More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_0354 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  100 
 
 
585 aa  1187    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  46.09 
 
 
592 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  38.08 
 
 
579 aa  370  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.5 
 
 
555 aa  365  1e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  36.7 
 
 
576 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  37.59 
 
 
1179 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  37.59 
 
 
1179 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  37.13 
 
 
1179 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  36.41 
 
 
588 aa  340  5e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  36.95 
 
 
1201 aa  340  5e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  37.06 
 
 
1179 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.32 
 
 
586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  35.43 
 
 
594 aa  328  2.0000000000000001e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
598 aa  321  1.9999999999999998e-86  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.99 
 
 
575 aa  316  7e-85  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  36.44 
 
 
596 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
571 aa  307  4.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.66 
 
 
578 aa  305  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  35.67 
 
 
584 aa  301  2e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  33.62 
 
 
580 aa  301  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.71 
 
 
586 aa  300  5e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.98 
 
 
579 aa  300  7e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.55 
 
 
598 aa  299  9e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2086  ABC transporter related  35.47 
 
 
597 aa  298  2e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.76 
 
 
586 aa  297  3e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.58 
 
 
586 aa  296  6e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.58 
 
 
586 aa  296  6e-79  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.8 
 
 
578 aa  296  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.8 
 
 
578 aa  296  7e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.41 
 
 
586 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 
586 aa  295  2e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 
586 aa  294  2e-78  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.76 
 
 
586 aa  295  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.41 
 
 
586 aa  294  3e-78  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 
562 aa  293  7e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  35.85 
 
 
611 aa  293  9e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35 
 
 
601 aa  293  9e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.41 
 
 
586 aa  292  1e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
562 aa  292  1e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1741  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.39 
 
 
590 aa  292  1e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.86 
 
 
596 aa  290  4e-77  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  32.42 
 
 
552 aa  290  7e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  33.15 
 
 
556 aa  288  1e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  34.23 
 
 
609 aa  289  1e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  34.53 
 
 
582 aa  289  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.68 
 
 
573 aa  288  2e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  35.67 
 
 
571 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1442  ABC transporter related  34.57 
 
 
606 aa  286  7e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.45 
 
 
552 aa  286  8e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  34.13 
 
 
601 aa  286  8e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.39 
 
 
586 aa  286  8e-76  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  33.68 
 
 
597 aa  286  9e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  32.92 
 
 
572 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  32.35 
 
 
579 aa  284  3.0000000000000004e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  33.97 
 
 
585 aa  284  4.0000000000000003e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  39.49 
 
 
468 aa  283  7.000000000000001e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.48 
 
 
573 aa  283  7.000000000000001e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.66 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  32.66 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  31.9 
 
 
595 aa  282  1e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  34.43 
 
 
611 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
571 aa  282  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1395  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  32.76 
 
 
610 aa  282  1e-74  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.507365  hitchhiker  0.000128889 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.88 
 
 
577 aa  281  2e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  32.66 
 
 
571 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  33.84 
 
 
612 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
571 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.66 
 
 
571 aa  281  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.06 
 
 
589 aa  281  3e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  29.91 
 
 
582 aa  280  4e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  32.53 
 
 
591 aa  280  4e-74  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  29.86 
 
 
597 aa  280  5e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.46 
 
 
585 aa  280  7e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  33.59 
 
 
580 aa  279  8e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.11 
 
 
571 aa  279  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2823  ABC transporter related protein  36.44 
 
 
585 aa  279  1e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4133  ABC transporter related  33.27 
 
 
614 aa  278  2e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.293166 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.46 
 
 
571 aa  278  2e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0672  ABC transporter related  32.3 
 
 
578 aa  278  2e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  32.83 
 
 
618 aa  278  2e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  33 
 
 
601 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  33 
 
 
601 aa  277  3e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  34.32 
 
 
575 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0332  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.96 
 
 
586 aa  277  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.4 
 
 
572 aa  277  5e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  32.15 
 
 
640 aa  276  6e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  32.44 
 
 
588 aa  276  7e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3238  ABC transporter related  35.41 
 
 
594 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00207534  normal  0.825064 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.16 
 
 
580 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2159  ABC transporter related  36.63 
 
 
603 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.912689  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0908  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.18 
 
 
583 aa  275  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1782  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  31.63 
 
 
588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.44 
 
 
597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.44 
 
 
597 aa  275  2.0000000000000002e-72  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  32.89 
 
 
636 aa  274  4.0000000000000004e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  32.29 
 
 
567 aa  273  4.0000000000000004e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  34.63 
 
 
566 aa  274  4.0000000000000004e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  32.35 
 
 
550 aa  273  5.000000000000001e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>