More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2278 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.2 
 
 		 571 aa  752    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.2 
 
 		 571 aa  754    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0981  ABC transporter related  64.35 
 
 		 576 aa  759    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  63.03 
 
 		 571 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  63.2 
 
 		 571 aa  750    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  63.38 
 
 		 571 aa  754    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2278  ABC transporter related  100 
 
 		 582 aa  1159    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.682256  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  63.38 
 
 		 571 aa  754    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3932  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  70.19 
 
 		 567 aa  768    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130383  normal  0.874644 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2389  ABC transporter, permease protein/ATP-binding protein  64.79 
 
 		 572 aa  774    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000145644  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2189  ABC transporter related protein  65.14 
 
 		 572 aa  783    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.480877  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3334  ABC transporter related  70.3 
 
 		 584 aa  805    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.3583  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2487  ABC transporter related  64.96 
 
 		 572 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.461616  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1954  ABC transporter related  94.33 
 
 		 610 aa  1093    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3081  ABC multidrug efflux transporter, fused ATPase and inner membrane subunits  70.37 
 
 		 567 aa  804    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  63.2 
 
 		 571 aa  750    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.38 
 
 		 571 aa  752    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4405  ABC transporter related  70.77 
 
 		 568 aa  825    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.292842 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  65.85 
 
 		 572 aa  793    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  63.38 
 
 		 571 aa  754    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  62.85 
 
 		 571 aa  748    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1674  ABC transporter permease/ATP-binding protein  64.96 
 
 		 572 aa  777    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0264422  normal  0.294375 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1143  ABC transporter related  68.26 
 
 		 565 aa  750    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.4551 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4200  ABC transporter related  71.63 
 
 		 566 aa  810    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.737412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1306  ABC transporter related  83.8 
 
 		 582 aa  931    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2001  ABC transporter related  99.14 
 
 		 582 aa  1149    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.201401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3808  ABC transporter related  70.55 
 
 		 567 aa  805    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0584709  normal  0.445528 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1811  ABC transporter related  53.86 
 
 		 572 aa  605  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00064367  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3351  ABC transporter related  44.06 
 
 		 579 aa  522  1e-147  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.773989  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  44.7 
 
 		 580 aa  524  1e-147  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2580  ABC transporter, ATP-binding protein/permease protein  43.36 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2282  putative ABC transporter ATP-binding protein  43.19 
 
 		 566 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2006  ABC transporter related  48.95 
 
 		 575 aa  499  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.823185  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2264  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  42.78 
 
 		 596 aa  494  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.828033  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0337  ABC transporter related  44.27 
 
 		 582 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1363  ABC transporter related  44.96 
 
 		 636 aa  489  1e-137  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000676834  normal  0.402453 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2225  ABC transporter related  48.25 
 
 		 612 aa  485  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.164174  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0028  ABC transporter related  41.64 
 
 		 615 aa  445  1.0000000000000001e-124  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21520  ABC transporter related  48.26 
 
 		 468 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0552  ABC transporter related  40.65 
 
 		 589 aa  424  1e-117  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2998  ABC transporter related protein  39.69 
 
 		 575 aa  404  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000215819  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.56 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2616  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  39.72 
 
 		 577 aa  388  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0639798  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0235  ABC transporter related protein  38.17 
 
 		 577 aa  382  1e-105  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2109  ATPase  37.52 
 
 		 591 aa  375  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.265654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 598 aa  371  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  40.28 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1954  ABC transporter related  36.38 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1920  ABC transporter related  36.38 
 
 		 578 aa  367  1e-100  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  36.54 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  38.18 
 
 		 597 aa  365  1e-99  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  41.94 
 
 		 620 aa  363  6e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36.85 
 
 		 586 aa  362  7.0000000000000005e-99  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0466  ABC transporter related  40.63 
 
 		 588 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1216  ABC transporter related  37.87 
 
 		 597 aa  362  1e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.791805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2836  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  37.59 
 
 		 585 aa  361  2e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.333651  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5646  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 596 aa  358  9.999999999999999e-98  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 586 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.88 
 
 		 586 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.71 
 
 		 586 aa  355  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.54 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.54 
 
 		 586 aa  354  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3174  ABC transporter related  36.64 
 
 		 601 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3017  ABC transporter, transmembrane region  36.08 
 
 		 602 aa  353  4e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0138128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 		 586 aa  353  4e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2944  ABC transporter related  36.47 
 
 		 601 aa  353  4e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.631806 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0417  ABC transporter related  36.95 
 
 		 660 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1403  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.42 
 
 		 578 aa  352  8e-96  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3501  ABC transporter related  38.7 
 
 		 575 aa  352  8.999999999999999e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  36.36 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  36.36 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  36.36 
 
 		 586 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3398  ABC transporter related  36.67 
 
 		 598 aa  352  1e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  38.98 
 
 		 601 aa  350  3e-95  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1262  ABC transporter related  36.06 
 
 		 644 aa  351  3e-95  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  36.63 
 
 		 598 aa  350  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2719  ABC transporter related  36.71 
 
 		 606 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  36.74 
 
 		 617 aa  348  1e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2499  ABC transporter transmembrane region  36.19 
 
 		 601 aa  348  1e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0247  ABC transporter related  38.89 
 
 		 586 aa  347  3e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.306695  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3025  ABC transporter related  35.56 
 
 		 582 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1071  ABC transporter related protein  38.88 
 
 		 733 aa  345  1e-93  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1259  ATP-binding transport protein; multicopy suppressor of HtrB  36.89 
 
 		 579 aa  345  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4432  ABC transporter related  35.67 
 
 		 601 aa  344  2e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0450  ABC transporter-related protein  35.51 
 
 		 586 aa  344  2e-93  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.98 
 
 		 556 aa  345  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4790  ABC transporter related  39.34 
 
 		 550 aa  344  2.9999999999999997e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.187036  normal  0.356857 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  37.29 
 
 		 594 aa  343  4e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  35.6 
 
 		 597 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  37.66 
 
 		 652 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8742  carbohydrate ABC transporter  39.07 
 
 		 669 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4426  ABC transporter related  36.04 
 
 		 603 aa  340  4e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.368028  normal  0.0987215 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  35.43 
 
 		 597 aa  340  5e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0082  ATPase  39.76 
 
 		 582 aa  339  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2622  ABC transporter transmembrane region  37.88 
 
 		 606 aa  339  8e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.499231  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  36.93 
 
 		 671 aa  338  9.999999999999999e-92  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0825  ABC transporter related  36.05 
 
 		 575 aa  338  1.9999999999999998e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  35.46 
 
 		 598 aa  338  1.9999999999999998e-91  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2419  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.66 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.736336 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1371  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  38 
 
 		 587 aa  337  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680862  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>