		 637 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  34.52 
 
 		 599 aa  284  4.0000000000000003e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.88 
 
 		 611 aa  284  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  38.8 
 
 		 595 aa  283  4.0000000000000003e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.74 
 
 		 603 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.9 
 
 		 583 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  34.2 
 
 		 578 aa  283  5.000000000000001e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  33.85 
 
 		 581 aa  283  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0394  ABC transporter related  33.9 
 
 		 610 aa  283  7.000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.156666 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  34.92 
 
 		 611 aa  283  9e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.51 
 
 		 611 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.09 
 
 		 584 aa  282  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  35.04 
 
 		 608 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 		 595 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.54 
 
 		 606 aa  281  2e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  35.83 
 
 		 600 aa  281  2e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.44 
 
 		 578 aa  281  3e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 598 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.83 
 
 		 593 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 		 618 aa  280  6e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.64 
 
 		 576 aa  280  8e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.76 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  31.08 
 
 		 573 aa  278  2e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.31 
 
 		 577 aa  277  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  32.63 
 
 		 573 aa  277  3e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  34.35 
 
 		 609 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  34.81 
 
 		 588 aa  277  5e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.82 
 
 		 573 aa  276  7e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.73 
 
 		 609 aa  276  7e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  32.73 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4419  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.54 
 
 		 581 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.14 
 
 		 585 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>