More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3442 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1962  ABC efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  95.17 
 
 
1201 aa  2019    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.072256  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3442  cysteine ABC transporter permease/ATP-binding protein  100 
 
 
1179 aa  2284    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.507362  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4285  ABC transporter related  98.56 
 
 
1179 aa  2253    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3493  ABC transporter related  94.74 
 
 
1179 aa  1996    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4081  ABC transporter, transmembrane region, type 1  98.56 
 
 
1179 aa  2253    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10350  cysteine export CydDC family ABC transporter permease subunit/ATP-binding protein CydC  32.2 
 
 
1205 aa  511  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.247589  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1486  ABC transporter related  33.59 
 
 
1228 aa  436  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1721  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family, permease/ATP-binding protein CydC  34.9 
 
 
993 aa  431  1e-119  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.489544 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1010  multidrug ABC transporter ATPase/permease  29 
 
 
1353 aa  426  1e-117  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10196  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.15 
 
 
1194 aa  398  1e-109  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2510  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.34 
 
 
577 aa  389  1e-106  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00122809  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02300  ABC-transporterMultidrug resistance protein MDR ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G1]  32.39 
 
 
1343 aa  380  1e-104  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.567277  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0338  ABC transporter related  29.76 
 
 
1194 aa  375  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3072  ATP binding cassette  31.23 
 
 
1218 aa  374  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2950  ATP-binding protein  31.29 
 
 
1218 aa  375  1e-102  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.03128e-16 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  39.93 
 
 
579 aa  372  1e-101  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1425  ABC transporter related  30.95 
 
 
1138 aa  365  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.886834 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0189  ABC transporter related  38.35 
 
 
576 aa  363  1e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.087717  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2916  ATP binding cassette  31.03 
 
 
1218 aa  362  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.352142  normal  0.12308 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2886  ATP binding cassette  31.15 
 
 
1218 aa  359  1.9999999999999998e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0340  ABC transporter related  37.15 
 
 
580 aa  359  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0041  ABC transporter, transmembrane region, type 1  42.75 
 
 
594 aa  355  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0354  ABC transporter related  37.17 
 
 
585 aa  355  2e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.667911  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02349  ATP-binding cassette multidrug transport protein ATRC [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y8G2]  31.95 
 
 
1284 aa  355  2.9999999999999997e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.506788  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2969  ATP binding cassette  30.89 
 
 
1218 aa  351  5e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0188  ABC transporter related  36.9 
 
 
611 aa  350  8e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.55078  normal  0.567105 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0341  ABC transporter related  38.13 
 
 
592 aa  350  1e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3783  ABC transporter related  31.54 
 
 
1301 aa  349  1e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.377067  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0353  ABC transporter related  36.82 
 
 
575 aa  347  6e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2029  ABC transporter related  30.34 
 
 
1230 aa  340  9.999999999999999e-92  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0190  ABC transporter related  34.72 
 
 
608 aa  339  1.9999999999999998e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0603074  normal  0.304644 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1516  ABC transporter related  33.74 
 
 
1231 aa  338  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.347232 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06237  ABC multidrug transporter (Eurofung)  27.9 
 
 
1377 aa  337  7e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.333572  normal  0.1457 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00404  AtrH [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q2VY21]  30.04 
 
 
1324 aa  327  7e-88  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.173354 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2097  ABC transporter related  37.36 
 
 
636 aa  313  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  36.64 
 
 
591 aa  309  2.0000000000000002e-82  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0944  ABC transporter, transmembrane region, type 1  30.24 
 
 
1081 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1641  ABC transporter, transmembrane region, type 1  34.9 
 
 
574 aa  304  8.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1312  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  34.2 
 
 
589 aa  302  2e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743018  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  34.94 
 
 
575 aa  299  2e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  38.33 
 
 
611 aa  297  9e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  38 
 
 
611 aa  294  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  35.54 
 
 
572 aa  294  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  35.54 
 
 
572 aa  294  8e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2098  ABC transporter related  37.13 
 
 
609 aa  294  9e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1665  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.92 
 
 
578 aa  293  1e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0230718  normal  0.637803 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  31.38 
 
 
578 aa  293  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  31.38 
 
 
578 aa  293  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1642  ABC transporter, transmembrane region, type 1  36.76 
 
 
573 aa  293  1e-77  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0216  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.3 
 
 
575 aa  293  2e-77  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0215  multidrug resistance protein 1  28.3 
 
 
575 aa  293  2e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1313  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  36.25 
 
 
573 aa  292  2e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000888271  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.19 
 
 
582 aa  292  3e-77  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  38 
 
 
611 aa  291  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2302  ABC transporter related protein  29.29 
 
 
582 aa  291  4e-77  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.81 
 
 
584 aa  291  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34 
 
 
583 aa  291  7e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0821  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  32.69 
 
 
574 aa  290  1e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.17374  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.85 
 
 
582 aa  290  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.35 
 
 
572 aa  289  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.99 
 
 
577 aa  289  2e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  39.59 
 
 
611 aa  290  2e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  34.49 
 
 
602 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3326  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  41.68 
 
 
600 aa  288  2.9999999999999996e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0160  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.1 
 
 
606 aa  288  4e-76  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  32.26 
 
 
579 aa  288  4e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0822  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.33 
 
 
579 aa  288  5e-76  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00702953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
571 aa  288  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  35.52 
 
 
601 aa  287  7e-76  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
571 aa  287  8e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.6 
 
 
571 aa  287  8e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.6 
 
 
571 aa  287  8e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  35.52 
 
 
601 aa  286  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
571 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.26 
 
 
601 aa  286  2.0000000000000002e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.451102  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0661  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.39 
 
 
573 aa  286  2.0000000000000002e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.177717  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  38.85 
 
 
567 aa  286  2.0000000000000002e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1461  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  34.76 
 
 
605 aa  286  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.6 
 
 
571 aa  286  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.9 
 
 
582 aa  286  2.0000000000000002e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.14 
 
 
555 aa  285  3.0000000000000004e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1787  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydC  33.74 
 
 
582 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.134057  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  38.7 
 
 
567 aa  285  5.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  35.15 
 
 
566 aa  284  7.000000000000001e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.11 
 
 
567 aa  283  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.16 
 
 
578 aa  283  1e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.42 
 
 
571 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  31.13 
 
 
571 aa  283  1e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.42 
 
 
571 aa  283  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1292  ABC transporter, CydDC cysteine exporter (CydDC-E) family, permease/ATP-binding protein CydD  33.16 
 
 
590 aa  283  1e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  33.45 
 
 
572 aa  283  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.42 
 
 
571 aa  283  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  31.96 
 
 
597 aa  282  2e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  33.16 
 
 
603 aa  282  3e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.56 
 
 
582 aa  281  4e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  33.14 
 
 
601 aa  281  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0975  ABC transporter related  34.84 
 
 
585 aa  280  8e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.685046  hitchhiker  0.000181513 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1337  ABC transporter, ATP-binding protein MsbA  33.33 
 
 
599 aa  280  1e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.870575 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1602  ATPase  36.22 
 
 
584 aa  280  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.504525  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  38.6 
 
 
565 aa  280  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.4551 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>