More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0132 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  59.35 
 
 		 594 aa  648    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6875  hypothetical protein  60.24 
 
 		 593 aa  655    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0777  ABC transporter related  75.47 
 
 		 635 aa  838    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.193136  normal  0.304338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0132  ABC transporter related protein  100 
 
 		 613 aa  1183    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02880  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  65.47 
 
 		 613 aa  714    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09820  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  56.06 
 
 		 626 aa  595  1e-169  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.23172  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4487  ABC transporter related  58.41 
 
 		 607 aa  578  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0324743  normal  0.0684867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2208  ABC transporter related  55.48 
 
 		 589 aa  559  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0484971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1283  ABC transporter related protein  50.09 
 
 		 623 aa  541  1e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3782  hypothetical protein  52.98 
 
 		 593 aa  544  1e-153  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.245916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  41.36 
 
 		 628 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20180  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.72 
 
 		 634 aa  413  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.28848 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  40.43 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  38.1 
 
 		 671 aa  406  1.0000000000000001e-112  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04210  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.49 
 
 		 614 aa  407  1.0000000000000001e-112  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2299  ABC transporter related  38.53 
 
 		 611 aa  402  1e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000426406  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1517  ABC transporter related protein  43.24 
 
 		 624 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.983922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2277  ABC transporter related  40.37 
 
 		 638 aa  398  1e-109  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  40.55 
 
 		 632 aa  395  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1518  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 635 aa  397  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.529204  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1416  ABC-transporter protein  37.56 
 
 		 648 aa  399  1e-109  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.198119  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0187  ABC transporter related protein  42.4 
 
 		 632 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00176102 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  41.79 
 
 		 640 aa  394  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4759  ABC transporter related  40.78 
 
 		 642 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  41.77 
 
 		 622 aa  390  1e-107  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  42.9 
 
 		 639 aa  390  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3765  ABC transporter related protein  39.84 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3402  ABC transporter related protein  40.17 
 
 		 622 aa  384  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5131  ABC transporter related  41.19 
 
 		 648 aa  384  1e-105  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1142  ABC transporter related  39.4 
 
 		 648 aa  383  1e-105  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0578394 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  40.1 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3298  ABC transporter related  40.82 
 
 		 658 aa  381  1e-104  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106307  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1676  ABC transporter related  40.61 
 
 		 641 aa  381  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.322808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1813  ABC transporter related  43.19 
 
 		 620 aa  382  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.163963  normal  0.0890628 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  40.33 
 
 		 627 aa  375  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3071  ABC transporter related  41.33 
 
 		 658 aa  374  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4902  ABC transporter related protein  39.6 
 
 		 628 aa  369  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2209  ABC transporter related  39.59 
 
 		 687 aa  370  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.472222 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2241  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 642 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0105803  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2462  ABC transporter related  38.61 
 
 		 638 aa  365  1e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.075214  normal  0.19006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.95 
 
 		 598 aa  362  8e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4406  ABC transporter related protein  42.14 
 
 		 640 aa  362  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.601028  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2565  ABC transporter related  41.11 
 
 		 627 aa  362  1e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333198  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  39.77 
 
 		 626 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1746  ABC transporter related  39.86 
 
 		 659 aa  358  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5007  ABC transporter-related protein  41.94 
 
 		 663 aa  354  2e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.964249  normal  0.607617 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4828  ABC transporter related  37.54 
 
 		 626 aa  354  2e-96  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.509818  normal  0.396949 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  40.9 
 
 		 567 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  37.24 
 
 		 584 aa  353  5e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1231  ABC transporter related  38.27 
 
 		 631 aa  352  8e-96  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.127011 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  40.72 
 
 		 567 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  32.16 
 
 		 597 aa  352  8.999999999999999e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5326  ABC transporter related  39.22 
 
 		 654 aa  352  8.999999999999999e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1305  ABC transporter related  39.07 
 
 		 638 aa  352  1e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0807  ABC transporter related  38.42 
 
 		 637 aa  351  2e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.885292  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  33.56 
 
 		 584 aa  350  5e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  34 
 
 		 598 aa  348  2e-94  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0424  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38.47 
 
 		 627 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  34.23 
 
 		 602 aa  348  2e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5969  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 624 aa  347  3e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.350074  normal  0.190223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  35.47 
 
 		 587 aa  347  3e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  40.07 
 
 		 601 aa  347  5e-94  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4446  ABC transporter related  37.39 
 
 		 627 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405491  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4533  ABC transporter related  37.39 
 
 		 627 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.450664  normal  0.615478 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.53 
 
 		 597 aa  346  7e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.53 
 
 		 597 aa  346  8e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0924  ABC transporter related  39.73 
 
 		 637 aa  345  8.999999999999999e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  39.06 
 
 		 610 aa  345  1e-93  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  33.84 
 
 		 617 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.39 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  33.39 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  33.39 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2070  ABC transporter related protein  41.21 
 
 		 632 aa  342  1e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.190367 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  33.39 
 
 		 571 aa  342  1e-92  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  342  2e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.22 
 
 		 571 aa  341  2e-92  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2703  ABC transporter-related protein  41.43 
 
 		 611 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  37.44 
 
 		 591 aa  340  2.9999999999999998e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  36.91 
 
 		 568 aa  341  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2798  ABC transporter related  41.04 
 
 		 611 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  37.67 
 
 		 582 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  37.5 
 
 		 582 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  33.05 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  33.05 
 
 		 571 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  32.53 
 
 		 571 aa  335  1e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  36.44 
 
 		 597 aa  335  1e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.95 
 
 		 585 aa  334  3e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  39.3 
 
 		 567 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  30.84 
 
 		 597 aa  333  5e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 		 586 aa  333  6e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2617  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  40.35 
 
 		 611 aa  332  9e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00654185  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  35.58 
 
 		 600 aa  332  1e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  31.72 
 
 		 586 aa  332  1e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1697  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  38.53 
 
 		 631 aa  331  2e-89  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.37 
 
 		 586 aa  330  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2584  ABC transporter related  38.4 
 
 		 611 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.784039  normal  0.174103 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  33.98 
 
 		 572 aa  330  4e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  36.64 
 
 		 614 aa  330  5.0000000000000004e-89  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  31.72 
 
 		 586 aa  330  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>