More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0896 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 595 aa  1212    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  38.8 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  38.18 
 
 		 604 aa  390  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.84 
 
 		 597 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  38.7 
 
 		 599 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.57 
 
 		 592 aa  378  1e-103  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.11 
 
 		 584 aa  354  2e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.96 
 
 		 580 aa  343  5.999999999999999e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  34.58 
 
 		 596 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  37.68 
 
 		 579 aa  332  2e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 593 aa  330  4e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.33 
 
 		 587 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.33 
 
 		 587 aa  330  6e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.15 
 
 		 597 aa  329  8e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.98 
 
 		 589 aa  326  7e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1600  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.68 
 
 		 583 aa  323  5e-87  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.38 
 
 		 602 aa  322  1.9999999999999998e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 590 aa  319  7.999999999999999e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.82 
 
 		 619 aa  319  1e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  35.88 
 
 		 579 aa  317  3e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  38.31 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  32.12 
 
 		 576 aa  315  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.14 
 
 		 593 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.09 
 
 		 581 aa  315  1.9999999999999998e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.78 
 
 		 618 aa  314  3.9999999999999997e-84  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.2 
 
 		 590 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.01 
 
 		 1091 aa  311  2e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  34.2 
 
 		 590 aa  310  5e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.4 
 
 		 576 aa  309  6.999999999999999e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  31.62 
 
 		 593 aa  309  9e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  31.04 
 
 		 677 aa  308  2.0000000000000002e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.09 
 
 		 581 aa  307  3e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.22 
 
 		 627 aa  306  6e-82  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.02 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.1 
 
 		 580 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  31.45 
 
 		 598 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.44 
 
 		 1228 aa  305  2.0000000000000002e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 578 aa  304  3.0000000000000004e-81  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.09 
 
 		 574 aa  303  7.000000000000001e-81  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  30.12 
 
 		 588 aa  301  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  30.71 
 
 		 607 aa  300  6e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.07 
 
 		 609 aa  299  8e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0707  ABC transporter related  32.89 
 
 		 584 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0139832  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  32.6 
 
 		 608 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 		 572 aa  297  3e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  31.89 
 
 		 618 aa  295  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0819  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.71 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.608136  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.88 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.88 
 
 		 578 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.87 
 
 		 583 aa  293  8e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3553  ABC transporter related  32.25 
 
 		 611 aa  293  8e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.62 
 
 		 603 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.72 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1436  ABC transporter related  33.4 
 
 		 609 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0538238  normal  0.545859 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  33.6 
 
 		 579 aa  291  2e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  30.95 
 
 		 599 aa  290  4e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0627  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.83 
 
 		 584 aa  290  4e-77  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.746647  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  31.38 
 
 		 595 aa  290  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  35.45 
 
 		 578 aa  289  9e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.81 
 
 		 581 aa  288  1e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  31.88 
 
 		 606 aa  288  1e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.2 
 
 		 577 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.87 
 
 		 593 aa  286  5.999999999999999e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.88 
 
 		 588 aa  286  9e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.58 
 
 		 581 aa  285  1.0000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.01 
 
 		 592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  35.73 
 
 		 574 aa  282  1e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  31.91 
 
 		 600 aa  280  4e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.95 
 
 		 588 aa  279  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  33.5 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  33.62 
 
 		 573 aa  279  1e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.71 
 
 		 568 aa  278  2e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.58 
 
 		 574 aa  277  5e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  31.74 
 
 		 574 aa  276  6e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  32.18 
 
 		 577 aa  276  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  32.18 
 
 		 577 aa  276  9e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2825  ABC transporter related protein  29.96 
 
 		 606 aa  274  4.0000000000000004e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  29.84 
 
 		 587 aa  272  1e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.69 
 
 		 573 aa  272  1e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.82 
 
 		 580 aa  272  1e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4445  ABC transporter related  31.19 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.307141 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  30.65 
 
 		 628 aa  270  4e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  33.64 
 
 		 593 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  32.02 
 
 		 577 aa  270  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0675  ABC transporter related protein  32.34 
 
 		 584 aa  269  1e-70  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2340  ABC transporter, transmembrane region  32.62 
 
 		 603 aa  268  2e-70  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.393444  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  32.77 
 
 		 573 aa  268  2e-70  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  30.53 
 
 		 1194 aa  267  5e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  28.27 
 
 		 579 aa  266  8.999999999999999e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  30.4 
 
 		 583 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  32.01 
 
 		 581 aa  265  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  31.01 
 
 		 585 aa  266  1e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.75 
 
 		 600 aa  265  2e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  30.71 
 
 		 596 aa  264  3e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 650 aa  264  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.81 
 
 		 585 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.32 
 
 		 596 aa  263  6.999999999999999e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.73 
 
 		 577 aa  263  6.999999999999999e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  31.28 
 
 		 660 aa  261  2e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.33 
 
 		 612 aa  261  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.204687  normal  0.463394 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>