More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_10350 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_1010  multidrug ABC transporter ATPase/permease  37.55 
 
 
1353 aa  756    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  100 
 
 
1205 aa  2431    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  52.5 
 
 
993 aa  973    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0273  ABC transporter related  46.93 
 
 
566 aa  501  1e-140  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0272  ABC transporter related  42.14 
 
 
578 aa  468  9.999999999999999e-131  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.933843  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.03 
 
 
1179 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2302  ABC transporter related protein  39.51 
 
 
582 aa  453  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  42.8 
 
 
552 aa  450  1e-125  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  39.06 
 
 
575 aa  429  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  39.06 
 
 
575 aa  428  1e-118  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  40.72 
 
 
562 aa  422  1e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.02 
 
 
562 aa  423  1e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2559  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.11 
 
 
606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2558  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.98 
 
 
552 aa  397  1e-109  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.33 
 
 
579 aa  318  4e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  28.68 
 
 
1228 aa  316  1.9999999999999998e-84  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  26.08 
 
 
1194 aa  308  3e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0698  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.17 
 
 
579 aa  309  3e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.717868  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30570  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.73 
 
 
1257 aa  308  6e-82  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  31.71 
 
 
611 aa  304  8.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  32.06 
 
 
574 aa  295  4e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  32.09 
 
 
578 aa  286  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1293  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.09 
 
 
562 aa  285  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.408226  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1429  ABC transporter related  26.6 
 
 
1284 aa  285  4.0000000000000003e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.442581  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1786  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  29.86 
 
 
580 aa  282  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.540323  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.89 
 
 
590 aa  280  1e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0716  ATPase  30.48 
 
 
582 aa  280  2e-73  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  34.77 
 
 
579 aa  276  2.0000000000000002e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0473  ATPase  31.89 
 
 
588 aa  273  1e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1455  ABC transporter related  32.29 
 
 
583 aa  273  1e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.490863  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.33 
 
 
594 aa  272  2.9999999999999997e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  31.44 
 
 
592 aa  271  4e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  31.23 
 
 
589 aa  271  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  28.89 
 
 
1218 aa  271  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.96 
 
 
573 aa  269  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  33.88 
 
 
576 aa  269  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  26.92 
 
 
1194 aa  267  8.999999999999999e-70  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.85 
 
 
555 aa  266  2e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  28.89 
 
 
1218 aa  266  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1109  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.64 
 
 
585 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1637  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.73 
 
 
589 aa  263  1e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.490977  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1388  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  30.64 
 
 
577 aa  263  1e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.96198  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  29 
 
 
1218 aa  263  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  29.18 
 
 
1231 aa  262  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  28.86 
 
 
1218 aa  261  4e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1879  ABC transporter, ATP-binding/permease protein CydD  31.03 
 
 
592 aa  261  5.0000000000000005e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  28.78 
 
 
1218 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  31.01 
 
 
575 aa  258  5e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.83 
 
 
582 aa  258  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  34.87 
 
 
1179 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.87 
 
 
1179 aa  258  6e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0697  ABC transporter, transmembrane region, type 1  33.08 
 
 
574 aa  258  6e-67  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4595  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydC  32.35 
 
 
547 aa  257  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  28.89 
 
 
577 aa  255  3e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  31.05 
 
 
580 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.34 
 
 
574 aa  253  1e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.97 
 
 
573 aa  253  2e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  34.44 
 
 
1179 aa  253  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  33.58 
 
 
1201 aa  248  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  28.98 
 
 
608 aa  248  6e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0040  ABC transporter related  33.58 
 
 
550 aa  245  3e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1666  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.12 
 
 
576 aa  245  5e-63  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000461828  normal  0.671696 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  32.66 
 
 
585 aa  243  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0710  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  29.38 
 
 
607 aa  240  9e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0156837 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0472  ATPase  32.89 
 
 
578 aa  239  2e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.75 
 
 
586 aa  238  4e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3383  transport ATP-binding protein CydC  27.96 
 
 
573 aa  237  1.0000000000000001e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.813742  hitchhiker  0.00000000000619034 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.44 
 
 
586 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  29.57 
 
 
586 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.44 
 
 
586 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1945  transport ATP-binding protein CydC  27.96 
 
 
573 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1805  transport ATP-binding protein CydC  28.04 
 
 
571 aa  235  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  29.39 
 
 
586 aa  236  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1762  ABC transporter, ATP-binding and permease  27.89 
 
 
571 aa  235  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.951203  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1945  transport ATP-binding protein CydC  28.04 
 
 
571 aa  235  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1884  ABC transporter related protein  27.53 
 
 
1332 aa  235  4.0000000000000004e-60  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  29.26 
 
 
586 aa  234  6e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  29.26 
 
 
586 aa  234  6e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  29.08 
 
 
586 aa  234  9e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2023  transport ATP-binding protein CydC  28.22 
 
 
571 aa  233  1e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.94731  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1779  ABC transporter, ATP-binding and permease  27.87 
 
 
571 aa  234  1e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.9 
 
 
586 aa  233  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  29.14 
 
 
586 aa  234  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1980  transport ATP-binding protein CydC  27.87 
 
 
571 aa  234  1e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.11013e-20 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2044  transport ATP-binding protein CydC  27.87 
 
 
571 aa  233  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298997  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2748  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein CydD  30.56 
 
 
552 aa  231  6e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.507813  normal  0.959426 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0115  ABC transporter, transmembrane region  32.45 
 
 
625 aa  229  2e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2634  ABC transporter-related protein  32.41 
 
 
572 aa  228  4e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159287  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  34.38 
 
 
595 aa  228  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.12 
 
 
578 aa  227  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.12 
 
 
578 aa  227  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  31.03 
 
 
609 aa  226  2e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  26.85 
 
 
1284 aa  225  3e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2503  ABC transporter related  25.95 
 
 
587 aa  226  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0868993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2455  ABC transporter related  25.95 
 
 
587 aa  226  3e-57  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.7 
 
 
578 aa  224  6e-57  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1811  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family permease/ATP-binding protein CydD  27.54 
 
 
573 aa  224  7e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.404009  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0717  ATPase  32.09 
 
 
583 aa  224  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000641338  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  29.04 
 
 
575 aa  222  3e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0377  ABC transporter related  27.66 
 
 
1264 aa  222  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.843886  normal  0.12564 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>