More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0191 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  100 
 
 
579 aa  1172    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  53.7 
 
 
576 aa  617  1e-175  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  38.84 
 
 
585 aa  359  6e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  35.85 
 
 
592 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  40.68 
 
 
594 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  39.96 
 
 
1201 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  40.26 
 
 
1179 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  40.26 
 
 
1179 aa  340  4e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  39.63 
 
 
1179 aa  339  8e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  40.07 
 
 
1179 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
575 aa  331  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  35.49 
 
 
609 aa  330  3e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.3 
 
 
573 aa  323  5e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  39.18 
 
 
588 aa  317  4e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.99 
 
 
555 aa  317  5e-85  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.81 
 
 
573 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.17 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.48 
 
 
580 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  36.99 
 
 
586 aa  302  9e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  35.74 
 
 
579 aa  302  1e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0333  ABC transporter related  32.58 
 
 
602 aa  301  2e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  36.23 
 
 
594 aa  300  4e-80  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.55 
 
 
572 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 
580 aa  299  1e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  37.3 
 
 
587 aa  297  3e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.44 
 
 
571 aa  293  7e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  33.5 
 
 
579 aa  293  7e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.75 
 
 
617 aa  292  1e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  34.44 
 
 
556 aa  291  2e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  32.82 
 
 
580 aa  291  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.97 
 
 
571 aa  290  6e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.33 
 
 
571 aa  289  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.21 
 
 
584 aa  289  9e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.33 
 
 
571 aa  288  1e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.7 
 
 
578 aa  288  1e-76  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.29 
 
 
574 aa  288  2e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.33 
 
 
571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.33 
 
 
571 aa  288  2e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.33 
 
 
571 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.88 
 
 
573 aa  286  7e-76  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  32.95 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.41 
 
 
577 aa  285  1.0000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  32.95 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  35.13 
 
 
571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.13 
 
 
571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1390  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.79 
 
 
585 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1110  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.79 
 
 
585 aa  285  2.0000000000000002e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0244  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.51 
 
 
574 aa  284  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.13 
 
 
571 aa  283  4.0000000000000003e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  34.68 
 
 
575 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  36.07 
 
 
585 aa  283  8.000000000000001e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4471  ABC transporter related protein  35.95 
 
 
629 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0660374  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  34.64 
 
 
660 aa  282  1e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.73 
 
 
571 aa  281  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  34.75 
 
 
580 aa  281  2e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0100  ABC transporter related  32.02 
 
 
584 aa  281  2e-74  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.995912  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.86 
 
 
572 aa  280  4e-74  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.45 
 
 
598 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4770  ABC transporter related  34.82 
 
 
593 aa  280  4e-74  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.88 
 
 
596 aa  280  5e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.86 
 
 
572 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  35.86 
 
 
572 aa  280  7e-74  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2303  ABC transporter related protein  32.19 
 
 
552 aa  280  8e-74  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.347808  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0245  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.78 
 
 
572 aa  279  9e-74  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  35.15 
 
 
596 aa  279  1e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  34.87 
 
 
584 aa  279  1e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  33 
 
 
591 aa  278  2e-73  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  35.38 
 
 
572 aa  277  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  35.07 
 
 
601 aa  277  5e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.07 
 
 
613 aa  277  5e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3781  ABC transporter, ATPase subunit  36.53 
 
 
626 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.411009 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  33.08 
 
 
566 aa  276  8e-73  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0189  ABC transporter, transmembrane region  33.85 
 
 
593 aa  276  8e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0217  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.54 
 
 
562 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  31.48 
 
 
582 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  36.14 
 
 
567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  35.38 
 
 
589 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  36.14 
 
 
567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  34.77 
 
 
1205 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1940  ABC transporter related  34.94 
 
 
604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00184105  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0216  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.54 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  35.54 
 
 
610 aa  274  3e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  34.28 
 
 
597 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  35.54 
 
 
598 aa  274  3e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  35.48 
 
 
578 aa  274  4.0000000000000004e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  35.88 
 
 
620 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0879  ABC transporter related  34.66 
 
 
592 aa  274  4.0000000000000004e-72  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000788557  decreased coverage  0.000000000312557 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  34.46 
 
 
611 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4342  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.62 
 
 
639 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.180584  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  31.66 
 
 
582 aa  273  6e-72  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.75 
 
 
589 aa  273  6e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  35.34 
 
 
582 aa  273  7e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 
641 aa  273  7e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2936  ABC transporter related  34.64 
 
 
638 aa  273  8.000000000000001e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  38.24 
 
 
627 aa  273  8.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  34.85 
 
 
572 aa  273  8.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  33.53 
 
 
586 aa  273  9e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  33.46 
 
 
618 aa  272  1e-71  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  35.39 
 
 
582 aa  272  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  34.42 
 
 
608 aa  271  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>