More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16410 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  57.02 
 
 		 611 aa  679    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 		 671 aa  1381    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  43.01 
 
 		 623 aa  456  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  39.04 
 
 		 632 aa  451  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  39.47 
 
 		 628 aa  442  1e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  38.27 
 
 		 642 aa  429  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  37.71 
 
 		 638 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  37.98 
 
 		 648 aa  430  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 628 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  40.21 
 
 		 593 aa  426  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  36.38 
 
 		 641 aa  427  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  37.6 
 
 		 687 aa  428  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.86 
 
 		 622 aa  422  1e-117  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 642 aa  424  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 640 aa  421  1e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  38.61 
 
 		 594 aa  421  1e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  37.62 
 
 		 648 aa  421  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  37.85 
 
 		 658 aa  418  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  38.09 
 
 		 622 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  36.56 
 
 		 639 aa  413  1e-114  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  38.17 
 
 		 638 aa  409  1e-113  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  37.58 
 
 		 658 aa  411  1e-113  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.94 
 
 		 634 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  37.9 
 
 		 638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  37.19 
 
 		 626 aa  409  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.02 
 
 		 627 aa  405  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  37.32 
 
 		 613 aa  400  9.999999999999999e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  35.66 
 
 		 636 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  36.62 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  36.27 
 
 		 637 aa  400  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  36.62 
 
 		 627 aa  400  9.999999999999999e-111  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  38.1 
 
 		 613 aa  399  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  36.81 
 
 		 622 aa  399  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  38.4 
 
 		 640 aa  393  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  35.97 
 
 		 632 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  36.62 
 
 		 624 aa  394  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  36.68 
 
 		 635 aa  392  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  34.39 
 
 		 654 aa  389  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.22 
 
 		 614 aa  382  1e-105  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36 
 
 		 598 aa  384  1e-105  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  35.96 
 
 		 635 aa  383  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  35.3 
 
 		 624 aa  384  1e-105  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.41 
 
 		 627 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  34.92 
 
 		 631 aa  379  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  34.84 
 
 		 637 aa  380  1e-104  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  36.15 
 
 		 663 aa  380  1e-104  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  36.33 
 
 		 659 aa  379  1e-104  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  35.76 
 
 		 648 aa  377  1e-103  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  34.63 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  35.79 
 
 		 627 aa  375  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.6 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34.98 
 
 		 586 aa  368  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  35.56 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  35.56 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.6 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.43 
 
 		 586 aa  365  1e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.26 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.81 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.26 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  36.12 
 
 		 632 aa  364  3e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.26 
 
 		 586 aa  362  1e-98  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.09 
 
 		 586 aa  362  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  36.24 
 
 		 626 aa  362  2e-98  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  34.25 
 
 		 605 aa  360  3e-98  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.47 
 
 		 586 aa  360  6e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  33.97 
 
 		 593 aa  357  3.9999999999999996e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.33 
 
 		 598 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.59 
 
 		 578 aa  354  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 598 aa  354  4e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  34.49 
 
 		 579 aa  353  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  33.96 
 
 		 620 aa  353  8e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  32.77 
 
 		 598 aa  351  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  33.95 
 
 		 597 aa  351  3e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  38.15 
 
 		 607 aa  350  3e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  34.55 
 
 		 598 aa  350  7e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.5 
 
 		 598 aa  349  9e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  36.47 
 
 		 593 aa  349  9e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2260  ABC transporter ATP-binding protein  35.49 
 
 		 571 aa  349  1e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  34.59 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  34.13 
 
 		 584 aa  348  2e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  33.79 
 
 		 597 aa  346  6e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  33.79 
 
 		 597 aa  346  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1885  ABC transporter related protein  34.66 
 
 		 618 aa  344  2.9999999999999997e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  32.83 
 
 		 631 aa  343  5.999999999999999e-93  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  33.05 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  33.33 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.5 
 
 		 598 aa  342  2e-92  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.33 
 
 		 598 aa  341  2e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  34.78 
 
 		 589 aa  340  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  33.5 
 
 		 586 aa  340  5.9999999999999996e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.16 
 
 		 598 aa  339  8e-92  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1385  ABC transporter related  36.15 
 
 		 600 aa  336  9e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0831464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  35.8 
 
 		 589 aa  336  1e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0289  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  34.13 
 
 		 600 aa  335  2e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  33.5 
 
 		 622 aa  335  2e-90  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  33.9 
 
 		 606 aa  335  2e-90  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  35.27 
 
 		 620 aa  335  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  35.4 
 
 		 556 aa  335  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3262  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter related  35.29 
 
 		 764 aa  334  3e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>