More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0923 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 
603 aa  1231    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  43.52 
 
 
574 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.43 
 
 
580 aa  488  1e-136  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  42.15 
 
 
581 aa  481  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  39.9 
 
 
579 aa  478  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.67 
 
 
568 aa  468  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
579 aa  462  9.999999999999999e-129  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  41.03 
 
 
578 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  39.01 
 
 
1228 aa  432  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  41.1 
 
 
581 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 
573 aa  374  1e-102  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  35.91 
 
 
573 aa  370  1e-101  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  35.75 
 
 
573 aa  367  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0676  ABC transporter related protein  33.39 
 
 
573 aa  339  9.999999999999999e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  33.83 
 
 
579 aa  332  9e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  36.91 
 
 
576 aa  330  5.0000000000000004e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.82 
 
 
581 aa  330  6e-89  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  36.56 
 
 
583 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.93 
 
 
579 aa  320  3e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.17 
 
 
588 aa  320  3.9999999999999996e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  36.17 
 
 
593 aa  319  9e-86  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  32.33 
 
 
597 aa  312  1e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.89 
 
 
577 aa  311  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  31.52 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0690  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.49 
 
 
585 aa  309  1.0000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.762318  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0327  ABC transporter related  34.04 
 
 
605 aa  308  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  36.97 
 
 
611 aa  308  3e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0758  ABC transporter related  34.31 
 
 
585 aa  307  4.0000000000000004e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.350541  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00710  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.05 
 
 
593 aa  302  1e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.22824  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  33.27 
 
 
607 aa  301  3e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  34.79 
 
 
577 aa  295  1e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.62 
 
 
595 aa  295  2e-78  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  34.82 
 
 
593 aa  294  4e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.56 
 
 
1091 aa  293  5e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  30.78 
 
 
577 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  30.78 
 
 
577 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  34.72 
 
 
587 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  34.72 
 
 
587 aa  291  3e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3090  ABC transporter related  33.46 
 
 
577 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28310  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.89 
 
 
582 aa  290  7e-77  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.1464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  34.59 
 
 
599 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2314  ABC transporter related  31.08 
 
 
587 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0749379  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.75 
 
 
619 aa  288  2e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.74 
 
 
581 aa  288  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.88 
 
 
580 aa  287  4e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  34.92 
 
 
608 aa  286  5.999999999999999e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.11 
 
 
577 aa  286  1.0000000000000001e-75  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  33.28 
 
 
584 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  33.27 
 
 
593 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  33.72 
 
 
604 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  31.55 
 
 
590 aa  283  7.000000000000001e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  32.42 
 
 
596 aa  282  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  32.13 
 
 
592 aa  282  1e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1809  ABC transporter ATP-binding protein  34.51 
 
 
581 aa  281  2e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915425  normal  0.261629 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.95 
 
 
599 aa  281  3e-74  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.32 
 
 
596 aa  280  4e-74  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2372  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
578 aa  280  4e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.037527  normal  0.0828736 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0317  ABC transporter related  30.92 
 
 
581 aa  277  4e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  31.91 
 
 
578 aa  277  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  31.91 
 
 
578 aa  277  5e-73  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  31.49 
 
 
571 aa  276  6e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.8 
 
 
589 aa  276  9e-73  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2101  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding protein  33.15 
 
 
600 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  30.33 
 
 
574 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.88 
 
 
577 aa  275  2.0000000000000002e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  33.53 
 
 
602 aa  274  3e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0863  ABC transporter, transmembrane region  31.74 
 
 
565 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.729362  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  31.55 
 
 
575 aa  273  8.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  30.91 
 
 
579 aa  273  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.77 
 
 
572 aa  271  2e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.17 
 
 
556 aa  271  2e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.84 
 
 
574 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.74 
 
 
586 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  30.79 
 
 
592 aa  270  7e-71  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.61 
 
 
576 aa  270  8e-71  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3971  ABC transporter related  31.97 
 
 
596 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.06 
 
 
586 aa  268  2e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.75 
 
 
574 aa  267  2.9999999999999995e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.37 
 
 
597 aa  265  1e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26110  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.97 
 
 
618 aa  266  1e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.42 
 
 
586 aa  265  1e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
586 aa  265  1e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.25 
 
 
590 aa  265  2e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  31.42 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
586 aa  265  2e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0757  ABC transporter related  31.14 
 
 
590 aa  264  4e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  31.1 
 
 
586 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2603  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.26 
 
 
581 aa  262  1e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  32.08 
 
 
648 aa  262  1e-68  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3017  ABC transporter related  29.13 
 
 
600 aa  262  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.881398  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.5 
 
 
577 aa  261  2e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  30.58 
 
 
581 aa  262  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.52 
 
 
593 aa  261  4e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  32.82 
 
 
598 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3269  ABC transporter related protein  31.54 
 
 
588 aa  259  7e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0894885 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0916  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.49 
 
 
581 aa  259  1e-67  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.953809  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2100  yersiniabactin ABC transporter ATP-binding/permease  30.42 
 
 
600 aa  259  1e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.6 
 
 
572 aa  259  1e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>