More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0245 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 572 aa  1167    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  36.28 
 
 		 593 aa  323  7e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2127  ABC transporter related  37.21 
 
 		 597 aa  320  5e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000126664  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.83 
 
 		 604 aa  318  2e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.11 
 
 		 574 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.22 
 
 		 597 aa  314  1.9999999999999998e-84  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  35.91 
 
 		 579 aa  311  1e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0880  ABC transporter related  34.73 
 
 		 579 aa  311  2.9999999999999997e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.0000000105658  decreased coverage  0.000000000323108 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2626  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 		 581 aa  310  5e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0381591  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  33.94 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  33.94 
 
 		 577 aa  308  1.0000000000000001e-82  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  35.94 
 
 		 593 aa  308  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0188  ABC transporter, transmembrane region  35 
 
 		 576 aa  306  8.000000000000001e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.55543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0690  ABC transporter related  34.77 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1773  ABC transporter related  34.6 
 
 		 573 aa  305  1.0000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  35.53 
 
 		 581 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  34.87 
 
 		 611 aa  304  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  34.48 
 
 		 602 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0273  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.1 
 
 		 588 aa  300  3e-80  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.330655  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1774  ABC transporter related  36.59 
 
 		 578 aa  299  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.937186  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0691  ABC transporter related  36.59 
 
 		 578 aa  299  9e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00720  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.33 
 
 		 1091 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23120  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  31.91 
 
 		 589 aa  298  2e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1941  ABC transporter related  34.13 
 
 		 581 aa  297  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0169722  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25690  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  32.92 
 
 		 576 aa  297  4e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.99 
 
 		 580 aa  296  7e-79  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1175  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  33.15 
 
 		 568 aa  295  1e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  33.84 
 
 		 587 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2604  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 		 593 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.452791  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  33.84 
 
 		 587 aa  294  2e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23130  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.03 
 
 		 577 aa  295  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.880015 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2315  ABC transporter related  32.4 
 
 		 608 aa  293  4e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.29878  normal  0.596997 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  32.2 
 
 		 584 aa  293  6e-78  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2841  ABC transporter related  32.18 
 
 		 607 aa  293  6e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.390969 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1492  ABC transporter related  33.98 
 
 		 592 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.753485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0896  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.67 
 
 		 595 aa  291  3e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03650  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.8 
 
 		 596 aa  291  3e-77  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.000000696051  decreased coverage  0.00250447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0326  ABC transporter related  34.82 
 
 		 595 aa  290  4e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0316  ABC transporter related  32.62 
 
 		 619 aa  289  8e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2308  ABC transporter related  33.39 
 
 		 579 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3268  ABC transporter related protein  35.16 
 
 		 599 aa  289  1e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.856994  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4630  ABC transporter related  33.68 
 
 		 588 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000420714  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.93 
 
 		 583 aa  286  9e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  36.54 
 
 		 592 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2480  ABC transporter related  35.8 
 
 		 574 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2128  ABC transporter related  33.91 
 
 		 578 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.976048  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2625  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.51 
 
 		 579 aa  283  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0628  ABC transporter, ATP-binding protein  34.56 
 
 		 573 aa  283  7.000000000000001e-75  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.484282  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.5 
 
 		 579 aa  282  1e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.57 
 
 		 596 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  32.43 
 
 		 568 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0924  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.29 
 
 		 627 aa  281  3e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00295449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4629  ABC transporter related  33.92 
 
 		 580 aa  281  3e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000094553  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  35.09 
 
 		 575 aa  280  6e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  33.97 
 
 		 579 aa  279  8e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0818  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.07 
 
 		 573 aa  279  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00589129  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.15 
 
 		 572 aa  278  1e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  33.15 
 
 		 572 aa  278  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4769  ABC transporter related  33.64 
 
 		 581 aa  278  2e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  33.15 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.42 
 
 		 572 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2324  ABC transporter related  35.53 
 
 		 593 aa  278  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  33.77 
 
 		 598 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 572 aa  277  4e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1042  ABC transporter related  32.69 
 
 		 599 aa  277  4e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.75 
 
 		 580 aa  277  4e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03660  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  34.41 
 
 		 577 aa  277  4e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.023661  hitchhiker  0.00816448 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  33.53 
 
 		 584 aa  276  9e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3970  ABC transporter related  31.67 
 
 		 574 aa  273  4.0000000000000004e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1437  ABC transporter related  31.16 
 
 		 579 aa  273  6e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0233072  normal  0.573322 
 
 
-
 
NC_002950  PG1176  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.99 
 
 		 573 aa  273  9e-72  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  33.52 
 
 		 571 aa  272  9e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  33.07 
 
 		 598 aa  272  1e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2309  ABC transporter related  31.57 
 
 		 609 aa  271  2e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  31.05 
 
 		 577 aa  270  5e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1808  ABC transporter ATP-binding protein  33.13 
 
 		 618 aa  270  5e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.877755  normal  0.0567743 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3554  ABC transporter related  31.83 
 
 		 596 aa  270  7e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.32539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1601  ATPase  31.21 
 
 		 583 aa  269  8e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.149683  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0923  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.28 
 
 		 603 aa  269  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00763671  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2323  ABC transporter related  31.87 
 
 		 677 aa  269  1e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.35782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0708  ABC transporter related  31.93 
 
 		 573 aa  269  1e-70  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0153727  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1493  ABC transporter related  33.15 
 
 		 606 aa  269  1e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.065388  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.85 
 
 		 581 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1599  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 574 aa  268  2e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.14 
 
 		 571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.14 
 
 		 571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.14 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.14 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.14 
 
 		 571 aa  267  4e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0689  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.84 
 
 		 590 aa  266  5.999999999999999e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2815  ABC transporter related  36.07 
 
 		 594 aa  266  5.999999999999999e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.264488  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.14 
 
 		 571 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  34.26 
 
 		 613 aa  266  8e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  32.67 
 
 		 585 aa  266  8.999999999999999e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1041  ABC transporter related  32.14 
 
 		 577 aa  266  8.999999999999999e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  34.62 
 
 		 1228 aa  265  1e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.95 
 
 		 571 aa  266  1e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  33.27 
 
 		 582 aa  265  1e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.21 
 
 		 572 aa  266  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 590 aa  266  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>