More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0190 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  100 
 
 		 608 aa  1243    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  50.17 
 
 		 611 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  37.54 
 
 		 575 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  34.9 
 
 		 580 aa  330  6e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.85 
 
 		 577 aa  328  2.0000000000000001e-88  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.51 
 
 		 589 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.12 
 
 		 574 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.45 
 
 		 575 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.09 
 
 		 1201 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  31.47 
 
 		 575 aa  311  2e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.43 
 
 		 1179 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  34.26 
 
 		 1179 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.26 
 
 		 1179 aa  306  6e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.69 
 
 		 578 aa  306  8.000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.92 
 
 		 579 aa  301  3e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  33.39 
 
 		 1179 aa  300  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  31.1 
 
 		 579 aa  299  9e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.14 
 
 		 590 aa  299  1e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  33.15 
 
 		 550 aa  297  4e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 586 aa  291  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  33 
 
 		 586 aa  291  3e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.72 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.84 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.84 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.84 
 
 		 586 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  33.87 
 
 		 579 aa  288  2e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33 
 
 		 586 aa  288  2.9999999999999996e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.88 
 
 		 575 aa  286  5.999999999999999e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.67 
 
 		 586 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.67 
 
 		 586 aa  286  7e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.61 
 
 		 578 aa  286  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.57 
 
 		 585 aa  286  8e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.61 
 
 		 578 aa  286  8e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.81 
 
 		 578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.67 
 
 		 586 aa  286  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3183  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.01 
 
 		 603 aa  285  2.0000000000000002e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  34.29 
 
 		 550 aa  283  5.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  34.25 
 
 		 610 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.25 
 
 		 609 aa  283  6.000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.47 
 
 		 580 aa  283  8.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.39 
 
 		 585 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.39 
 
 		 577 aa  282  1e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.1 
 
 		 586 aa  282  1e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  33.1 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0332  ABC transporter related  33.28 
 
 		 577 aa  281  3e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  29.88 
 
 		 582 aa  281  3e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  35.45 
 
 		 567 aa  279  9e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  34.42 
 
 		 579 aa  279  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  33.73 
 
 		 625 aa  278  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.91 
 
 		 605 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.22 
 
 		 572 aa  278  3e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4444  ABC transporter related  32.97 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.949596  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4531  ABC transporter related  32.97 
 
 		 610 aa  276  9e-73  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.319604  normal  0.425635 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  35.67 
 
 		 565 aa  276  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  33.65 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1495  ABC transporter-like protein protein  31.6 
 
 		 578 aa  275  2.0000000000000002e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.155275  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4826  ABC transporter related  32.97 
 
 		 610 aa  275  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.596215 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  34.66 
 
 		 566 aa  274  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  33.46 
 
 		 567 aa  274  3e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  34.65 
 
 		 596 aa  274  3e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3667  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  34.91 
 
 		 608 aa  274  4.0000000000000004e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.91 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.71 
 
 		 584 aa  273  9e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  35.38 
 
 		 611 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  34.41 
 
 		 588 aa  272  1e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  34.26 
 
 		 601 aa  272  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  32.01 
 
 		 571 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  35.29 
 
 		 595 aa  272  2e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  34.26 
 
 		 601 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1110  ATPase  33.9 
 
 		 590 aa  271  2.9999999999999997e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.551514  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  31.83 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  31.79 
 
 		 575 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.72 
 
 		 609 aa  270  4e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 598 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3249  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  36.55 
 
 		 600 aa  270  4e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.305361 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  34.41 
 
 		 597 aa  270  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  33.81 
 
 		 602 aa  270  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0844  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.98 
 
 		 605 aa  270  5.9999999999999995e-71  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2096  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.43 
 
 		 616 aa  270  5.9999999999999995e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.163444  hitchhiker  0.0014118 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.46 
 
 		 591 aa  269  8.999999999999999e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.28 
 
 		 600 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.81 
 
 		 583 aa  269  8.999999999999999e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  34.97 
 
 		 611 aa  269  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  33.03 
 
 		 644 aa  269  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  35.57 
 
 		 576 aa  269  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  34.63 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  32.23 
 
 		 598 aa  268  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.47 
 
 		 614 aa  268  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  34.63 
 
 		 586 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  32.76 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11901  multidrug ABC transporter  33.84 
 
 		 590 aa  267  4e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  33.93 
 
 		 609 aa  267  4e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0980  ABC transporter related  33.82 
 
 		 606 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.87 
 
 		 574 aa  267  5e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3546  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  35.76 
 
 		 600 aa  267  5e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  33.46 
 
 		 588 aa  267  5e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  32.91 
 
 		 579 aa  266  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  33.06 
 
 		 568 aa  266  7e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  32.61 
 
 		 556 aa  266  8e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1402  ATPase  36.14 
 
 		 619 aa  266  8.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.387875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>