More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_1954 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  89.1 
 
 
578 aa  1044    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  59.1 
 
 
586 aa  726    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.27 
 
 
586 aa  728    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  59.1 
 
 
586 aa  723    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.27 
 
 
586 aa  726    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  58.75 
 
 
586 aa  718    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  59.27 
 
 
586 aa  726    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  59.1 
 
 
586 aa  723    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.27 
 
 
586 aa  726    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  63.32 
 
 
584 aa  730    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  59.1 
 
 
586 aa  723    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  59.1 
 
 
586 aa  723    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  100 
 
 
578 aa  1172    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  59.27 
 
 
586 aa  706    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  100 
 
 
578 aa  1172    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  38.26 
 
 
582 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.38 
 
 
598 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.75 
 
 
600 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  36.81 
 
 
571 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  41.8 
 
 
556 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  38.62 
 
 
566 aa  402  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.45 
 
 
566 aa  401  9.999999999999999e-111  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.09 
 
 
617 aa  401  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  38.32 
 
 
580 aa  398  1e-109  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  37.13 
 
 
586 aa  398  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.51 
 
 
598 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.85 
 
 
577 aa  397  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.46 
 
 
597 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  36.98 
 
 
571 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  38.97 
 
 
572 aa  392  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.97 
 
 
572 aa  389  1e-107  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  39.14 
 
 
572 aa  389  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  38.38 
 
 
579 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  38.97 
 
 
572 aa  391  1e-107  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  38.37 
 
 
600 aa  392  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.61 
 
 
571 aa  389  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  36.27 
 
 
591 aa  391  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  37.29 
 
 
579 aa  387  1e-106  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  39.72 
 
 
600 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.54 
 
 
597 aa  387  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  37.24 
 
 
618 aa  388  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
572 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.79 
 
 
596 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.82 
 
 
584 aa  382  1e-105  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  37.46 
 
 
588 aa  383  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.38 
 
 
602 aa  382  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
575 aa  385  1e-105  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.26 
 
 
571 aa  384  1e-105  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.21 
 
 
601 aa  380  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.26 
 
 
571 aa  381  1e-104  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  37.09 
 
 
571 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.27 
 
 
587 aa  380  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.09 
 
 
571 aa  380  1e-104  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  36.92 
 
 
576 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  37.67 
 
 
581 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  44.64 
 
 
468 aa  380  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.59 
 
 
585 aa  381  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  35.84 
 
 
594 aa  377  1e-103  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.47 
 
 
580 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  38.32 
 
 
581 aa  379  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  37.37 
 
 
590 aa  379  1e-103  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.6 
 
 
614 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  37.26 
 
 
598 aa  372  1e-102  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  40.68 
 
 
588 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.7 
 
 
597 aa  374  1e-102  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  41.77 
 
 
578 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  39.5 
 
 
641 aa  375  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.7 
 
 
589 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.51 
 
 
572 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  37.9 
 
 
606 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  35.42 
 
 
602 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.04 
 
 
567 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  36.03 
 
 
580 aa  369  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  35.68 
 
 
584 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.63 
 
 
582 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  36.28 
 
 
589 aa  370  1e-101  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  37.69 
 
 
567 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  35.41 
 
 
587 aa  372  1e-101  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  36.96 
 
 
584 aa  372  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  35.69 
 
 
597 aa  367  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  35.36 
 
 
603 aa  368  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.68 
 
 
575 aa  368  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.64 
 
 
580 aa  369  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.93 
 
 
581 aa  368  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  36.38 
 
 
582 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  36.38 
 
 
582 aa  367  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.24 
 
 
583 aa  367  1e-100  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0047  ABC transporter-like protein  36.49 
 
 
586 aa  366  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.99996 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  36.29 
 
 
608 aa  369  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  36.38 
 
 
610 aa  365  1e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  36.43 
 
 
593 aa  365  1e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  36.7 
 
 
617 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  38.15 
 
 
588 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.52 
 
 
597 aa  363  3e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  35.94 
 
 
588 aa  363  6e-99  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>