More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HMPREF0424_1249 on replicon NC_013721
Organism: Gardnerella vaginalis 409-05



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1249  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 598 aa  1227    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00159778 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1540  multidrug ABC transporter ATPase/permease  71.14 
 
 		 602 aa  904    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.652681  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  48.98 
 
 		 592 aa  593  1e-168  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3782  ABC transporter related  47.55 
 
 		 594 aa  561  1e-158  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.91836  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  43.95 
 
 		 597 aa  523  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  44.37 
 
 		 597 aa  510  1e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0017  ABC transporter related  43.97 
 
 		 593 aa  490  1e-137  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2282  ABC transporter related  42.18 
 
 		 609 aa  480  1e-134  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  42.48 
 
 		 589 aa  478  1e-133  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  42.33 
 
 		 608 aa  468  9.999999999999999e-131  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  42.56 
 
 		 614 aa  455  1.0000000000000001e-126  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0048  ABC transporter related  38.37 
 
 		 598 aa  449  1e-125  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000163685  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 594 aa  424  1e-117  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  39.02 
 
 		 617 aa  424  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1455  ABC transporter related  41.39 
 
 		 625 aa  414  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2475  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.15 
 
 		 598 aa  405  1e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00961334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2921  ABC transporter related protein  38.3 
 
 		 636 aa  403  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.5 
 
 		 617 aa  402  1e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2539  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.5 
 
 		 598 aa  404  1e-111  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2460  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.01 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2401  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.33 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2276  ABC transporter ATP-binding/permease  38.01 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.406907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2236  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.01 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0563945  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2193  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  38.01 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0325354  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2444  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.01 
 
 		 598 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.290529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2932  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  37.04 
 
 		 598 aa  401  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00230756 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0949  ABC transporter related  39.71 
 
 		 625 aa  398  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  37.18 
 
 		 590 aa  394  1e-108  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  36.25 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0841  ABC transporter related  38.08 
 
 		 607 aa  392  1e-108  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  36.41 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  37.88 
 
 		 600 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  37.04 
 
 		 623 aa  390  1e-107  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2250  ABC transporter related  37.98 
 
 		 598 aa  392  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0582239  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1001  ABC transporter related protein  35.79 
 
 		 598 aa  386  1e-106  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.710389  normal  0.620497 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  39.15 
 
 		 594 aa  385  1e-106  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.48 
 
 		 622 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.02 
 
 		 592 aa  388  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  37.52 
 
 		 620 aa  386  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 600 aa  383  1e-105  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.46 
 
 		 609 aa  385  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  35.22 
 
 		 671 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.61 
 
 		 611 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1782  ABC transporter-related protein  37.11 
 
 		 605 aa  381  1e-104  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.563719  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  33.65 
 
 		 635 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0642  ABC transporter related  39.21 
 
 		 620 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.014004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  38.79 
 
 		 587 aa  378  1e-103  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1520  ABC transporter related  37.67 
 
 		 597 aa  377  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.887648  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  38.69 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2471  ABC transporter related protein  36.33 
 
 		 600 aa  374  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  38.69 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  34.83 
 
 		 591 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0544  ABC transporter related  38.2 
 
 		 587 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  38.62 
 
 		 587 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.39 
 
 		 607 aa  372  1e-102  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  35.27 
 
 		 589 aa  374  1e-102  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0133  ABC transporter, transmembrane region  36.24 
 
 		 613 aa  374  1e-102  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.260657  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38.69 
 
 		 587 aa  373  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 587 aa  372  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1896  ABC transporter related  38.51 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.332587  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  38.17 
 
 		 587 aa  372  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  36.16 
 
 		 586 aa  371  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  35.84 
 
 		 584 aa  369  1e-101  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  38.17 
 
 		 587 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  34.73 
 
 		 586 aa  367  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0337  ABC transporter related  35.06 
 
 		 628 aa  368  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.939408  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  38 
 
 		 587 aa  367  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7144  ABC transporter related  35.8 
 
 		 632 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0737  ABC transporter related  38.67 
 
 		 652 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  35.19 
 
 		 611 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.68 
 
 		 613 aa  365  1e-99  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.58 
 
 		 609 aa  364  2e-99  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.78 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.43 
 
 		 586 aa  364  2e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.78 
 
 		 586 aa  365  2e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  37.74 
 
 		 556 aa  364  2e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0684  ABC transporter related  35.31 
 
 		 598 aa  364  2e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000210902  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  35.6 
 
 		 586 aa  364  3e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2528  ABC transporter related  37.5 
 
 		 580 aa  364  3e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000757065  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  33.72 
 
 		 610 aa  363  4e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  35.6 
 
 		 586 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.6 
 
 		 586 aa  363  6e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  37.84 
 
 		 598 aa  363  7.0000000000000005e-99  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  36.58 
 
 		 586 aa  362  7.0000000000000005e-99  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.8 
 
 		 571 aa  362  8e-99  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1080  ABC transporter related  36.74 
 
 		 601 aa  362  8e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  39.24 
 
 		 587 aa  362  1e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  35.6 
 
 		 631 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.63 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0435  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  35.43 
 
 		 586 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.290198  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  35.63 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  36.74 
 
 		 594 aa  361  2e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  40.9 
 
 		 650 aa  361  2e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.63 
 
 		 571 aa  361  2e-98  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  35.13 
 
 		 637 aa  360  3e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  35.25 
 
 		 586 aa  360  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1313  ABC transporter related protein  36.05 
 
 		 594 aa  360  3e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2690  multidrug resistance ABC transporter  34.85 
 
 		 615 aa  360  4e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0586583  normal  0.13127 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0475  ABC transporter related  37.73 
 
 		 584 aa  360  4e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00181463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>