More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2558 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  100 
 
 		 552 aa  1092    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  47.65 
 
 		 552 aa  498  1e-139  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  43.01 
 
 		 993 aa  447  1.0000000000000001e-124  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  43.42 
 
 		 562 aa  440  9.999999999999999e-123  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  40.81 
 
 		 566 aa  436  1e-121  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  43.24 
 
 		 562 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  38.98 
 
 		 1205 aa  397  1e-109  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1010  multidrug ABC transporter ATPase/permease  33.72 
 
 		 1353 aa  316  7e-85  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.98 
 
 		 594 aa  309  8e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  32.55 
 
 		 592 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  35.44 
 
 		 585 aa  278  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  34.01 
 
 		 576 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  32.39 
 
 		 575 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.54 
 
 		 555 aa  254  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  30.84 
 
 		 573 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  31.78 
 
 		 1201 aa  249  7e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  30.54 
 
 		 578 aa  249  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  31.72 
 
 		 579 aa  249  8e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  30.54 
 
 		 578 aa  249  8e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  31.67 
 
 		 1179 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.67 
 
 		 1179 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  31.12 
 
 		 1179 aa  247  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.41 
 
 		 586 aa  243  1e-62  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.06 
 
 		 1179 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.41 
 
 		 586 aa  239  6.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.82 
 
 		 586 aa  239  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.77 
 
 		 586 aa  238  3e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.59 
 
 		 586 aa  237  3e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.59 
 
 		 586 aa  237  3e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.59 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.59 
 
 		 586 aa  237  4e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  33.27 
 
 		 586 aa  236  9e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.7 
 
 		 586 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  30.33 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  29.09 
 
 		 573 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  30.94 
 
 		 584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4595  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  28.37 
 
 		 547 aa  233  6e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.18 
 
 		 586 aa  232  1e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  32.52 
 
 		 588 aa  231  3e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  33.2 
 
 		 571 aa  229  1e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  28.92 
 
 		 579 aa  227  5.0000000000000005e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  28.09 
 
 		 588 aa  224  3e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2454  ABC transporter related  28.74 
 
 		 577 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2502  ABC transporter related  28.74 
 
 		 577 aa  223  7e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.718734  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.66 
 
 		 578 aa  222  1.9999999999999999e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  31.7 
 
 		 575 aa  220  5e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0897  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.69 
 
 		 581 aa  219  7e-56  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25700  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  28.57 
 
 		 581 aa  219  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2655  ABC transporter related  33.41 
 
 		 581 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.399774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  27.17 
 
 		 609 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  31.14 
 
 		 580 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  29.41 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1293  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  27.37 
 
 		 562 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.408226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3267  ABC transporter related protein  31.84 
 
 		 579 aa  218  2.9999999999999998e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000188194  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  29.96 
 
 		 644 aa  218  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  31.25 
 
 		 608 aa  217  5e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  28.71 
 
 		 556 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6513  ABC transporter related protein  27.72 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.330093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  31.69 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  28.05 
 
 		 598 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 		 566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  30.9 
 
 		 584 aa  213  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  26.32 
 
 		 614 aa  213  9e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  29.88 
 
 		 580 aa  211  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2656  ABC transporter related  31.27 
 
 		 611 aa  212  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0207415  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1573  ABC transporter related protein  27.87 
 
 		 590 aa  211  2e-53  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0475894  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  28.07 
 
 		 582 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  29.25 
 
 		 600 aa  211  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.33 
 
 		 574 aa  211  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0274  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.37 
 
 		 597 aa  211  4e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000298465  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  27.16 
 
 		 597 aa  210  5e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  29.57 
 
 		 584 aa  210  5e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.63 
 
 		 589 aa  210  6e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  25.93 
 
 		 577 aa  209  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2842  ABC transporter related  29.72 
 
 		 598 aa  209  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.650439 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  27.94 
 
 		 601 aa  209  9e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  31.49 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  29.86 
 
 		 592 aa  208  2e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  29.86 
 
 		 606 aa  208  2e-52  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  28.02 
 
 		 660 aa  207  3e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.95 
 
 		 622 aa  207  3e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  29.08 
 
 		 605 aa  207  3e-52  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  27.49 
 
 		 579 aa  207  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  30.84 
 
 		 571 aa  207  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1905  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  31.38 
 
 		 1000 aa  207  3e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0871226  normal  0.242471 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  35.18 
 
 		 738 aa  207  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0506  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.94 
 
 		 612 aa  207  4e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.740474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  29.5 
 
 		 592 aa  207  5e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0238  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  27.88 
 
 		 596 aa  207  5e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  29.32 
 
 		 580 aa  207  5e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  39.66 
 
 		 593 aa  206  6e-52  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27200  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.33 
 
 		 702 aa  206  6e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0319  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  35.46 
 
 		 455 aa  206  6e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  28.45 
 
 		 617 aa  206  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  27.85 
 
 		 595 aa  206  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2007  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  27.93 
 
 		 580 aa  206  8e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.261515  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  28.21 
 
 		 585 aa  206  8e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  27.89 
 
 		 580 aa  206  1e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  25.87 
 
 		 608 aa  206  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.57 
 
 		 598 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>