More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1525 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  100 
 
 
581 aa  1179    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1429  ABC transporter related  45.28 
 
 
581 aa  532  1e-150  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3781  ABC transporter related  44.17 
 
 
588 aa  520  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000284212  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  44.39 
 
 
580 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1250  ABC transporter, ATP-binding protein  40.97 
 
 
604 aa  443  1e-123  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143997 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2283  ABC transporter related  40.07 
 
 
589 aa  443  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  39.32 
 
 
601 aa  428  1e-118  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3626  ABC transporter related  41.11 
 
 
588 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.058238  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0018  ABC transporter related  39.93 
 
 
581 aa  421  1e-116  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.2 
 
 
573 aa  421  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  41.26 
 
 
578 aa  419  1e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  39.18 
 
 
606 aa  421  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1539  multidrug ABC transporter ATPase/permease  38.37 
 
 
636 aa  415  9.999999999999999e-116  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1941  ABC transporter, transmembrane region  39.15 
 
 
592 aa  406  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.121107  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1454  ABC transporter related  42.94 
 
 
641 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0641  ABC transporter related  38.95 
 
 
577 aa  403  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.061779  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  37.02 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.85 
 
 
586 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.02 
 
 
586 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.2 
 
 
586 aa  398  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.85 
 
 
586 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1502  ATPase  37.46 
 
 
587 aa  396  1e-109  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.85 
 
 
586 aa  398  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.68 
 
 
586 aa  395  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.85 
 
 
586 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  37.02 
 
 
586 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0948  ABC transporter related  40.82 
 
 
642 aa  387  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.336517  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1706  ABC transporter related  37.07 
 
 
586 aa  387  1e-106  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000217452  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1514  ABC transporter, ATPase subunit  37.02 
 
 
591 aa  386  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.143347  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.08 
 
 
617 aa  386  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1890  ABC transporter related  36.21 
 
 
586 aa  386  1e-106  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0664725  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.99 
 
 
586 aa  387  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  38.07 
 
 
598 aa  384  1e-105  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.94 
 
 
598 aa  382  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.57 
 
 
587 aa  382  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  35.75 
 
 
614 aa  380  1e-104  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1327  ATPase  37.41 
 
 
604 aa  381  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.0000000155487  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.72 
 
 
597 aa  381  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  38.74 
 
 
582 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.1 
 
 
556 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  37.67 
 
 
578 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  36.44 
 
 
586 aa  380  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  37.67 
 
 
578 aa  381  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0674  ABC transporter related  40.04 
 
 
589 aa  374  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  37.25 
 
 
644 aa  373  1e-102  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0842  ABC transporter related  37.65 
 
 
594 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  35.64 
 
 
608 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1597  ABC transporter related  36.43 
 
 
583 aa  369  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  36.06 
 
 
764 aa  371  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2584  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.99 
 
 
768 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.98 
 
 
577 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
575 aa  371  1e-101  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4080  ABC transporter related  35.76 
 
 
814 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.256448  normal  0.875845 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0441  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
650 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2922  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
581 aa  368  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.364865  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2254  ABC transporter related  36.05 
 
 
782 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0637  ABC transporter related  36.24 
 
 
770 aa  369  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.57887  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0658  ABC transporter related  36.06 
 
 
750 aa  368  1e-100  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3967  ABC transporter related  35.76 
 
 
768 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2506  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
578 aa  365  1e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.120759  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0159  ABC transporter related  36.91 
 
 
541 aa  365  1e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1166  ABC transporter related protein  37.2 
 
 
588 aa  365  1e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1057  ABC transporter related  37.78 
 
 
583 aa  365  2e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  36.21 
 
 
600 aa  364  2e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2628  ABC transporter related  36.43 
 
 
583 aa  364  2e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.92 
 
 
578 aa  364  3e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.66 
 
 
584 aa  363  3e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.86 
 
 
597 aa  364  3e-99  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0839  ABC transporter-related protein  39.15 
 
 
585 aa  364  3e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.677417  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.86 
 
 
597 aa  363  3e-99  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  37 
 
 
620 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
594 aa  362  9e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.22 
 
 
597 aa  362  1e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2670  ABC transporter related  38.04 
 
 
622 aa  361  2e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0292907  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2619  ABC transporter related  37.74 
 
 
578 aa  360  4e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000800932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  35.71 
 
 
764 aa  358  1.9999999999999998e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4991  ABC transporter related  35.05 
 
 
808 aa  357  1.9999999999999998e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12933  ATPase  35.86 
 
 
585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.756809  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
585 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3423  ABC transporter-related protein  33.57 
 
 
611 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000173526  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  34.97 
 
 
598 aa  356  7.999999999999999e-97  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2242  ABC transporter related protein  36.2 
 
 
658 aa  356  7.999999999999999e-97  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.406073  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4038  ABC transporter-related protein  35.17 
 
 
726 aa  355  8.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000838789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  35.07 
 
 
601 aa  355  8.999999999999999e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00400  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  35.42 
 
 
590 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5994  ABC transporter related  37.93 
 
 
587 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  36.36 
 
 
589 aa  355  1e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  32.87 
 
 
600 aa  355  1e-96  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00404  hypothetical protein  35.42 
 
 
590 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1021  putative ABC transporter  35.14 
 
 
778 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.338231  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0625  ABC transporter related  36.25 
 
 
577 aa  355  1e-96  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1316  ABC transporter related  36.14 
 
 
784 aa  354  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.512065  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  35.61 
 
 
660 aa  354  2e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.7 
 
 
575 aa  354  2.9999999999999997e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  34.9 
 
 
601 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  33.68 
 
 
607 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1060  ABC transporter related  34.35 
 
 
760 aa  353  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.120719  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3979  ABC transporter-related protein  36.41 
 
 
773 aa  353  5.9999999999999994e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0802  ABC transporter-like protein  34.69 
 
 
572 aa  353  5.9999999999999994e-96  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  34.55 
 
 
625 aa  352  8e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>