More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5131 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  69.18 
 
 		 637 aa  774    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  60.34 
 
 		 624 aa  644    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  70.57 
 
 		 631 aa  779    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  56.44 
 
 		 627 aa  639    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  60.27 
 
 		 687 aa  678    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  65.31 
 
 		 642 aa  716    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  62.18 
 
 		 658 aa  687    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  65.71 
 
 		 632 aa  743    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  61.27 
 
 		 638 aa  696    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  69.97 
 
 		 638 aa  779    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  66.83 
 
 		 614 aa  774    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  68 
 
 		 622 aa  779    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  59.6 
 
 		 641 aa  669    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  60.33 
 
 		 642 aa  654    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  72.11 
 
 		 654 aa  812    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  69.26 
 
 		 627 aa  786    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  100 
 
 		 648 aa  1256    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  77.56 
 
 		 622 aa  921    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  67.44 
 
 		 620 aa  744    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  68.64 
 
 		 637 aa  796    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  60.39 
 
 		 648 aa  660    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  62.27 
 
 		 640 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  70.56 
 
 		 632 aa  734    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  69.26 
 
 		 627 aa  786    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  68.47 
 
 		 663 aa  736    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  72.77 
 
 		 628 aa  828    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  69.54 
 
 		 626 aa  792    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  69.39 
 
 		 659 aa  759    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  61.53 
 
 		 658 aa  681    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  69.34 
 
 		 640 aa  768    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  72.11 
 
 		 627 aa  801    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  61.76 
 
 		 636 aa  693    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  58.75 
 
 		 632 aa  631  1e-179  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.3 
 
 		 634 aa  625  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  57.12 
 
 		 622 aa  624  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  57.64 
 
 		 639 aa  618  1e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  58.82 
 
 		 627 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  56.29 
 
 		 635 aa  601  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  55.65 
 
 		 624 aa  586  1e-166  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  53.48 
 
 		 631 aa  585  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  51.38 
 
 		 638 aa  552  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  46.48 
 
 		 628 aa  509  1e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  43.75 
 
 		 648 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  43.89 
 
 		 626 aa  463  1e-129  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 594 aa  409  1e-113  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  38.05 
 
 		 623 aa  393  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  39.17 
 
 		 593 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  35.76 
 
 		 671 aa  389  1e-106  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  41.3 
 
 		 613 aa  381  1e-104  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  39.46 
 
 		 635 aa  382  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  40.03 
 
 		 607 aa  372  1e-102  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  39.32 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.74 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  37.48 
 
 		 589 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  36.14 
 
 		 598 aa  350  4e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.45 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.45 
 
 		 586 aa  350  6e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.67 
 
 		 586 aa  349  9e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  34.45 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.45 
 
 		 586 aa  349  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.45 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  34.29 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.29 
 
 		 586 aa  348  2e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.12 
 
 		 586 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.47 
 
 		 571 aa  346  8e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  33 
 
 		 611 aa  346  8e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  34 
 
 		 586 aa  345  1e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  31.13 
 
 		 571 aa  344  4e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 571 aa  344  4e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.13 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  31.13 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.13 
 
 		 571 aa  343  5.999999999999999e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.96 
 
 		 571 aa  342  2e-92  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.96 
 
 		 571 aa  341  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  30.96 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.8 
 
 		 571 aa  336  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.72 
 
 		 577 aa  336  9e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  37.39 
 
 		 601 aa  335  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0888  ABC transporter related  30.96 
 
 		 593 aa  334  3e-90  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.315462  hitchhiker  0.00000912514 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3530  ABC transporter, ATP-binding/permease  33.68 
 
 		 590 aa  332  2e-89  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  31.81 
 
 		 597 aa  332  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  31.81 
 
 		 597 aa  331  3e-89  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2041  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.9 
 
 		 582 aa  330  6e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  32.32 
 
 		 598 aa  329  1.0000000000000001e-88  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00918  fused lipid transporter subunits of ABC superfamily: membrane component/ATP-binding component  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.409137  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2729  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1769  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.07 
 
 		 597 aa  328  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.631617  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2682  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.316458 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1075  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.220185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1021  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0261521  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  32.45 
 
 		 572 aa  328  3e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2410  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2206  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0719842  normal  0.317534 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00925  hypothetical protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.433065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1012  lipid transporter ATP-binding/permease protein  35.06 
 
 		 582 aa  327  3e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00350049  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1082  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.78 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123674  normal  0.113361 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1098  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.78 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.687379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1017  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.78 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.71873 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0990  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.78 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.796284  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1049  lipid transporter ATP-binding/permease protein  34.78 
 
 		 582 aa  326  6e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.183717 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>