More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0888 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  100 
 
 		 593 aa  1197    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.13 
 
 		 585 aa  436  1e-121  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.71 
 
 		 579 aa  423  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.14 
 
 		 577 aa  416  9.999999999999999e-116  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  37.52 
 
 		 571 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3231  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.54 
 
 		 572 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.659501  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 598 aa  387  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2349  ABC transporter-related protein  35.49 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.73 
 
 		 600 aa  387  1e-106  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3415  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.9 
 
 		 580 aa  388  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.22 
 
 		 583 aa  383  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  36.97 
 
 		 582 aa  384  1e-105  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1959  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.93 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.278742  normal  0.389818 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2577  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.93 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.436168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1469  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.08 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2665  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.93 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.789085  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0367  ABC transporter related  34.85 
 
 		 618 aa  380  1e-104  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0353572 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  382  1e-104  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.89 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1712  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.06 
 
 		 582 aa  380  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1960  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.14 
 
 		 602 aa  377  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.281863  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1433  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 		 582 aa  377  1e-103  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.855683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0845  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.14 
 
 		 580 aa  378  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.814931  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2675  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.08 
 
 		 597 aa  371  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1416  ABC transporter related  34.85 
 
 		 601 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.218265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.71 
 
 		 597 aa  368  1e-100  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01535  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.55 
 
 		 583 aa  367  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.74 
 
 		 581 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2090  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  37.82 
 
 		 583 aa  366  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.121229  normal  0.848171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  36.56 
 
 		 611 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.25 
 
 		 582 aa  363  4e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2208  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.33 
 
 		 582 aa  361  2e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2309  lipid transporter ATP-binding/permease protein  36.44 
 
 		 582 aa  360  6e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.928794  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  35.95 
 
 		 611 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3296  ABC transporter related  34.27 
 
 		 588 aa  360  6e-98  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0774  ABC transporter related  34.98 
 
 		 589 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0921  phospholipid-lipopolysaccharide ABC transporter  36.54 
 
 		 596 aa  358  9.999999999999999e-98  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.81 
 
 		 582 aa  358  9.999999999999999e-98  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.2758  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  35.76 
 
 		 611 aa  358  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  36.99 
 
 		 584 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1094  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  36.54 
 
 		 588 aa  357  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0900  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.49 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0510675  normal  0.909726 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  35.78 
 
 		 611 aa  355  8.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0627  ABC transporter related  34.28 
 
 		 627 aa  355  1e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  39.69 
 
 		 556 aa  355  1e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003987  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  34.55 
 
 		 582 aa  353  4e-96  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.91 
 
 		 578 aa  352  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.91 
 
 		 578 aa  352  8e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  33.73 
 
 		 584 aa  352  8e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.55 
 
 		 571 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4442  ABC transporter related  37.13 
 
 		 595 aa  351  2e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.601236 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.47 
 
 		 587 aa  351  3e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  35.94 
 
 		 579 aa  350  4e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.38 
 
 		 571 aa  349  8e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  34.38 
 
 		 571 aa  349  8e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.38 
 
 		 571 aa  349  8e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  34.73 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.55 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1342  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.09 
 
 		 588 aa  348  1e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  36.27 
 
 		 579 aa  348  1e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4128  ABC transporter related  36.95 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  33.97 
 
 		 671 aa  347  2e-94  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.38 
 
 		 571 aa  348  2e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  32.53 
 
 		 586 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2348  ABC transporter related protein  37.11 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0317134  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.38 
 
 		 571 aa  347  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5011  ABC transporter related  34.56 
 
 		 601 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.73 
 
 		 598 aa  347  4e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  34.21 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.21 
 
 		 571 aa  345  1e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.31 
 
 		 587 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  35.66 
 
 		 598 aa  345  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1331  ABC transporter related  33.57 
 
 		 609 aa  344  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.134992  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 586 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  32.18 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.18 
 
 		 586 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 		 586 aa  343  5e-93  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.83 
 
 		 586 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11248  ABC transporter, ATP-binding protein  38.42 
 
 		 566 aa  343  7e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.18 
 
 		 586 aa  342  8e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3370  ABC transporter related  33.68 
 
 		 601 aa  342  1e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3848  ABC transporter related  34.4 
 
 		 585 aa  342  1e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.135668  normal  0.677159 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  32.01 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  32.01 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2803  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.15 
 
 		 589 aa  341  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1246  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.1 
 
 		 606 aa  340  2.9999999999999998e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.69 
 
 		 591 aa  340  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1141  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.25 
 
 		 586 aa  340  5e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>