More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4770 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  100 
 
 
593 aa  1212    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  56.72 
 
 
595 aa  662    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  47.82 
 
 
587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  47.82 
 
 
587 aa  575  1.0000000000000001e-163  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  46.1 
 
 
580 aa  515  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.64 
 
 
597 aa  509  1e-143  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.17 
 
 
581 aa  483  1e-135  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  44.68 
 
 
609 aa  481  1e-134  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  42.71 
 
 
608 aa  472  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  42.76 
 
 
619 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  42.5 
 
 
599 aa  449  1e-125  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.93 
 
 
589 aa  446  1.0000000000000001e-124  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  40.43 
 
 
573 aa  437  1e-121  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.08 
 
 
583 aa  437  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42 
 
 
583 aa  439  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.77 
 
 
580 aa  435  1e-121  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  40.21 
 
 
573 aa  435  1e-120  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.18 
 
 
1091 aa  435  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  40.91 
 
 
576 aa  434  1e-120  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.16 
 
 
596 aa  421  1e-116  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  38.2 
 
 
597 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  39.09 
 
 
592 aa  380  1e-104  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  38.29 
 
 
598 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.32 
 
 
604 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  38.42 
 
 
618 aa  367  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.88 
 
 
611 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  39.57 
 
 
590 aa  369  1e-100  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.44 
 
 
590 aa  365  1e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  35.44 
 
 
590 aa  364  2e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  35.89 
 
 
602 aa  362  1e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  37.99 
 
 
576 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  36.73 
 
 
606 aa  357  2.9999999999999997e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  37.25 
 
 
593 aa  353  5.9999999999999994e-96  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  37.44 
 
 
599 aa  350  3e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3042  ABC transporter related  35.78 
 
 
611 aa  349  9e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.915781 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.48 
 
 
584 aa  349  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  35.53 
 
 
611 aa  340  4e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  37.78 
 
 
581 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.59 
 
 
593 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  35.48 
 
 
573 aa  335  1e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.83 
 
 
627 aa  335  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  39.02 
 
 
600 aa  333  4e-90  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  33.69 
 
 
1194 aa  332  1e-89  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  36.97 
 
 
1138 aa  328  2.0000000000000001e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  35.4 
 
 
588 aa  327  4.0000000000000003e-88  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  36.64 
 
 
579 aa  326  6e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1331  ABC transporter related  34.05 
 
 
596 aa  325  2e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.92 
 
 
572 aa  323  7e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  35.44 
 
 
578 aa  318  2e-85  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1440  ABC transporter related  37.54 
 
 
608 aa  316  6e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  37.13 
 
 
609 aa  316  6e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.43 
 
 
618 aa  314  2.9999999999999996e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  32.42 
 
 
596 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  37.57 
 
 
596 aa  313  6.999999999999999e-84  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.5 
 
 
612 aa  311  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  35.56 
 
 
588 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  35.97 
 
 
606 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  35.41 
 
 
1228 aa  311  2.9999999999999997e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3268  ABC transporter related protein  36.31 
 
 
581 aa  308  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0537303 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 
578 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  37.91 
 
 
592 aa  307  4.0000000000000004e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0864  ABC transporter, transmembrane region  34.4 
 
 
603 aa  306  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.62 
 
 
595 aa  306  9.000000000000001e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.32 
 
 
581 aa  306  9.000000000000001e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4046  ABC transporter related  37.23 
 
 
596 aa  306  1.0000000000000001e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1490  ABC transporter related  35.14 
 
 
597 aa  306  1.0000000000000001e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  34.78 
 
 
677 aa  304  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.8 
 
 
581 aa  303  6.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  34.67 
 
 
607 aa  301  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.74 
 
 
600 aa  300  4e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  33.6 
 
 
577 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  34.16 
 
 
587 aa  299  1e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  33.6 
 
 
577 aa  299  1e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.71 
 
 
588 aa  296  5e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.42 
 
 
577 aa  296  1e-78  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  35.21 
 
 
577 aa  295  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  33.2 
 
 
583 aa  295  2e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  31.99 
 
 
579 aa  294  3e-78  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.99 
 
 
574 aa  292  9e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  37.38 
 
 
578 aa  293  9e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.67 
 
 
568 aa  291  2e-77  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.73 
 
 
579 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  32.76 
 
 
598 aa  291  3e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  33.91 
 
 
581 aa  289  9e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.2 
 
 
578 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.2 
 
 
578 aa  286  5e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  33.08 
 
 
600 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.87 
 
 
574 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1441  ABC transporter related  36.31 
 
 
606 aa  286  9e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.279774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  34.95 
 
 
576 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  34.86 
 
 
577 aa  285  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1035  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
619 aa  283  4.0000000000000003e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  decreased coverage  0.00381243  normal  0.0281832 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1630  ABC transporter related  33.27 
 
 
608 aa  283  5.000000000000001e-75  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.27 
 
 
581 aa  283  5.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.49 
 
 
573 aa  283  8.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.46 
 
 
577 aa  282  1e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.27 
 
 
603 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.83 
 
 
581 aa  280  4e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  34.82 
 
 
579 aa  280  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  32.81 
 
 
574 aa  280  6e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>